Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G172100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PMG5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G256400 expressed protein K15326: tRNA-splicing endonuclease subunit Sen54
2 Sobic.001G059001 - -
3 Sobic.005G137500 - -
4 Sobic.001G190700 pleiotropic drug resistance protein 3, putative, expressed -
5 Sobic.004G193350 - -
6 Sobic.002G216300 - -
7 Sobic.003G375400 - -
8 Sobic.009G153366 - -
9 Sobic.010G183350 - -
10 Sobic.009G046300 - -
11 Sobic.009G175800 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
12 Sobic.009G064300 cytokinin-O-glucosyltransferase 1, putative, expressed -
13 Sobic.008G047150 - -
14 Sobic.002G324801 - -
15 Sobic.010G133450 - -
16 Sobic.004G206600 osFTL5 FT-Like5 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
17 Sobic.001G513200 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K14407: CSTF2, cleavage stimulation factor subunit 2
18 Sobic.003G016950 - -
19 Sobic.009G094200 - -
20 Sobic.005G150501 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G172100 Sobic006G172100 Sobic002G256400 Sobic002G256400 Sobic006G172100--Sobic002G256400 Sobic001G059001 Sobic001G059001 Sobic006G172100--Sobic001G059001 Sobic005G137500 Sobic005G137500 Sobic006G172100--Sobic005G137500 Sobic001G190700 Sobic001G190700 Sobic006G172100--Sobic001G190700 Sobic004G193350 Sobic004G193350 Sobic006G172100--Sobic004G193350 Sobic002G216300 Sobic002G216300 Sobic006G172100--Sobic002G216300 Sobic003G375400 Sobic003G375400 Sobic006G172100--Sobic003G375400 Sobic009G153366 Sobic009G153366 Sobic006G172100--Sobic009G153366 Sobic010G183350 Sobic010G183350 Sobic006G172100--Sobic010G183350 Sobic002G256400--Sobic006G172100 Sobic002G256400--Sobic001G190700 Sobic002G256400--Sobic001G059001 Sobic001G513200 Sobic001G513200 Sobic002G256400--Sobic001G513200 Sobic004G337975 Sobic004G337975 Sobic002G256400--Sobic004G337975 Sobic010G265100 Sobic010G265100 Sobic002G256400--Sobic010G265100 Sobic003G271000 Sobic003G271000 Sobic002G256400--Sobic003G271000 Sobic009G109600 Sobic009G109600 Sobic002G256400--Sobic009G109600 Sobic006G233400 Sobic006G233400 Sobic002G256400--Sobic006G233400 Sobic009G064300 Sobic009G064300 Sobic001G059001--Sobic009G064300 Sobic001G059001--Sobic005G137500 Sobic001G190900 Sobic001G190900 Sobic001G059001--Sobic001G190900 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic001G059001--Sobic003G312900 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic001G059001--Sobic003G312800 Sobic005G152866 Sobic005G152866 Sobic001G059001--Sobic005G152866 Sobic008G072800 Sobic008G072800 Sobic001G059001--Sobic008G072800 Sobic002G012100 Sobic002G012100 Sobic001G059001--Sobic002G012100 Sobic001G059001--Sobic010G183350 Sobic005G137500--Sobic010G183350 Sobic005G137500--Sobic001G059001 Sobic005G137500--Sobic004G193350 Sobic005G137500--Sobic009G064300 Sobic005G137500--Sobic002G012100 Sobic001G476600 Sobic001G476600 Sobic005G137500--Sobic001G476600 Sobic005G137500--Sobic005G152866 Sobic006G268900 Sobic006G268900 Sobic005G137500--Sobic006G268900 Sobic005G137500--Sobic003G312800 Sobic001G190700--Sobic001G513200 Sobic001G190700--Sobic002G256400 Sobic001G190700--Sobic001G059001 Sobic002G076350 Sobic002G076350 Sobic001G190700--Sobic002G076350 Sobic001G190700--Sobic004G337975 Sobic001G190700--Sobic006G172100 Sobic006G048400 Sobic006G048400 Sobic001G190700--Sobic006G048400 Sobic010G133450 Sobic010G133450 Sobic001G190700--Sobic010G133450 Sobic001G190700--Sobic009G109600 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic004G193350--Sobic002G159750 Sobic003G238750 Sobic003G238750 Sobic004G193350--Sobic003G238750 Sobic004G322650 Sobic004G322650 Sobic004G193350--Sobic004G322650 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic004G193350--Sobic001G476800 Sobic004G193350--Sobic005G137500 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic004G193350--Sobic008G171200 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic004G193350--Sobic010G175550 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic004G193350--Sobic003G286450 Sobic003G016950 Sobic003G016950 Sobic004G193350--Sobic003G016950 Sobic002G216300--Sobic009G153366 Sobic009G046300 Sobic009G046300 Sobic002G216300--Sobic009G046300 Sobic002G216300--Sobic006G172100 Sobic009G175800 Sobic009G175800 Sobic002G216300--Sobic009G175800 Sobic010G257200 Sobic010G257200 Sobic002G216300--Sobic010G257200 Sobic004G242800 Sobic004G242800 Sobic002G216300--Sobic004G242800 Sobic002G216300--Sobic005G137500 Sobic006G130100 Sobic006G130100 Sobic002G216300--Sobic006G130100 Sobic004G082600 Sobic004G082600 Sobic002G216300--Sobic004G082600 Sobic009G236900 Sobic009G236900 Sobic003G375400--Sobic009G236900 Sobic003G050100 Sobic003G050100 Sobic003G375400--Sobic003G050100 Sobic003G330350 Sobic003G330350 Sobic003G375400--Sobic003G330350 Sobic003G375400--Sobic004G193350 Sobic001G270800 Sobic001G270800 Sobic003G375400--Sobic001G270800 Sobic003G375400--Sobic004G322650 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic003G375400--Sobic003G160433 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic003G375400--Sobic006G131700 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic003G375400--Sobic003G160300 Sobic009G153366--Sobic009G046300 Sobic009G153366--Sobic002G216300 Sobic009G153366--Sobic006G172100 Sobic009G153366--Sobic002G256400 Sobic006G198200 Sobic006G198200 Sobic009G153366--Sobic006G198200 Sobic009G153366--Sobic010G257200 Sobic009G153366--Sobic001G190700 Sobic006G029900 Sobic006G029900 Sobic009G153366--Sobic006G029900 Sobic009G240300 Sobic009G240300 Sobic009G153366--Sobic009G240300 Sobic003G375500 Sobic003G375500 Sobic010G183350--Sobic003G375500 Sobic003G401700 Sobic003G401700 Sobic010G183350--Sobic003G401700 Sobic009G026700 Sobic009G026700 Sobic010G183350--Sobic009G026700 Sobic010G183350--Sobic003G312800 Sobic010G183350--Sobic005G137500 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic010G183350--Sobic009G074800 Sobic003G124400 Sobic003G124400 Sobic010G183350--Sobic003G124400 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic010G183350--Sobic001G250750 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic010G183350--Sobic002G009000
Octagon: transcription factors


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