Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G150500.3
Synonym ARR11
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RB51
Pfam -
Panther DB PTHR26402 PTHR26402:SF585
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G67710 : response regulator 11
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g35670.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a005740
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G357950 - -
2 Sobic.009G115950 - -
3 Sobic.006G003800 no apical meristem protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G211801 - -
5 Sobic.005G198400 FHA domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.005G110466 - K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
7 Sobic.005G150300 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G221350 - -
9 Sobic.003G325800 ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed -
10 Sobic.003G355700 BBTI13 - Bowman-Birk type bran trypsin inhibitor precursor, expressed -
11 Sobic.002G302200 expressed protein -
12 Sobic.003G414000 OsFBX1 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G274025 - -
14 Sobic.003G294800 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.005G188800 - -
16 Sobic.005G147500 - -
17 Sobic.006G264800 GASR6 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
18 Sobic.009G112200 OsFBX361 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G172100 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.001G284700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G150500 Sobic007G150500 Sobic002G357950 Sobic002G357950 Sobic007G150500--Sobic002G357950 Sobic009G115950 Sobic009G115950 Sobic007G150500--Sobic009G115950 Sobic006G003800 Sobic006G003800 Sobic007G150500--Sobic006G003800 Sobic005G211801 Sobic005G211801 Sobic007G150500--Sobic005G211801 Sobic005G198400 Sobic005G198400 Sobic007G150500--Sobic005G198400 Sobic005G110466 Sobic005G110466 Sobic007G150500--Sobic005G110466 Sobic005G150300 Sobic005G150300 Sobic007G150500--Sobic005G150300 Sobic001G221350 Sobic001G221350 Sobic007G150500--Sobic001G221350 Sobic003G325800 Sobic003G325800 Sobic007G150500--Sobic003G325800 Sobic002G357950--Sobic003G325800 Sobic005G176800 Sobic005G176800 Sobic002G357950--Sobic005G176800 Sobic001G274025 Sobic001G274025 Sobic002G357950--Sobic001G274025 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic002G357950--Sobic001G284700 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic002G357950--Sobic006G264800 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic002G357950--Sobic001G489075 Sobic009G021400 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Octagon: transcription factors


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