Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G292001.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt -
Pfam PF00234
Panther DB PTHR31731 PTHR31731:SF27
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G12520 : Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g44310.1 : LTPL112 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052000 , Zm00025a021411 , Zm00025a021415 , Zm00025a003292 , Zm00025a000126 , Zm00025a052004 , Zm00025a052003
Brachypodium -
Barley HORVU1Hr1G053590.1 , HORVU4Hr1G087780.10 , HORVU4Hr1G087800.1 , HORVU4Hr1G087780.9
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G065900 Cupin domain containing protein, expressed -
2 Sobic.007G065800 Cupin domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G130601 - -
4 Sobic.003G364950 - -
5 Sobic.008G157800 BURP domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G213500 leucoanthocyanidin dioxygenase, putative, expressed -
7 Sobic.004G278400 DUF581 domain containing protein, expressed -
8 Sobic.004G023500 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
9 Sobic.007G030400 expressed protein -
10 Sobic.002G183600 L-ascorbate oxidase precursor, putative, expressed -
11 Sobic.003G073460 - -
12 Sobic.003G364000 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
13 Sobic.003G112300 expressed protein -
14 Sobic.010G113600 vignain precursor, putative, expressed -
15 Sobic.010G043900 expressed protein -
16 Sobic.005G005600 prenylated rab acceptor, putative, expressed -
17 Sobic.005G217300 expressed protein -
18 Sobic.006G214600 - -
19 Sobic.002G422300 ethylene-insensitive 3, putative, expressed K14514: ethylene-insensitive protein 3
20 Sobic.004G061701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G292001 Sobic004G292001 Sobic007G065900 Sobic007G065900 Sobic004G292001--Sobic007G065900 Sobic007G065800 Sobic007G065800 Sobic004G292001--Sobic007G065800 Sobic002G130601 Sobic002G130601 Sobic004G292001--Sobic002G130601 Sobic003G364950 Sobic003G364950 Sobic004G292001--Sobic003G364950 Sobic008G157800 Sobic008G157800 Sobic004G292001--Sobic008G157800 Sobic005G213500 Sobic005G213500 Sobic004G292001--Sobic005G213500 Sobic004G278400 Sobic004G278400 Sobic004G292001--Sobic004G278400 Sobic004G023500 Sobic004G023500 Sobic004G292001--Sobic004G023500 Sobic007G030400 Sobic007G030400 Sobic004G292001--Sobic007G030400 Sobic007G065900--Sobic008G157800 Sobic007G065900--Sobic004G023500 Sobic010G113600 Sobic010G113600 Sobic007G065900--Sobic010G113600 Sobic004G061701 Sobic004G061701 Sobic007G065900--Sobic004G061701 Sobic007G065900--Sobic004G292001 Sobic008G170100 Sobic008G170100 Sobic007G065900--Sobic008G170100 Sobic003G112300 Sobic003G112300 Sobic007G065900--Sobic003G112300 Sobic008G039501 Sobic008G039501 Sobic007G065900--Sobic008G039501 Sobic007G065900--Sobic007G065800 Sobic007G065800--Sobic004G292001 Sobic007G065800--Sobic004G023500 Sobic007G065800--Sobic002G130601 Sobic007G065800--Sobic007G065900 Sobic007G065800--Sobic008G157800 Sobic007G065800--Sobic004G061701 Sobic005G217300 Sobic005G217300 Sobic007G065800--Sobic005G217300 Sobic002G150100 Sobic002G150100 Sobic007G065800--Sobic002G150100 Sobic002G130601--Sobic004G292001 Sobic002G130601--Sobic007G065800 Sobic002G130601--Sobic007G065900 Sobic002G130601--Sobic004G023500 Sobic002G130601--Sobic008G157800 Sobic002G130601--Sobic010G113600 Sobic002G130601--Sobic004G061701 Sobic002G130601--Sobic005G217300 Sobic002G130601--Sobic003G364950 Sobic006G214600 Sobic006G214600 Sobic003G364950--Sobic006G214600 Sobic010G043900 Sobic010G043900 Sobic003G364950--Sobic010G043900 Sobic003G364950--Sobic004G292001 Sobic003G364950--Sobic004G278400 Sobic003G364950--Sobic005G213500 Sobic003G364300 Sobic003G364300 Sobic003G364950--Sobic003G364300 Sobic002G422300 Sobic002G422300 Sobic003G364950--Sobic002G422300 Sobic003G364000 Sobic003G364000 Sobic003G364950--Sobic003G364000 Sobic002G004900 Sobic002G004900 Sobic003G364950--Sobic002G004900 Sobic008G157800--Sobic004G061701 Sobic008G157800--Sobic007G065900 Sobic008G157800--Sobic004G023500 Sobic008G157800--Sobic008G039501 Sobic003G344050 Sobic003G344050 Sobic008G157800--Sobic003G344050 Sobic008G157800--Sobic002G150100 Sobic007G108200 Sobic007G108200 Sobic008G157800--Sobic007G108200 Sobic010G156500 Sobic010G156500 Sobic005G213500--Sobic010G156500 Sobic005G213500--Sobic003G364000 Sobic005G213600 Sobic005G213600 Sobic005G213500--Sobic005G213600 Sobic005G213500--Sobic003G364300 Sobic006G132900 Sobic006G132900 Sobic005G213500--Sobic006G132900 Sobic002G338500 Sobic002G338500 Sobic005G213500--Sobic002G338500 Sobic005G213500--Sobic010G043900 Sobic010G259500 Sobic010G259500 Sobic005G213500--Sobic010G259500 Sobic005G005600 Sobic005G005600 Sobic005G213500--Sobic005G005600 Sobic004G278400--Sobic003G364950 Sobic004G278400--Sobic006G214600 Sobic004G278400--Sobic004G292001 Sobic004G278400--Sobic003G364000 Sobic004G278400--Sobic003G364300 Sobic004G352301 Sobic004G352301 Sobic004G278400--Sobic004G352301 Sobic004G278400--Sobic005G213500 Sobic001G433900 Sobic001G433900 Sobic004G278400--Sobic001G433900 Sobic004G278400--Sobic005G005600 Sobic004G023500--Sobic004G061701 Sobic004G023500--Sobic008G157800 Sobic009G099400 Sobic009G099400 Sobic004G023500--Sobic009G099400 Sobic004G023500--Sobic007G065900 Sobic004G023500--Sobic003G344050 Sobic004G023500--Sobic002G150100 Sobic002G220800 Sobic002G220800 Sobic004G023500--Sobic002G220800 Sobic007G039600 Sobic007G039600 Sobic007G030400--Sobic007G039600 Sobic007G030400--Sobic008G170100 Sobic007G030400--Sobic005G213500 Sobic010G085500 Sobic010G085500 Sobic007G030400--Sobic010G085500 Sobic004G319100 Sobic004G319100 Sobic007G030400--Sobic004G319100 Sobic007G030400--Sobic010G259500 Sobic007G030400--Sobic010G043900 Sobic007G030400--Sobic003G364950 Sobic007G030400--Sobic003G364000
Octagon: transcription factors


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