Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G143900.1
Synonym Sb07g021900
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YLP1
Pfam -
Panther DB PTHR33124 PTHR33124:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g34510.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.007G143900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G115400 ZOS4-08 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
2 Sobic.009G066000 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
3 Sobic.003G384100 ZIP4/SPO22, putative, expressed -
4 Sobic.007G139950 - -
5 Sobic.007G220066 - -
6 Sobic.002G105501 - -
7 Sobic.004G056100 expressed protein -
8 Sobic.010G046200 NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G399166 - -
10 Sobic.010G237200 DUF292 domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G331550 - -
12 Sobic.007G172900 expressed protein -
13 Sobic.005G008700 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.005G163450 - -
15 Sobic.003G386350 - -
16 Sobic.003G162200 IPP transferase, putative, expressed K10760: adenylate dimethylallyltransferase (cytokinin synthase)
17 Sobic.005G151000 protein kinase domain containing protein, expressed -
18 Sobic.002G341400 expressed protein -
19 Sobic.003G049100 prolyl 4-hydroxylase, putative, expressed K00472: prolyl 4-hydroxylase
20 Sobic.003G089900 seven in absentia protein family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G143900 Sobic007G143900 Sobic006G115400 Sobic006G115400 Sobic007G143900--Sobic006G115400 Sobic009G066000 Sobic009G066000 Sobic007G143900--Sobic009G066000 Sobic003G384100 Sobic003G384100 Sobic007G143900--Sobic003G384100 Sobic007G139950 Sobic007G139950 Sobic007G143900--Sobic007G139950 Sobic007G220066 Sobic007G220066 Sobic007G143900--Sobic007G220066 Sobic002G105501 Sobic002G105501 Sobic007G143900--Sobic002G105501 Sobic004G056100 Sobic004G056100 Sobic007G143900--Sobic004G056100 Sobic010G046200 Sobic010G046200 Sobic007G143900--Sobic010G046200 Sobic003G399166 Sobic003G399166 Sobic007G143900--Sobic003G399166 Sobic006G115400--Sobic007G139950 Sobic006G115400--Sobic009G066000 Sobic003G331550 Sobic003G331550 Sobic006G115400--Sobic003G331550 Sobic003G162200 Sobic003G162200 Sobic006G115400--Sobic003G162200 Sobic006G115400--Sobic007G220066 Sobic006G115400--Sobic002G105501 Sobic002G341400 Sobic002G341400 Sobic006G115400--Sobic002G341400 Sobic007G172900 Sobic007G172900 Sobic006G115400--Sobic007G172900 Sobic003G049100 Sobic003G049100 Sobic006G115400--Sobic003G049100 Sobic009G066000--Sobic007G139950 Sobic009G066000--Sobic007G220066 Sobic009G066000--Sobic002G105501 Sobic009G066000--Sobic006G115400 Sobic009G066000--Sobic003G331550 Sobic009G066000--Sobic003G162200 Sobic009G066000--Sobic002G341400 Sobic009G066000--Sobic010G046200 Sobic009G066000--Sobic004G056100 Sobic002G074500 Sobic002G074500 Sobic003G384100--Sobic002G074500 Sobic010G237200 Sobic010G237200 Sobic003G384100--Sobic010G237200 Sobic003G063500 Sobic003G063500 Sobic003G384100--Sobic003G063500 Sobic003G384100--Sobic007G143900 Sobic002G239800 Sobic002G239800 Sobic003G384100--Sobic002G239800 Sobic002G095800 Sobic002G095800 Sobic003G384100--Sobic002G095800 Sobic003G384100--Sobic007G172900 Sobic004G041000 Sobic004G041000 Sobic003G384100--Sobic004G041000 Sobic003G384100--Sobic010G046200 Sobic007G139950--Sobic009G066000 Sobic007G139950--Sobic003G331550 Sobic007G139950--Sobic006G115400 Sobic007G139950--Sobic003G162200 Sobic007G139950--Sobic007G220066 Sobic007G139950--Sobic002G105501 Sobic007G139950--Sobic002G341400 Sobic007G141001 Sobic007G141001 Sobic007G139950--Sobic007G141001 Sobic007G139950--Sobic003G049100 Sobic007G220066--Sobic002G105501 Sobic007G220066--Sobic009G066000 Sobic007G220066--Sobic007G139950 Sobic009G096566 Sobic009G096566 Sobic007G220066--Sobic009G096566 Sobic007G220066--Sobic006G115400 Sobic003G386350 Sobic003G386350 Sobic007G220066--Sobic003G386350 Sobic004G349500 Sobic004G349500 Sobic007G220066--Sobic004G349500 Sobic007G220066--Sobic003G331550 Sobic007G220066--Sobic010G046200 Sobic002G105501--Sobic007G220066 Sobic002G105501--Sobic009G066000 Sobic002G105501--Sobic007G139950 Sobic002G105501--Sobic009G096566 Sobic002G105501--Sobic006G115400 Sobic002G105501--Sobic003G386350 Sobic002G105501--Sobic004G349500 Sobic002G105501--Sobic003G331550 Sobic002G105501--Sobic010G046200 Sobic004G056100--Sobic007G172900 Sobic004G056100--Sobic009G066000 Sobic004G056100--Sobic007G139950 Sobic004G056100--Sobic003G331550 Sobic004G056100--Sobic006G115400 Sobic004G056100--Sobic007G220066 Sobic004G056100--Sobic002G105501 Sobic004G056100--Sobic002G341400 Sobic005G008700 Sobic005G008700 Sobic004G056100--Sobic005G008700 Sobic010G046200--Sobic003G386350 Sobic010G046200--Sobic003G331550 Sobic010G046200--Sobic009G066000 Sobic010G046200--Sobic007G139950 Sobic010G046200--Sobic006G115400 Sobic010G046200--Sobic007G220066 Sobic010G046200--Sobic002G105501 Sobic010G046200--Sobic007G172900 Sobic009G244450 Sobic009G244450 Sobic010G046200--Sobic009G244450 Sobic005G163450 Sobic005G163450 Sobic003G399166--Sobic005G163450 Sobic001G307450 Sobic001G307450 Sobic003G399166--Sobic001G307450 Sobic005G156800 Sobic005G156800 Sobic003G399166--Sobic005G156800 Sobic002G380750 Sobic002G380750 Sobic003G399166--Sobic002G380750 Sobic007G120100 Sobic007G120100 Sobic003G399166--Sobic007G120100 Sobic003G063600 Sobic003G063600 Sobic003G399166--Sobic003G063600 Sobic001G452400 Sobic001G452400 Sobic003G399166--Sobic001G452400 Sobic003G291050 Sobic003G291050 Sobic003G399166--Sobic003G291050 Sobic003G303000 Sobic003G303000 Sobic003G399166--Sobic003G303000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.