Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G231266.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PN84
Pfam -
Panther DB PTHR36382
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G21445 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g54320.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054804
Brachypodium KQJ84835
Barley HORVU2Hr1G116660.4 , HORVU2Hr1G116660.2 , HORVU2Hr1G116660.3 , HORVU2Hr1G116660.1
Wheat TraesCS2D02G531819
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G534132 - -
2 Sobic.003G067900 - -
3 Sobic.003G068100 receptor kinase, putative, expressed -
4 Sobic.002G421100 KIP1, putative, expressed -
5 Sobic.006G135550 - -
6 Sobic.003G226900 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
7 Sobic.004G265200 ZOS2-16 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
8 Sobic.005G110433 - -
9 Sobic.008G108100 - -
10 Sobic.003G267150 - -
11 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
12 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
13 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
14 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
15 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
16 Sobic.003G389150 - -
17 Sobic.009G236150 - -
18 Sobic.006G159500 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
19 Sobic.006G083050 - -
20 Sobic.005G216833 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G231266 Sobic006G231266 Sobic001G534132 Sobic001G534132 Sobic006G231266--Sobic001G534132 Sobic003G067900 Sobic003G067900 Sobic006G231266--Sobic003G067900 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic006G231266--Sobic003G068100 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic006G231266--Sobic002G421100 Sobic006G135550 Sobic006G135550 Sobic006G231266--Sobic006G135550 Sobic003G226900 Sobic003G226900 Sobic006G231266--Sobic003G226900 Sobic004G265200 Sobic004G265200 Sobic006G231266--Sobic004G265200 Sobic005G110433 Sobic005G110433 Sobic006G231266--Sobic005G110433 Sobic008G108100 Sobic008G108100 Sobic006G231266--Sobic008G108100 Sobic001G534132--Sobic003G067900 Sobic001G534132--Sobic003G068100 Sobic003G272001 Sobic003G272001 Sobic001G534132--Sobic003G272001 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic001G534132--Sobic006G159500 Sobic005G185000 Sobic005G185000 Sobic001G534132--Sobic005G185000 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic001G534132--Sobic003G267150 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic001G534132--Sobic002G160500 Sobic003G067900--Sobic001G534132 Sobic003G067900--Sobic003G068100 Sobic003G067900--Sobic003G272001 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic003G067900--Sobic005G116800 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic003G067900--Sobic006G083050 Sobic003G067900--Sobic006G159500 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic003G067900--Sobic008G142500 Sobic004G264900 Sobic004G264900 Sobic003G067900--Sobic004G264900 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic003G067900--Sobic009G115800 Sobic003G068100--Sobic003G067900 Sobic003G068100--Sobic006G083050 Sobic003G068100--Sobic001G534132 Sobic003G068100--Sobic008G142500 Sobic003G068100--Sobic005G116800 Sobic001G326500 Sobic001G326500 Sobic003G068100--Sobic001G326500 Sobic003G068100--Sobic002G421100 Sobic003G068100--Sobic006G159500 Sobic003G068100--Sobic009G115800 Sobic009G199401 Sobic009G199401 Sobic002G421100--Sobic009G199401 Sobic002G421100--Sobic008G142500 Sobic002G421100--Sobic006G083050 Sobic010G229025 Sobic010G229025 Sobic002G421100--Sobic010G229025 Sobic001G489400 Sobic001G489400 Sobic002G421100--Sobic001G489400 Sobic003G162600 Sobic003G162600 Sobic002G421100--Sobic003G162600 Sobic002G421100--Sobic003G068100 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic002G421100--Sobic006G221500 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic002G421100--Sobic001G014600 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic006G135550--Sobic003G261766 Sobic006G135550--Sobic009G115800 Sobic006G135550--Sobic008G108100 Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic006G135550--Sobic006G099400 Sobic006G135550--Sobic006G159500 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic006G135550--Sobic005G041150 Sobic005G216833 Sobic005G216833 Sobic006G135550--Sobic005G216833 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic006G135550--Sobic004G313000 Sobic009G236150 Sobic009G236150 Sobic006G135550--Sobic009G236150 Sobic003G226900--Sobic002G160500 Sobic003G226900--Sobic003G267150 Sobic004G262550 Sobic004G262550 Sobic003G226900--Sobic004G262550 Sobic009G091940 Sobic009G091940 Sobic003G226900--Sobic009G091940 Sobic003G389150 Sobic003G389150 Sobic003G226900--Sobic003G389150 Sobic004G265200--Sobic008G108100 Sobic004G265200--Sobic003G267150 Sobic004G265200--Sobic005G041150 Sobic004G265200--Sobic002G160500 Sobic004G265200--Sobic009G115800 Sobic009G191900 Sobic009G191900 Sobic005G110433--Sobic009G191900 Sobic005G110433--Sobic006G231266 Sobic005G110433--Sobic006G135550 Sobic001G146700 Sobic001G146700 Sobic005G110433--Sobic001G146700 Sobic004G235100 Sobic004G235100 Sobic005G110433--Sobic004G235100 Sobic007G122400 Sobic007G122400 Sobic005G110433--Sobic007G122400 Sobic007G015700 Sobic007G015700 Sobic005G110433--Sobic007G015700 Sobic005G161750 Sobic005G161750 Sobic005G110433--Sobic005G161750 Sobic001G320800 Sobic001G320800 Sobic005G110433--Sobic001G320800 Sobic008G108100--Sobic003G267150 Sobic008G108100--Sobic009G115800 Sobic008G108100--Sobic002G160500 Sobic008G108100--Sobic004G313000 Sobic008G108100--Sobic004G262550
Octagon: transcription factors


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