Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G065800.2,Sobic.007G065800.1
Synonym Sb07g005230
Functional annotation Cupin domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5R8B4 , C5YI11
Pfam PF07883
Panther DB PTHR31238 PTHR31238:SF33
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G39110 : RmlC-like cupins superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g05840.1,LOC_Os12g05860.1 : Cupin domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ95100 , KQJ95107
Barley -
Wheat TraesCS7B02G374900 , TraesCS7B02G374800 , TraesCS7A02G473400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G292001 - -
2 Sobic.004G023500 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
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11 Sobic.003G344050 - -
12 Sobic.003G364950 - -
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14 Sobic.009G099400 peptidase, T1 family, putative, expressed -
15 Sobic.007G108200 - -
16 Sobic.008G039501 - -
17 Sobic.007G118800 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed K17795: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17
18 Sobic.003G249050 - -
19 Sobic.006G214600 - -
20 Sobic.002G389301 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G065800 Sobic007G065800 Sobic004G292001 Sobic004G292001 Sobic007G065800--Sobic004G292001 Sobic004G023500 Sobic004G023500 Sobic007G065800--Sobic004G023500 Sobic002G130601 Sobic002G130601 Sobic007G065800--Sobic002G130601 Sobic007G065900 Sobic007G065900 Sobic007G065800--Sobic007G065900 Sobic008G157800 Sobic008G157800 Sobic007G065800--Sobic008G157800 Sobic004G061701 Sobic004G061701 Sobic007G065800--Sobic004G061701 Sobic005G217300 Sobic005G217300 Sobic007G065800--Sobic005G217300 Sobic002G150100 Sobic002G150100 Sobic007G065800--Sobic002G150100 Sobic004G292001--Sobic007G065900 Sobic004G292001--Sobic007G065800 Sobic004G292001--Sobic002G130601 Sobic003G364950 Sobic003G364950 Sobic004G292001--Sobic003G364950 Sobic004G292001--Sobic008G157800 Sobic005G213500 Sobic005G213500 Sobic004G292001--Sobic005G213500 Sobic004G278400 Sobic004G278400 Sobic004G292001--Sobic004G278400 Sobic004G292001--Sobic004G023500 Sobic007G030400 Sobic007G030400 Sobic004G292001--Sobic007G030400 Sobic004G023500--Sobic004G061701 Sobic004G023500--Sobic008G157800 Sobic009G099400 Sobic009G099400 Sobic004G023500--Sobic009G099400 Sobic004G023500--Sobic007G065900 Sobic003G344050 Sobic003G344050 Sobic004G023500--Sobic003G344050 Sobic004G023500--Sobic002G150100 Sobic002G220800 Sobic002G220800 Sobic004G023500--Sobic002G220800 Sobic002G130601--Sobic004G292001 Sobic002G130601--Sobic007G065800 Sobic002G130601--Sobic007G065900 Sobic002G130601--Sobic004G023500 Sobic002G130601--Sobic008G157800 Sobic010G113600 Sobic010G113600 Sobic002G130601--Sobic010G113600 Sobic002G130601--Sobic004G061701 Sobic002G130601--Sobic005G217300 Sobic002G130601--Sobic003G364950 Sobic007G065900--Sobic008G157800 Sobic007G065900--Sobic004G023500 Sobic007G065900--Sobic010G113600 Sobic007G065900--Sobic004G061701 Sobic007G065900--Sobic004G292001 Sobic008G170100 Sobic008G170100 Sobic007G065900--Sobic008G170100 Sobic003G112300 Sobic003G112300 Sobic007G065900--Sobic003G112300 Sobic008G039501 Sobic008G039501 Sobic007G065900--Sobic008G039501 Sobic007G065900--Sobic007G065800 Sobic008G157800--Sobic004G061701 Sobic008G157800--Sobic007G065900 Sobic008G157800--Sobic004G023500 Sobic008G157800--Sobic008G039501 Sobic008G157800--Sobic003G344050 Sobic008G157800--Sobic002G150100 Sobic007G108200 Sobic007G108200 Sobic008G157800--Sobic007G108200 Sobic004G061701--Sobic003G344050 Sobic004G061701--Sobic002G150100 Sobic004G061701--Sobic007G108200 Sobic004G061701--Sobic002G220800 Sobic004G061701--Sobic008G039501 Sobic003G249050 Sobic003G249050 Sobic004G061701--Sobic003G249050 Sobic004G061701--Sobic008G157800 Sobic005G217300--Sobic004G023500 Sobic005G217300--Sobic007G065900 Sobic005G217300--Sobic007G065800 Sobic005G217300--Sobic004G292001 Sobic005G217300--Sobic008G157800 Sobic005G217300--Sobic004G061701 Sobic002G195500 Sobic002G195500 Sobic005G217300--Sobic002G195500 Sobic005G217300--Sobic010G113600 Sobic005G217300--Sobic002G130601 Sobic002G150100--Sobic002G150100 Sobic002G150100--Sobic003G344050 Sobic002G150100--Sobic002G220800 Sobic002G150100--Sobic007G108200 Sobic002G150100--Sobic003G249050 Sobic002G150100--Sobic004G061701 Sobic002G150100--Sobic008G039501 Sobic002G150100--Sobic004G023500
Octagon: transcription factors


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