Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G208050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5REU3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G052500 - -
2 Sobic.003G026100 expressed protein -
3 Sobic.010G058650 - -
4 Sobic.001G378550 - -
5 Sobic.006G201200 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
6 Sobic.006G098400 alpha/beta hydrolase fold, putative, expressed -
7 Sobic.009G249301 - -
8 Sobic.006G272450 - -
9 Sobic.001G361500 expressed protein -
10 Sobic.009G070900 - -
11 Sobic.003G174850 - -
12 Sobic.009G194600 expressed protein -
13 Sobic.004G351866 - -
14 Sobic.003G343100 expressed protein -
15 Sobic.008G023500 expressed protein -
16 Sobic.002G356700 OsFBD6 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
17 Sobic.008G078600 NADP-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
18 Sobic.006G185400 - -
19 Sobic.005G087600 AP2 domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G357000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G208050 Sobic006G208050 Sobic002G052500 Sobic002G052500 Sobic006G208050--Sobic002G052500 Sobic003G026100 Sobic003G026100 Sobic006G208050--Sobic003G026100 Sobic010G058650 Sobic010G058650 Sobic006G208050--Sobic010G058650 Sobic001G378550 Sobic001G378550 Sobic006G208050--Sobic001G378550 Sobic006G201200 Sobic006G201200 Sobic006G208050--Sobic006G201200 Sobic006G098400 Sobic006G098400 Sobic006G208050--Sobic006G098400 Sobic009G249301 Sobic009G249301 Sobic006G208050--Sobic009G249301 Sobic006G272450 Sobic006G272450 Sobic006G208050--Sobic006G272450 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic006G208050--Sobic001G361500 Sobic007G072901 Sobic007G072901 Sobic002G052500--Sobic007G072901 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic002G052500--Sobic003G245700 Sobic003G343100 Sobic003G343100 Sobic002G052500--Sobic003G343100 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic002G052500--Sobic008G023500 Sobic006G090201 Sobic006G090201 Sobic002G052500--Sobic006G090201 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic002G052500--Sobic006G185400 Sobic009G010800 Sobic009G010800 Sobic002G052500--Sobic009G010800 Sobic003G178200 Sobic003G178200 Sobic002G052500--Sobic003G178200 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic002G052500--Sobic004G330500 Sobic003G026100--Sobic001G361500 Sobic005G087600 Sobic005G087600 Sobic003G026100--Sobic005G087600 Sobic010G014600 Sobic010G014600 Sobic003G026100--Sobic010G014600 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic003G026100--Sobic005G189400 Sobic003G026100--Sobic004G330500 Sobic003G026100--Sobic006G185400 Sobic003G026100--Sobic006G090201 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic003G026100--Sobic007G152200 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic003G026100--Sobic009G164200 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic010G058650--Sobic010G275550 Sobic010G058650--Sobic006G201200 Sobic010G058650--Sobic006G185400 Sobic010G058650--Sobic004G330500 Sobic004G351866 Sobic004G351866 Sobic010G058650--Sobic004G351866 Sobic010G058650--Sobic005G189400 Sobic010G058650--Sobic003G343100 Sobic010G058650--Sobic007G152200 Sobic010G058650--Sobic008G023500 Sobic001G378550--Sobic006G185400 Sobic001G378550--Sobic004G330500 Sobic001G378550--Sobic003G343100 Sobic001G378550--Sobic007G152200 Sobic001G378550--Sobic005G189400 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic001G378550--Sobic005G037500 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic001G378550--Sobic002G205201 Sobic001G378550--Sobic001G361500 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic001G378550--Sobic006G209100 Sobic006G201200--Sobic006G209100 Sobic006G201200--Sobic001G361500 Sobic006G201200--Sobic006G185400 Sobic006G201200--Sobic004G330500 Sobic006G201200--Sobic010G275550 Sobic006G201200--Sobic005G189400 Sobic006G201200--Sobic009G164200 Sobic006G201200--Sobic007G152200 Sobic006G201200--Sobic002G205201 Sobic002G022600 Sobic002G022600 Sobic006G098400--Sobic002G022600 Sobic004G269900 Sobic004G269900 Sobic006G098400--Sobic004G269900 Sobic002G189300 Sobic002G189300 Sobic006G098400--Sobic002G189300 Sobic001G403800 Sobic001G403800 Sobic006G098400--Sobic001G403800 Sobic003G037200 Sobic003G037200 Sobic006G098400--Sobic003G037200 Sobic006G098400--Sobic006G208050 Sobic001G404000 Sobic001G404000 Sobic006G098400--Sobic001G404000 Sobic001G079600 Sobic001G079600 Sobic006G098400--Sobic001G079600 Sobic003G047300 Sobic003G047300 Sobic006G098400--Sobic003G047300 Sobic008G150150 Sobic008G150150 Sobic009G249301--Sobic008G150150 Sobic010G074960 Sobic010G074960 Sobic009G249301--Sobic010G074960 Sobic001G019100 Sobic001G019100 Sobic009G249301--Sobic001G019100 Sobic009G249301--Sobic010G275550 Sobic009G249301--Sobic010G058650 Sobic003G288900 Sobic003G288900 Sobic009G249301--Sobic003G288900 Sobic009G194600 Sobic009G194600 Sobic009G249301--Sobic009G194600 Sobic009G004000 Sobic009G004000 Sobic009G249301--Sobic009G004000 Sobic009G249301--Sobic003G343100 Sobic006G272450--Sobic009G164200 Sobic006G272450--Sobic008G023500 Sobic006G272450--Sobic006G090201 Sobic006G272450--Sobic009G010800 Sobic009G070900 Sobic009G070900 Sobic006G272450--Sobic009G070900 Sobic006G272450--Sobic006G185400 Sobic006G272450--Sobic003G245700 Sobic006G272450--Sobic004G330500 Sobic006G272450--Sobic005G189400 Sobic001G361500--Sobic006G185400 Sobic001G361500--Sobic004G330500 Sobic001G361500--Sobic005G189400 Sobic001G361500--Sobic006G209100 Sobic001G361500--Sobic002G205201 Sobic001G361500--Sobic007G152200 Sobic001G361500--Sobic009G164200 Sobic001G361500--Sobic008G023500 Sobic001G361500--Sobic005G037500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.