Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G233500.1
Synonym Sb10g027570
Functional annotation vignain precursor, putative, expressed
UniProt C5Z872
Pfam PF08246 PF00112
Panther DB PTHR12411 PTHR12411:SF366
NCBI CDD KOG1543; Cysteine proteinase Cathepsin L
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008234; cysteine-type peptidase activity GO:0006508proteolysis


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G48340 : Cysteine proteinases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g14900.1 : thiol protease SEN102 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a005623
Brachypodium KQK03308 , KQJ94886
Barley HORVU1Hr1G084510.3 , HORVU1Hr1G084510.2 , HORVU5Hr1G095580.2 , HORVU5Hr1G095580.3 , HORVU5Hr1G095580.4 , HORVU5Hr1G095580.1 , HORVU1Hr1G084510.1
Wheat TraesCS2A02G543500 , TraesCS2B02G573700 , TraesCS5D02G401300 , TraesCS2D02G544800
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.004G048400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G233500 Sobic010G233500 Sobic008G045700 Sobic008G045700 Sobic010G233500--Sobic008G045700 Sobic007G066566 Sobic007G066566 Sobic010G233500--Sobic007G066566 Sobic009G210700 Sobic009G210700 Sobic010G233500--Sobic009G210700 Sobic006G139400 Sobic006G139400 Sobic010G233500--Sobic006G139400 Sobic003G238900 Sobic003G238900 Sobic010G233500--Sobic003G238900 Sobic008G184400 Sobic008G184400 Sobic010G233500--Sobic008G184400 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic010G233500--Sobic001G323500 Sobic001G438300 Sobic001G438300 Sobic010G233500--Sobic001G438300 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic010G233500--Sobic005G148700 Sobic008G045700--Sobic009G210700 Sobic008G045700--Sobic001G438300 Sobic008G045700--Sobic006G139400 Sobic007G040500 Sobic007G040500 Sobic008G045700--Sobic007G040500 Sobic001G183300 Sobic001G183300 Sobic008G045700--Sobic001G183300 Sobic008G045700--Sobic001G323500 Sobic008G045700--Sobic003G238900 Sobic004G048400 Sobic004G048400 Sobic008G045700--Sobic004G048400 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic008G045700--Sobic005G082400 Sobic007G025200 Sobic007G025200 Sobic007G066566--Sobic007G025200 Sobic005G174100 Sobic005G174100 Sobic007G066566--Sobic005G174100 Sobic007G066566--Sobic010G233500 Sobic007G066566--Sobic005G148700 Sobic007G066566--Sobic001G323500 Sobic007G066566--Sobic007G040500 Sobic007G066566--Sobic001G438300 Sobic007G066566--Sobic005G082400 Sobic007G066566--Sobic008G045700 Sobic009G210700--Sobic006G139400 Sobic009G210700--Sobic003G238900 Sobic009G210700--Sobic008G045700 Sobic009G210700--Sobic001G438300 Sobic003G207800 Sobic003G207800 Sobic009G210700--Sobic003G207800 Sobic003G167566 Sobic003G167566 Sobic009G210700--Sobic003G167566 Sobic009G210700--Sobic001G183300 Sobic005G213900 Sobic005G213900 Sobic009G210700--Sobic005G213900 Sobic009G210700--Sobic007G040500 Sobic006G139400--Sobic009G210700 Sobic006G139400--Sobic003G238900 Sobic005G177200 Sobic005G177200 Sobic006G139400--Sobic005G177200 Sobic006G139400--Sobic008G045700 Sobic008G069000 Sobic008G069000 Sobic006G139400--Sobic008G069000 Sobic008G181200 Sobic008G181200 Sobic006G139400--Sobic008G181200 Sobic005G037800 Sobic005G037800 Sobic006G139400--Sobic005G037800 Sobic006G139400--Sobic001G323500 Sobic006G139400--Sobic003G167566 Sobic003G238900--Sobic009G210700 Sobic003G238900--Sobic006G139400 Sobic003G238900--Sobic003G167566 Sobic003G238900--Sobic008G069000 Sobic003G238900--Sobic008G045700 Sobic005G058400 Sobic005G058400 Sobic003G238900--Sobic005G058400 Sobic005G174800 Sobic005G174800 Sobic003G238900--Sobic005G174800 Sobic003G238900--Sobic003G207800 Sobic008G069600 Sobic008G069600 Sobic003G238900--Sobic008G069600 Sobic008G184400--Sobic005G037800 Sobic002G049800 Sobic002G049800 Sobic008G184400--Sobic002G049800 Sobic008G184400--Sobic005G177200 Sobic008G184400--Sobic008G181200 Sobic010G137700 Sobic010G137700 Sobic008G184400--Sobic010G137700 Sobic008G184400--Sobic001G323500 Sobic008G184400--Sobic006G139400 Sobic008G184400--Sobic008G069000 Sobic002G238900 Sobic002G238900 Sobic008G184400--Sobic002G238900 Sobic009G017732 Sobic009G017732 Sobic001G323500--Sobic009G017732 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic001G323500--Sobic006G276401 Sobic001G323500--Sobic005G148700 Sobic001G323500--Sobic005G177200 Sobic001G323500--Sobic005G082400 Sobic001G323500--Sobic008G045700 Sobic001G323500--Sobic006G139400 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic001G323500--Sobic005G141500 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic001G323500--Sobic005G221200 Sobic001G438300--Sobic007G040500 Sobic001G438300--Sobic004G048400 Sobic001G438300--Sobic001G183300 Sobic008G135800 Sobic008G135800 Sobic001G438300--Sobic008G135800 Sobic001G438300--Sobic008G045700 Sobic001G438300--Sobic009G210700 Sobic001G438300--Sobic005G082400 Sobic001G438300--Sobic003G207800 Sobic005G133100 Sobic005G133100 Sobic001G438300--Sobic005G133100 Sobic005G148700--Sobic006G276401 Sobic005G148700--Sobic005G221200 Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic005G148700--Sobic009G039700 Sobic005G148700--Sobic005G141500 Sobic005G148700--Sobic001G323500 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic005G148700--Sobic005G174600 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic005G148700--Sobic005G109900 Sobic005G147700 Sobic005G147700 Sobic005G148700--Sobic005G147700 Sobic004G017700 Sobic004G017700 Sobic005G148700--Sobic004G017700
Octagon: transcription factors


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