Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G018651.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PF28
Pfam PF12937
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF101
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g12200.1 : OsFBX380 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G011300 - -
2 Sobic.001G106800 DUF221 domain containing protein, expressed -
3 Sobic.004G075250 - -
4 Sobic.004G258000 expressed protein -
5 Sobic.002G266500 - -
6 Sobic.006G276801 - -
7 Sobic.005G041450 - -
8 Sobic.005G077001 - -
9 Sobic.001G467400 expressed protein -
10 Sobic.002G223650 - -
11 Sobic.007G081701 - K10523: speckle-type POZ protein
12 Sobic.001G197050 - -
13 Sobic.003G250160 - -
14 Sobic.009G110333 - -
15 Sobic.009G177750 - -
16 Sobic.004G046800 expressed protein -
17 Sobic.005G112500 - -
18 Sobic.003G274100 THION44 - Plant thionin family protein precursor, putative, expressed -
19 Sobic.001G325850 - -
20 Sobic.010G158050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G018651 Sobic007G018651 Sobic002G011300 Sobic002G011300 Sobic007G018651--Sobic002G011300 Sobic001G106800 Sobic001G106800 Sobic007G018651--Sobic001G106800 Sobic004G075250 Sobic004G075250 Sobic007G018651--Sobic004G075250 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic007G018651--Sobic004G258000 Sobic002G266500 Sobic002G266500 Sobic007G018651--Sobic002G266500 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic007G018651--Sobic006G276801 Sobic005G041450 Sobic005G041450 Sobic007G018651--Sobic005G041450 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic007G018651--Sobic005G077001 Sobic001G467400 Sobic001G467400 Sobic007G018651--Sobic001G467400 Sobic002G011300--Sobic002G266500 Sobic002G011300--Sobic006G276801 Sobic005G112500 Sobic005G112500 Sobic002G011300--Sobic005G112500 Sobic002G011300--Sobic004G258000 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic002G011300--Sobic009G110333 Sobic007G081701 Sobic007G081701 Sobic002G011300--Sobic007G081701 Sobic003G250160 Sobic003G250160 Sobic002G011300--Sobic003G250160 Sobic001G197050 Sobic001G197050 Sobic002G011300--Sobic001G197050 Sobic009G177750 Sobic009G177750 Sobic002G011300--Sobic009G177750 Sobic002G030300 Sobic002G030300 Sobic001G106800--Sobic002G030300 Sobic002G111100 Sobic002G111100 Sobic001G106800--Sobic002G111100 Sobic001G106800--Sobic002G011300 Sobic009G060000 Sobic009G060000 Sobic001G106800--Sobic009G060000 Sobic003G290500 Sobic003G290500 Sobic001G106800--Sobic003G290500 Sobic001G409000 Sobic001G409000 Sobic001G106800--Sobic001G409000 Sobic007G001800 Sobic007G001800 Sobic001G106800--Sobic007G001800 Sobic004G217200 Sobic004G217200 Sobic001G106800--Sobic004G217200 Sobic004G049300 Sobic004G049300 Sobic001G106800--Sobic004G049300 Sobic004G075250--Sobic001G467400 Sobic004G075250--Sobic006G276801 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic004G075250--Sobic002G223650 Sobic004G075250--Sobic004G258000 Sobic004G075250--Sobic003G250160 Sobic004G075250--Sobic007G081701 Sobic004G075250--Sobic009G177750 Sobic003G274100 Sobic003G274100 Sobic004G075250--Sobic003G274100 Sobic004G075250--Sobic002G011300 Sobic004G258000--Sobic006G276801 Sobic004G258000--Sobic009G110333 Sobic004G258000--Sobic005G112500 Sobic004G258000--Sobic007G081701 Sobic004G258000--Sobic002G011300 Sobic004G258000--Sobic003G250160 Sobic004G258000--Sobic002G266500 Sobic004G258000--Sobic002G223650 Sobic004G258000--Sobic009G177750 Sobic002G266500--Sobic009G110333 Sobic002G266500--Sobic002G011300 Sobic002G266500--Sobic005G112500 Sobic002G266500--Sobic004G258000 Sobic002G266500--Sobic006G276801 Sobic004G050900 Sobic004G050900 Sobic002G266500--Sobic004G050900 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic002G266500--Sobic003G133201 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic002G266500--Sobic009G110700 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic002G266500--Sobic008G169101 Sobic006G276801--Sobic004G258000 Sobic006G276801--Sobic007G081701 Sobic006G276801--Sobic003G250160 Sobic006G276801--Sobic009G110333 Sobic006G276801--Sobic005G112500 Sobic006G276801--Sobic002G011300 Sobic006G276801--Sobic009G177750 Sobic006G276801--Sobic001G467400 Sobic006G276801--Sobic002G223650 Sobic005G041450--Sobic004G258000 Sobic005G041450--Sobic004G075250 Sobic005G041450--Sobic006G276801 Sobic005G041450--Sobic005G077001 Sobic005G041450--Sobic002G223650 Sobic005G041450--Sobic001G467400 Sobic005G041450--Sobic009G110333 Sobic005G041450--Sobic002G011300 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic005G041450--Sobic005G201501 Sobic005G077001--Sobic009G110333 Sobic005G077001--Sobic005G201501 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic005G077001--Sobic005G058600 Sobic005G077001--Sobic004G258000 Sobic005G077001--Sobic003G133201 Sobic005G077001--Sobic002G266500 Sobic005G077001--Sobic006G276801 Sobic001G325850 Sobic001G325850 Sobic005G077001--Sobic001G325850 Sobic005G077001--Sobic005G112500 Sobic001G467400--Sobic003G250160 Sobic001G467400--Sobic004G075250 Sobic001G467400--Sobic007G081701 Sobic001G467400--Sobic006G276801 Sobic001G467400--Sobic009G177750 Sobic001G467400--Sobic002G223650 Sobic001G467400--Sobic004G258000 Sobic001G467400--Sobic003G274100 Sobic001G467400--Sobic001G197050
Octagon: transcription factors


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