Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G143600.1
Synonym AT-P5R, AT-P5C1, P5CR, EMB2772
Functional annotation pyrroline-5-carboxylate reductase, putative, expressed
UniProt A0A1B6PHT0
Pfam PF03807
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G14800 : pyrroline-5- carboxylate (P5C) reductase
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g71990.1 : pyrroline-5-carboxylate reductase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.007G143600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.007G217200 (28.4% identity with SbCCoAOMT/37.4% similarity) unlikely to have any significant CCoAOMT activity.(PubMedID : 27457122)@Functions are not investigated(PubMedID : 29721721)@caffeoyl-CoA O-methyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G143600 Sobic007G143600 Sobic001G182400 Sobic001G182400 Sobic007G143600--Sobic001G182400 Sobic003G174500 Sobic003G174500 Sobic007G143600--Sobic003G174500 Sobic010G129100 Sobic010G129100 Sobic007G143600--Sobic010G129100 Sobic004G206600 Sobic004G206600 Sobic007G143600--Sobic004G206600 Sobic001G261452 Sobic001G261452 Sobic007G143600--Sobic001G261452 Sobic003G139050 Sobic003G139050 Sobic007G143600--Sobic003G139050 Sobic003G267200 Sobic003G267200 Sobic007G143600--Sobic003G267200 Sobic002G181500 Sobic002G181500 Sobic007G143600--Sobic002G181500 Sobic005G196533 Sobic005G196533 Sobic007G143600--Sobic005G196533 Sobic001G329001 Sobic001G329001 Sobic001G182400--Sobic001G329001 Sobic001G182400--Sobic007G143600 Sobic002G086700 Sobic002G086700 Sobic001G182400--Sobic002G086700 Sobic004G358150 Sobic004G358150 Sobic001G182400--Sobic004G358150 Sobic009G136950 Sobic009G136950 Sobic001G182400--Sobic009G136950 Sobic008G177100 Sobic008G177100 Sobic001G182400--Sobic008G177100 Sobic002G076300 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Octagon: transcription factors


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