Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G188500.1
Synonym Sb07g025830
Functional annotation plant protein of unknown function domain containing protein, expressed
UniProt C5YHM2
Pfam PF03140
Panther DB PTHR31549 PTHR31549:SF28
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G50170 : Plant protein of unknown function (DUF247)
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g42570.1 : plant protein of unknown function domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033598
Brachypodium KQJ99173 , KQJ99175
Barley HORVU7Hr1G055340.8 , HORVU7Hr1G055340.7
Wheat TraesCS7D02G265300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G018000 - -
2 Sobic.002G320300 MYB family transcription factor, putative, expressed -
3 Sobic.003G049000 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
4 Sobic.003G247100 aspartic proteinase oryzasin-1 precursor, putative, expressed K08245: phytepsin
5 Sobic.005G211801 - -
6 Sobic.002G018250 - -
7 Sobic.004G292833 - -
8 Sobic.001G220600 - -
9 Sobic.005G102600 - -
10 Sobic.001G445300 - -
11 Sobic.007G066566 - -
12 Sobic.010G169500 - -
13 Sobic.005G150200 OsFBX1 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G203900 PME/invertase inhibitor, putative, expressed -
15 Sobic.007G025200 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
16 Sobic.010G200100 AP2 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.010G233500 vignain precursor, putative, expressed -
18 Sobic.010G079200 transmembrane anterior posterior transformation 1, putative, expressed -
19 Sobic.010G207450 - -
20 Sobic.001G197700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G188500 Sobic007G188500 Sobic002G018000 Sobic002G018000 Sobic007G188500--Sobic002G018000 Sobic002G320300 Sobic002G320300 Sobic007G188500--Sobic002G320300 Sobic003G049000 Sobic003G049000 Sobic007G188500--Sobic003G049000 Sobic003G247100 Sobic003G247100 Sobic007G188500--Sobic003G247100 Sobic005G211801 Sobic005G211801 Sobic007G188500--Sobic005G211801 Sobic002G018250 Sobic002G018250 Sobic007G188500--Sobic002G018250 Sobic004G292833 Sobic004G292833 Sobic007G188500--Sobic004G292833 Sobic001G220600 Sobic001G220600 Sobic007G188500--Sobic001G220600 Sobic005G102600 Sobic005G102600 Sobic007G188500--Sobic005G102600 Sobic002G018000--Sobic004G292833 Sobic010G200100 Sobic010G200100 Sobic002G018000--Sobic010G200100 Sobic002G018000--Sobic001G220600 Sobic002G018000--Sobic002G018250 Sobic001G445300 Sobic001G445300 Sobic002G018000--Sobic001G445300 Sobic005G150200 Sobic005G150200 Sobic002G018000--Sobic005G150200 Sobic001G197700 Sobic001G197700 Sobic002G018000--Sobic001G197700 Sobic004G326700 Sobic004G326700 Sobic002G018000--Sobic004G326700 Sobic008G037100 Sobic008G037100 Sobic002G018000--Sobic008G037100 Sobic003G231200 Sobic003G231200 Sobic002G320300--Sobic003G231200 Sobic002G320300--Sobic003G247100 Sobic002G059100 Sobic002G059100 Sobic002G320300--Sobic002G059100 Sobic010G207450 Sobic010G207450 Sobic002G320300--Sobic010G207450 Sobic006G022301 Sobic006G022301 Sobic002G320300--Sobic006G022301 Sobic001G297300 Sobic001G297300 Sobic002G320300--Sobic001G297300 Sobic010G010600 Sobic010G010600 Sobic002G320300--Sobic010G010600 Sobic001G059800 Sobic001G059800 Sobic002G320300--Sobic001G059800 Sobic002G029200 Sobic002G029200 Sobic002G320300--Sobic002G029200 Sobic003G049000--Sobic005G102600 Sobic004G041000 Sobic004G041000 Sobic003G049000--Sobic004G041000 Sobic005G050700 Sobic005G050700 Sobic003G049000--Sobic005G050700 Sobic001G122700 Sobic001G122700 Sobic003G049000--Sobic001G122700 Sobic005G149650 Sobic005G149650 Sobic003G049000--Sobic005G149650 Sobic003G049000--Sobic002G018250 Sobic010G058400 Sobic010G058400 Sobic003G049000--Sobic010G058400 Sobic003G049000--Sobic002G018000 Sobic001G127600 Sobic001G127600 Sobic003G049000--Sobic001G127600 Sobic002G193000 Sobic002G193000 Sobic003G247100--Sobic002G193000 Sobic003G247100--Sobic002G320300 Sobic003G247100--Sobic010G207450 Sobic003G247100--Sobic003G231200 Sobic003G247100--Sobic002G059100 Sobic003G247100--Sobic006G022301 Sobic003G247100--Sobic005G102600 Sobic003G247100--Sobic001G297300 Sobic003G247100--Sobic002G018250 Sobic010G225950 Sobic010G225950 Sobic005G211801--Sobic010G225950 Sobic010G169500 Sobic010G169500 Sobic005G211801--Sobic010G169500 Sobic005G211801--Sobic002G018000 Sobic009G244800 Sobic009G244800 Sobic005G211801--Sobic009G244800 Sobic005G211801--Sobic004G326700 Sobic002G007300 Sobic002G007300 Sobic005G211801--Sobic002G007300 Sobic005G162100 Sobic005G162100 Sobic005G211801--Sobic005G162100 Sobic002G354300 Sobic002G354300 Sobic005G211801--Sobic002G354300 Sobic002G300800 Sobic002G300800 Sobic005G211801--Sobic002G300800 Sobic002G018250--Sobic010G207450 Sobic002G018250--Sobic010G200100 Sobic002G018250--Sobic001G220600 Sobic002G018250--Sobic005G102600 Sobic002G141050 Sobic002G141050 Sobic002G018250--Sobic002G141050 Sobic006G080200 Sobic006G080200 Sobic002G018250--Sobic006G080200 Sobic002G018250--Sobic002G059100 Sobic010G069700 Sobic010G069700 Sobic002G018250--Sobic010G069700 Sobic002G018250--Sobic002G018000 Sobic004G292833--Sobic001G220600 Sobic004G292833--Sobic010G200100 Sobic004G292833--Sobic008G037100 Sobic004G292833--Sobic002G018000 Sobic008G164101 Sobic008G164101 Sobic004G292833--Sobic008G164101 Sobic003G414000 Sobic003G414000 Sobic004G292833--Sobic003G414000 Sobic007G209700 Sobic007G209700 Sobic004G292833--Sobic007G209700 Sobic003G325800 Sobic003G325800 Sobic004G292833--Sobic003G325800 Sobic009G014900 Sobic009G014900 Sobic004G292833--Sobic009G014900 Sobic001G220600--Sobic004G292833 Sobic001G220600--Sobic010G200100 Sobic001G220600--Sobic006G080200 Sobic001G220600--Sobic008G037100 Sobic001G220600--Sobic002G018250 Sobic009G117700 Sobic009G117700 Sobic001G220600--Sobic009G117700 Sobic001G220600--Sobic002G018000 Sobic005G003001 Sobic005G003001 Sobic001G220600--Sobic005G003001 Sobic003G159850 Sobic003G159850 Sobic001G220600--Sobic003G159850 Sobic005G102600--Sobic001G122700 Sobic005G102600--Sobic001G127600 Sobic009G185000 Sobic009G185000 Sobic005G102600--Sobic009G185000 Sobic002G282800 Sobic002G282800 Sobic005G102600--Sobic002G282800 Sobic005G102600--Sobic002G018250 Sobic005G102600--Sobic010G207450 Sobic002G089300 Sobic002G089300 Sobic005G102600--Sobic002G089300 Sobic001G090900 Sobic001G090900 Sobic005G102600--Sobic001G090900 Sobic010G248150 Sobic010G248150 Sobic005G102600--Sobic010G248150
Octagon: transcription factors


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