Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G065900.1
Synonym Sb07g005240
Functional annotation Cupin domain containing protein, expressed
UniProt C5YI12
Pfam PF07883
Panther DB PTHR31238 PTHR31238:SF45
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G05950 : RmlC-like cupins superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g05860.1 : Cupin domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054785 , Zm00025a054784 , Zm00025a054788
Brachypodium KQJ95102
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.009G099400 peptidase, T1 family, putative, expressed -
20 Sobic.002G130601 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G065900 Sobic007G065900 Sobic008G157800 Sobic008G157800 Sobic007G065900--Sobic008G157800 Sobic004G023500 Sobic004G023500 Sobic007G065900--Sobic004G023500 Sobic010G113600 Sobic010G113600 Sobic007G065900--Sobic010G113600 Sobic004G061701 Sobic004G061701 Sobic007G065900--Sobic004G061701 Sobic004G292001 Sobic004G292001 Sobic007G065900--Sobic004G292001 Sobic008G170100 Sobic008G170100 Sobic007G065900--Sobic008G170100 Sobic003G112300 Sobic003G112300 Sobic007G065900--Sobic003G112300 Sobic008G039501 Sobic008G039501 Sobic007G065900--Sobic008G039501 Sobic007G065800 Sobic007G065800 Sobic007G065900--Sobic007G065800 Sobic008G157800--Sobic004G061701 Sobic008G157800--Sobic007G065900 Sobic008G157800--Sobic004G023500 Sobic008G157800--Sobic008G039501 Sobic003G344050 Sobic003G344050 Sobic008G157800--Sobic003G344050 Sobic002G150100 Sobic002G150100 Sobic008G157800--Sobic002G150100 Sobic007G108200 Sobic007G108200 Sobic008G157800--Sobic007G108200 Sobic004G023500--Sobic004G061701 Sobic004G023500--Sobic008G157800 Sobic009G099400 Sobic009G099400 Sobic004G023500--Sobic009G099400 Sobic004G023500--Sobic007G065900 Sobic004G023500--Sobic003G344050 Sobic004G023500--Sobic002G150100 Sobic002G220800 Sobic002G220800 Sobic004G023500--Sobic002G220800 Sobic010G113600--Sobic007G065900 Sobic009G217700 Sobic009G217700 Sobic010G113600--Sobic009G217700 Sobic003G271500 Sobic003G271500 Sobic010G113600--Sobic003G271500 Sobic009G139700 Sobic009G139700 Sobic010G113600--Sobic009G139700 Sobic003G364000 Sobic003G364000 Sobic010G113600--Sobic003G364000 Sobic010G113600--Sobic008G157800 Sobic005G005600 Sobic005G005600 Sobic010G113600--Sobic005G005600 Sobic003G319700 Sobic003G319700 Sobic010G113600--Sobic003G319700 Sobic010G088700 Sobic010G088700 Sobic010G113600--Sobic010G088700 Sobic004G061701--Sobic003G344050 Sobic004G061701--Sobic002G150100 Sobic004G061701--Sobic007G108200 Sobic004G061701--Sobic002G220800 Sobic004G061701--Sobic008G039501 Sobic003G249050 Sobic003G249050 Sobic004G061701--Sobic003G249050 Sobic004G061701--Sobic008G157800 Sobic004G292001--Sobic007G065900 Sobic004G292001--Sobic007G065800 Sobic002G130601 Sobic002G130601 Sobic004G292001--Sobic002G130601 Sobic003G364950 Sobic003G364950 Sobic004G292001--Sobic003G364950 Sobic004G292001--Sobic008G157800 Sobic005G213500 Sobic005G213500 Sobic004G292001--Sobic005G213500 Sobic004G278400 Sobic004G278400 Sobic004G292001--Sobic004G278400 Sobic004G292001--Sobic004G023500 Sobic007G030400 Sobic007G030400 Sobic004G292001--Sobic007G030400 Sobic008G170100--Sobic007G030400 Sobic003G082200 Sobic003G082200 Sobic008G170100--Sobic003G082200 Sobic010G085500 Sobic010G085500 Sobic008G170100--Sobic010G085500 Sobic003G082100 Sobic003G082100 Sobic008G170100--Sobic003G082100 Sobic008G170100--Sobic007G065900 Sobic008G170100--Sobic003G112300 Sobic008G170100--Sobic008G157800 Sobic008G170100--Sobic009G139700 Sobic007G039600 Sobic007G039600 Sobic008G170100--Sobic007G039600 Sobic003G112300--Sobic007G065900 Sobic003G112300--Sobic008G170100 Sobic003G112300--Sobic008G157800 Sobic010G229075 Sobic010G229075 Sobic003G112300--Sobic010G229075 Sobic009G141000 Sobic009G141000 Sobic003G112300--Sobic009G141000 Sobic003G112300--Sobic009G139700 Sobic003G112300--Sobic004G023500 Sobic003G112300--Sobic004G292001 Sobic003G112300--Sobic010G085500 Sobic008G039501--Sobic002G150100 Sobic008G039501--Sobic003G344050 Sobic008G039501--Sobic004G061701 Sobic008G039501--Sobic002G220800 Sobic008G039501--Sobic007G108200 Sobic008G039501--Sobic003G249050 Sobic008G039501--Sobic004G023500 Sobic007G065800--Sobic004G292001 Sobic007G065800--Sobic004G023500 Sobic007G065800--Sobic002G130601 Sobic007G065800--Sobic007G065900 Sobic007G065800--Sobic008G157800 Sobic007G065800--Sobic004G061701 Sobic005G217300 Sobic005G217300 Sobic007G065800--Sobic005G217300 Sobic007G065800--Sobic002G150100
Octagon: transcription factors


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