Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G513200.1
Synonym CSTF64, Sb01g047890
Functional annotation "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence." (PubMedID : 27586543)
RNA recognition motif containing protein, putative, expressed
UniProt Q1KSA6 , A0A1Z5SBI2
Pfam PF00076
Panther DB PTHR23139 PTHR23139:SF8
NCBI CDD KOG0114; Predicted RNA-binding protein (RRM superfamily)
KEGG Orthology K14407; CSTF2, cleavage stimulation factor subunit 2
Gene Ontology GO:0003676; nucleic acid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G71800 : cleavage stimulating factor 64
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g13999.1 : RNA recognition motif containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic001G513200 Sobic001G513200 Sobic001G190700 Sobic001G190700 Sobic001G513200--Sobic001G190700 Sobic008G047150 Sobic008G047150 Sobic001G513200--Sobic008G047150 Sobic001G059001 Sobic001G059001 Sobic001G513200--Sobic001G059001 Sobic002G256400 Sobic002G256400 Sobic001G513200--Sobic002G256400 Sobic002G076350 Sobic002G076350 Sobic001G513200--Sobic002G076350 Sobic009G064300 Sobic009G064300 Sobic001G513200--Sobic009G064300 Sobic006G172100 Sobic006G172100 Sobic001G513200--Sobic006G172100 Sobic008G067000 Sobic008G067000 Sobic001G513200--Sobic008G067000 Sobic002G181500 Sobic002G181500 Sobic001G513200--Sobic002G181500 Sobic001G190700--Sobic001G513200 Sobic001G190700--Sobic002G256400 Sobic001G190700--Sobic001G059001 Sobic001G190700--Sobic002G076350 Sobic004G337975 Sobic004G337975 Sobic001G190700--Sobic004G337975 Sobic001G190700--Sobic006G172100 Sobic006G048400 Sobic006G048400 Sobic001G190700--Sobic006G048400 Sobic010G133450 Sobic010G133450 Sobic001G190700--Sobic010G133450 Sobic009G109600 Sobic009G109600 Sobic001G190700--Sobic009G109600 Sobic008G047150--Sobic001G059001 Sobic005G137500 Sobic005G137500 Sobic008G047150--Sobic005G137500 Sobic005G152866 Sobic005G152866 Sobic008G047150--Sobic005G152866 Sobic008G047150--Sobic001G513200 Sobic008G047150--Sobic008G067000 Sobic010G183350 Sobic010G183350 Sobic008G047150--Sobic010G183350 Sobic008G047150--Sobic009G064300 Sobic001G136850 Sobic001G136850 Sobic008G047150--Sobic001G136850 Sobic008G047150--Sobic002G076350 Sobic001G059001--Sobic009G064300 Sobic001G059001--Sobic005G137500 Sobic001G190900 Sobic001G190900 Sobic001G059001--Sobic001G190900 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic001G059001--Sobic003G312900 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic001G059001--Sobic003G312800 Sobic001G059001--Sobic005G152866 Sobic008G072800 Sobic008G072800 Sobic001G059001--Sobic008G072800 Sobic002G012100 Sobic002G012100 Sobic001G059001--Sobic002G012100 Sobic001G059001--Sobic010G183350 Sobic002G256400--Sobic006G172100 Sobic002G256400--Sobic001G190700 Sobic002G256400--Sobic001G059001 Sobic002G256400--Sobic001G513200 Sobic002G256400--Sobic004G337975 Sobic010G265100 Sobic010G265100 Sobic002G256400--Sobic010G265100 Sobic003G271000 Sobic003G271000 Sobic002G256400--Sobic003G271000 Sobic002G256400--Sobic009G109600 Sobic006G233400 Sobic006G233400 Sobic002G256400--Sobic006G233400 Sobic002G076350--Sobic006G048400 Sobic006G052250 Sobic006G052250 Sobic002G076350--Sobic006G052250 Sobic002G076350--Sobic001G136850 Sobic002G076350--Sobic003G312900 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic002G076350--Sobic002G074900 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic002G076350--Sobic001G229850 Sobic006G146700 Sobic006G146700 Sobic002G076350--Sobic006G146700 Sobic006G263250 Sobic006G263250 Sobic002G076350--Sobic006G263250 Sobic005G180850 Sobic005G180850 Sobic002G076350--Sobic005G180850 Sobic009G064300--Sobic001G059001 Sobic009G064300--Sobic002G012100 Sobic007G078700 Sobic007G078700 Sobic009G064300--Sobic007G078700 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic009G064300--Sobic007G141900 Sobic003G023450 Sobic003G023450 Sobic009G064300--Sobic003G023450 Sobic003G338600 Sobic003G338600 Sobic009G064300--Sobic003G338600 Sobic009G064300--Sobic008G072800 Sobic009G064300--Sobic005G137500 Sobic009G064300--Sobic003G312900 Sobic006G172100--Sobic002G256400 Sobic006G172100--Sobic001G059001 Sobic006G172100--Sobic005G137500 Sobic006G172100--Sobic001G190700 Sobic004G193350 Sobic004G193350 Sobic006G172100--Sobic004G193350 Sobic002G216300 Sobic002G216300 Sobic006G172100--Sobic002G216300 Sobic003G375400 Sobic003G375400 Sobic006G172100--Sobic003G375400 Sobic009G153366 Sobic009G153366 Sobic006G172100--Sobic009G153366 Sobic006G172100--Sobic010G183350 Sobic008G067000--Sobic002G012100 Sobic008G067000--Sobic008G072800 Sobic003G096950 Sobic003G096950 Sobic008G067000--Sobic003G096950 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic008G067000--Sobic001G523150 Sobic003G030450 Sobic003G030450 Sobic008G067000--Sobic003G030450 Sobic001G094550 Sobic001G094550 Sobic008G067000--Sobic001G094550 Sobic008G067000--Sobic007G141900 Sobic009G101500 Sobic009G101500 Sobic008G067000--Sobic009G101500 Sobic001G107550 Sobic001G107550 Sobic008G067000--Sobic001G107550 Sobic008G046700 Sobic008G046700 Sobic002G181500--Sobic008G046700 Sobic002G181500--Sobic003G338600 Sobic001G261452 Sobic001G261452 Sobic002G181500--Sobic001G261452 Sobic002G281850 Sobic002G281850 Sobic002G181500--Sobic002G281850 Sobic003G263900 Sobic003G263900 Sobic002G181500--Sobic003G263900 Sobic002G181500--Sobic003G312800 Sobic010G100700 Sobic010G100700 Sobic002G181500--Sobic010G100700 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic002G181500--Sobic004G209100 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic002G181500--Sobic005G118800
Octagon: transcription factors


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