Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G195900.1
Synonym SRR1
Functional annotation sensitivity to red light reduced protein 1, putative, expressed
UniProt A0A1Z5REP3
Pfam PF07985
Panther DB PTHR28626 PTHR28626:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G59560 : sensitivity to red light reduced protein (SRR1)
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g49920.1 : sensitivity to red light reduced protein 1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G058500 - -
2 Sobic.008G068850 - -
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9 Sobic.001G183100 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
10 Sobic.008G188200 - -
11 Sobic.005G148201 - -
12 Sobic.008G068900 expressed protein -
13 Sobic.005G071200 - -
14 Sobic.005G150000 - -
15 Sobic.008G012000 - -
16 Sobic.007G047100 hypothetical protein -
17 Sobic.005G178200 hypothetical protein -
18 Sobic.009G020000 - -
19 Sobic.003G326300 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
20 Sobic.005G189800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G195900 Sobic006G195900 Sobic005G058500 Sobic005G058500 Sobic006G195900--Sobic005G058500 Sobic008G068850 Sobic008G068850 Sobic006G195900--Sobic008G068850 Sobic004G132200 Sobic004G132200 Sobic006G195900--Sobic004G132200 Sobic007G024000 Sobic007G024000 Sobic006G195900--Sobic007G024000 Sobic008G069200 Sobic008G069200 Sobic006G195900--Sobic008G069200 Sobic005G146000 Sobic005G146000 Sobic006G195900--Sobic005G146000 Sobic004G090500 Sobic004G090500 Sobic006G195900--Sobic004G090500 Sobic006G034900 Sobic006G034900 Sobic006G195900--Sobic006G034900 Sobic001G183100 Sobic001G183100 Sobic006G195900--Sobic001G183100 Sobic005G178200 Sobic005G178200 Sobic005G058500--Sobic005G178200 Sobic005G189800 Sobic005G189800 Sobic005G058500--Sobic005G189800 Sobic009G086100 Sobic009G086100 Sobic005G058500--Sobic009G086100 Sobic003G415300 Sobic003G415300 Sobic005G058500--Sobic003G415300 Sobic009G019700 Sobic009G019700 Sobic005G058500--Sobic009G019700 Sobic010G136100 Sobic010G136100 Sobic005G058500--Sobic010G136100 Sobic008G188200 Sobic008G188200 Sobic005G058500--Sobic008G188200 Sobic004G354500 Sobic004G354500 Sobic005G058500--Sobic004G354500 Sobic005G148100 Sobic005G148100 Sobic005G058500--Sobic005G148100 Sobic008G068850--Sobic006G034900 Sobic008G068900 Sobic008G068900 Sobic008G068850--Sobic008G068900 Sobic008G068450 Sobic008G068450 Sobic008G068850--Sobic008G068450 Sobic005G148201 Sobic005G148201 Sobic008G068850--Sobic005G148201 Sobic005G150000 Sobic005G150000 Sobic008G068850--Sobic005G150000 Sobic008G068850--Sobic004G132200 Sobic008G068850--Sobic005G146000 Sobic004G316300 Sobic004G316300 Sobic008G068850--Sobic004G316300 Sobic009G020000 Sobic009G020000 Sobic008G068850--Sobic009G020000 Sobic004G132200--Sobic005G146000 Sobic004G132200--Sobic005G148201 Sobic004G132200--Sobic005G150000 Sobic007G196100 Sobic007G196100 Sobic004G132200--Sobic007G196100 Sobic004G132200--Sobic004G316300 Sobic004G132200--Sobic006G034900 Sobic004G132200--Sobic008G068900 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic004G132200--Sobic003G326300 Sobic004G132200--Sobic005G148100 Sobic007G024000--Sobic004G354500 Sobic007G024000--Sobic004G090500 Sobic007G024000--Sobic008G069200 Sobic007G024000--Sobic005G058500 Sobic007G024000--Sobic005G178200 Sobic008G012000 Sobic008G012000 Sobic007G024000--Sobic008G012000 Sobic007G024000--Sobic008G188200 Sobic007G024000--Sobic003G415300 Sobic010G195301 Sobic010G195301 Sobic007G024000--Sobic010G195301 Sobic008G069200--Sobic008G188200 Sobic008G069200--Sobic004G090500 Sobic008G069200--Sobic005G178200 Sobic008G069200--Sobic003G415300 Sobic008G069200--Sobic003G326300 Sobic008G069200--Sobic007G024000 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic008G069200--Sobic008G184000 Sobic008G069200--Sobic005G058500 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic008G069200--Sobic008G082300 Sobic005G146000--Sobic004G132200 Sobic005G146000--Sobic007G196100 Sobic005G146000--Sobic005G148201 Sobic005G146000--Sobic005G148100 Sobic005G146000--Sobic005G150000 Sobic005G146000--Sobic003G326300 Sobic005G146000--Sobic005G189800 Sobic005G146000--Sobic009G019700 Sobic005G146000--Sobic004G316300 Sobic004G090500--Sobic008G012000 Sobic004G090500--Sobic008G069200 Sobic007G083900 Sobic007G083900 Sobic004G090500--Sobic007G083900 Sobic004G090500--Sobic007G024000 Sobic004G090500--Sobic008G188200 Sobic004G090500--Sobic005G058500 Sobic004G090500--Sobic009G020000 Sobic004G090500--Sobic008G068850 Sobic004G090500--Sobic004G354500 Sobic006G034900--Sobic008G068900 Sobic006G034900--Sobic008G068850 Sobic006G034900--Sobic008G068450 Sobic006G034900--Sobic005G148201 Sobic006G034900--Sobic005G150000 Sobic006G034900--Sobic004G132200 Sobic006G034900--Sobic005G146000 Sobic006G034900--Sobic004G316300 Sobic004G076900 Sobic004G076900 Sobic006G034900--Sobic004G076900 Sobic001G183100--Sobic008G184000 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic001G183100--Sobic005G227151 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic001G183100--Sobic002G105900 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic001G183100--Sobic004G207500 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic001G183100--Sobic004G029700 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic001G183100--Sobic008G184500 Sobic001G183100--Sobic003G326300 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic001G183100--Sobic003G099900 Sobic002G273000 Sobic002G273000 Sobic001G183100--Sobic002G273000
Octagon: transcription factors


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