Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G212200.1,Sobic.006G212200.2
Synonym Sb06g028270, ZIP1
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
metal cation transporter, putative, expressed
UniProt C5YFP5 , A0A1B6PMW2
Pfam PF02535
Panther DB PTHR11040 PTHR11040:SF54
NCBI CDD KOG1558; Fe2+/Zn2+ regulated transporter
KEGG Orthology K14709; SLC39A1_2_3, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1/2/3
Gene Ontology GO:0016020; membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G12750 : zinc transporter 1 precursor
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g52310.1 : metal cation transporter, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009819
Brachypodium KQJ84550 , PNT61839
Barley HORVU2Hr1G099330.10 , HORVU2Hr1G099330.2 , HORVU2Hr1G099330.8 , HORVU2Hr1G099330.9 , HORVU2Hr1G099330.4 , HORVU2Hr1G099330.5 , HORVU2Hr1G099330.6 , HORVU2Hr1G099330.7 , HORVU2Hr1G099330.3
Wheat TraesCS2D02G422000 , TraesCS2A02G424200 , TraesCS2A02G424200 , TraesCS2B02G443800 , TraesCS2B02G443800
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G132400 Os6bglu24 - beta-glucosidase homologue, similar to G. max isohydroxyurate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase
2 Sobic.006G145300 Os4bglu14 - monolignol beta-glucoside homologue without catalytic acid/base, expressed -
3 Sobic.010G136700 - -
4 Sobic.004G276600 expressed protein -
5 Sobic.008G115200 OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G154600 - -
7 Sobic.004G310350 - -
8 Sobic.004G270900 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
9 Sobic.008G119600 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
10 Sobic.001G373850 - -
11 Sobic.003G260500 - -
12 Sobic.003G251000 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
13 Sobic.004G133201 - -
14 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4
15 Sobic.008G093300 - -
16 Sobic.007G090433 - -
17 Sobic.006G176900 - -
18 Sobic.002G154450 - -
19 Sobic.006G149900 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G016050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G212200 Sobic006G212200 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic006G212200--Sobic010G132400 Sobic006G145300 Sobic006G145300 Sobic006G212200--Sobic006G145300 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic006G212200--Sobic010G136700 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic006G212200--Sobic004G276600 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic006G212200--Sobic008G115200 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic006G212200--Sobic005G154600 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic006G212200--Sobic004G310350 Sobic004G270900 Sobic004G270900 Sobic006G212200--Sobic004G270900 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic006G212200--Sobic008G119600 Sobic010G132400--Sobic010G136700 Sobic010G132400--Sobic008G119600 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic010G132400--Sobic006G035350 Sobic010G132400--Sobic005G154600 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic010G132400--Sobic006G176900 Sobic010G132400--Sobic004G276600 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic010G132400--Sobic004G127733 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic010G132400--Sobic002G154450 Sobic010G132400--Sobic008G115200 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic006G145300--Sobic004G209100 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic006G145300--Sobic006G223101 Sobic006G145300--Sobic008G115200 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic006G145300--Sobic005G090800 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic006G145300--Sobic003G251000 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic006G145300--Sobic010G235100 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic006G145300--Sobic007G004400 Sobic006G145300--Sobic010G136700 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic006G145300--Sobic003G232600 Sobic010G136700--Sobic008G119600 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic010G136700--Sobic001G016050 Sobic010G136700--Sobic010G132400 Sobic010G136700--Sobic008G115200 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic010G136700--Sobic006G107766 Sobic010G136700--Sobic007G004400 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic010G136700--Sobic007G090433 Sobic010G136700--Sobic005G090800 Sobic002G212900 Sobic002G212900 Sobic010G136700--Sobic002G212900 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic004G276600--Sobic001G420150 Sobic004G276600--Sobic007G090433 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic004G276600--Sobic007G116300 Sobic004G276600--Sobic005G154600 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic004G276600--Sobic001G093400 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic004G276600--Sobic001G255866 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic004G276600--Sobic004G133201 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic004G276600--Sobic001G423200 Sobic006G261650 Sobic006G261650 Sobic004G276600--Sobic006G261650 Sobic008G115200--Sobic004G133201 Sobic008G115200--Sobic007G004400 Sobic008G115200--Sobic010G136700 Sobic008G115200--Sobic006G107766 Sobic008G115200--Sobic006G176900 Sobic008G115200--Sobic008G119600 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic008G115200--Sobic003G394701 Sobic008G115200--Sobic006G223101 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic008G115200--Sobic002G074900 Sobic005G154600--Sobic006G261650 Sobic005G154600--Sobic004G276600 Sobic005G154600--Sobic002G154450 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic005G154600--Sobic010G247750 Sobic005G154600--Sobic004G310350 Sobic005G154600--Sobic006G035350 Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic005G154600--Sobic008G093300 Sobic005G154600--Sobic010G132400 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic005G154600--Sobic007G127200 Sobic006G053550 Sobic006G053550 Sobic004G310350--Sobic006G053550 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic004G310350--Sobic005G019250 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic004G310350--Sobic002G214000 Sobic001G224500 Sobic001G224500 Sobic004G310350--Sobic001G224500 SobicK031900 SobicK031900 Sobic004G310350--SobicK031900 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic004G310350--Sobic008G129500 Sobic004G310350--Sobic005G154600 Sobic009G215100 Sobic009G215100 Sobic004G310350--Sobic009G215100 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic004G310350--Sobic003G268100 Sobic004G270900--Sobic006G261650 Sobic007G136500 Sobic007G136500 Sobic004G270900--Sobic007G136500 Sobic004G270900--Sobic005G154600 Sobic004G270900--Sobic004G276600 Sobic004G270900--Sobic006G212200 Sobic004G270900--Sobic002G154450 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic004G270900--Sobic007G190600 Sobic002G337400 Sobic002G337400 Sobic004G270900--Sobic002G337400 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic004G270900--Sobic010G149000 Sobic008G119600--Sobic007G004400 Sobic008G119600--Sobic006G107766 Sobic008G119600--Sobic010G136700 Sobic008G119600--Sobic006G176900 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic008G119600--Sobic003G187600 Sobic008G119600--Sobic006G035350 Sobic008G119600--Sobic008G115200 Sobic003G029150 Sobic003G029150 Sobic008G119600--Sobic003G029150 Sobic008G119600--Sobic010G132400
Octagon: transcription factors


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