Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G025200.1
Synonym RGE1, ZOU, Sb07g002200
Functional annotation basic helix-loop-helix, putative, expressed
UniProt C5YMJ4
Pfam PF00010
Panther DB PTHR11514 PTHR11514:SF57
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G49770 : basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g34320.1 : basic helix-loop-helix, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040333
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.001G323500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic007G025200 Sobic007G025200 Sobic005G174100 Sobic005G174100 Sobic007G025200--Sobic005G174100 Sobic007G066566 Sobic007G066566 Sobic007G025200--Sobic007G066566 Sobic005G146200 Sobic005G146200 Sobic007G025200--Sobic005G146200 Sobic004G017700 Sobic004G017700 Sobic007G025200--Sobic004G017700 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic007G025200--Sobic005G148700 Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic007G025200--Sobic009G039700 Sobic005G147700 Sobic005G147700 Sobic007G025200--Sobic005G147700 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic007G025200--Sobic006G276401 Sobic004G198550 Sobic004G198550 Sobic007G025200--Sobic004G198550 Sobic005G174100--Sobic007G025200 Sobic005G174100--Sobic007G066566 Sobic005G133100 Sobic005G133100 Sobic005G174100--Sobic005G133100 Sobic007G040600 Sobic007G040600 Sobic005G174100--Sobic007G040600 Sobic005G212000 Sobic005G212000 Sobic005G174100--Sobic005G212000 Sobic008G050300 Sobic008G050300 Sobic005G174100--Sobic008G050300 Sobic004G048400 Sobic004G048400 Sobic005G174100--Sobic004G048400 Sobic010G191450 Sobic010G191450 Sobic005G174100--Sobic010G191450 Sobic007G040500 Sobic007G040500 Sobic005G174100--Sobic007G040500 Sobic007G066566--Sobic007G025200 Sobic007G066566--Sobic005G174100 Sobic010G233500 Sobic010G233500 Sobic007G066566--Sobic010G233500 Sobic007G066566--Sobic005G148700 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic007G066566--Sobic001G323500 Sobic007G066566--Sobic007G040500 Sobic001G438300 Sobic001G438300 Sobic007G066566--Sobic001G438300 Sobic005G082400 Sobic005G082400 Sobic007G066566--Sobic005G082400 Sobic008G045700 Sobic008G045700 Sobic007G066566--Sobic008G045700 Sobic005G146200--Sobic004G198550 Sobic005G146200--Sobic005G147700 Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic005G146200--Sobic005G174700 Sobic002G089600 Sobic002G089600 Sobic005G146200--Sobic002G089600 Sobic005G221300 Sobic005G221300 Sobic005G146200--Sobic005G221300 Sobic002G010700 Sobic002G010700 Sobic005G146200--Sobic002G010700 Sobic005G146200--Sobic004G017700 Sobic009G051101 Sobic009G051101 Sobic005G146200--Sobic009G051101 Sobic005G109500 Sobic005G109500 Sobic005G146200--Sobic005G109500 Sobic009G039000 Sobic009G039000 Sobic004G017700--Sobic009G039000 Sobic004G017700--Sobic005G148700 Sobic007G109000 Sobic007G109000 Sobic004G017700--Sobic007G109000 Sobic004G017700--Sobic005G147700 Sobic004G017700--Sobic006G276401 Sobic005G074700 Sobic005G074700 Sobic004G017700--Sobic005G074700 Sobic007G047000 Sobic007G047000 Sobic004G017700--Sobic007G047000 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic004G017700--Sobic005G221200 Sobic004G017700--Sobic005G082400 Sobic005G148700--Sobic006G276401 Sobic005G148700--Sobic005G221200 Sobic005G148700--Sobic009G039700 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic005G148700--Sobic005G141500 Sobic005G148700--Sobic001G323500 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic005G148700--Sobic005G174600 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic005G148700--Sobic005G109900 Sobic005G148700--Sobic005G147700 Sobic005G148700--Sobic004G017700 Sobic009G039700--Sobic005G109900 Sobic009G039700--Sobic005G221200 Sobic009G039700--Sobic005G148700 Sobic009G039700--Sobic005G141500 Sobic009G039700--Sobic005G174700 Sobic009G039700--Sobic005G174600 Sobic009G039500 Sobic009G039500 Sobic009G039700--Sobic009G039500 Sobic005G109800 Sobic005G109800 Sobic009G039700--Sobic005G109800 Sobic009G039700--Sobic006G276401 Sobic005G147700--Sobic006G276401 Sobic005G147700--Sobic005G174700 Sobic005G147700--Sobic004G198550 Sobic005G147700--Sobic005G148700 Sobic005G147700--Sobic002G089600 Sobic005G147700--Sobic009G039700 Sobic005G147700--Sobic005G082400 Sobic005G147700--Sobic005G146200 Sobic005G147700--Sobic005G221200 Sobic006G276401--Sobic005G147700 Sobic006G276401--Sobic005G148700 Sobic006G276401--Sobic001G323500 Sobic006G276401--Sobic005G221200 Sobic006G276401--Sobic005G141500 Sobic006G276401--Sobic009G039700 Sobic006G276401--Sobic005G174700 Sobic006G276401--Sobic005G082400 Sobic006G276401--Sobic005G109900 Sobic004G198550--Sobic005G146200 Sobic004G198550--Sobic005G221300 Sobic004G198550--Sobic005G147700 Sobic004G198550--Sobic002G089600 Sobic007G205300 Sobic007G205300 Sobic004G198550--Sobic007G205300 Sobic004G198550--Sobic005G174700 Sobic004G198550--Sobic009G039000 Sobic004G198550--Sobic006G276401 Sobic004G198550--Sobic004G017700
Octagon: transcription factors


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