Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G192000.2,Sobic.007G192000.1
Synonym ACR4, Sb07g026100
Functional annotation ACR5, putative, expressed
UniProt C5YHR5 , A0A1Z5RBH0
Pfam PF01842
Panther DB PTHR31096 PTHR31096:SF15
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016597; amino acid binding GO:0008152metabolic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G76990 : ACT domain repeat 3,ACT domain repeat 4
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g42080.1 : ACR5, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a030433 , Zm00025a005280
Brachypodium KQJ99142
Barley HORVU7Hr1G054610.11 , HORVU7Hr1G054610.10 , HORVU7Hr1G054610.1 , HORVU7Hr1G054610.3 , HORVU7Hr1G054610.2
Wheat TraesCS7A02G261700 , TraesCS7D02G262700 , TraesCS7B02G159600
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G185300 dynein light chain type 1 domain containing protein, expressed K10418: dynein light chain LC8-type
2 Sobic.009G259800 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10664: E3 ubiquitin-protein ligase ATL6/9/15/31/42/55
3 Sobic.002G003400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
4 Sobic.006G196400 U-box, putative, expressed -
5 Sobic.005G080600 RCLEA2 - Root cap and Late embryogenesis related family protein precursor, putative, expressed -
6 Sobic.007G020700 ACT domain containing protein, expressed -
7 Sobic.003G426200 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
8 Sobic.009G058400 expressed protein -
9 Sobic.004G008600 receptor protein kinase CLAVATA1 precursor, putative, expressed -
10 Sobic.005G175900 expressed protein -
11 Sobic.007G220400 receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
12 Sobic.003G426500 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
13 Sobic.007G090600 CSLC3 - cellulose synthase-like family C, expressed -
14 Sobic.009G032900 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
15 Sobic.009G079900 endoglucanase precursor, putative, expressed -
16 Sobic.005G216500 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G128800 expansin precursor, putative, expressed -
18 Sobic.006G201000 WRKY37, expressed -
19 Sobic.010G269000 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
20 Sobic.005G052700 ZOS11-01 - C2H2 zinc finger protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G192000 Sobic007G192000 Sobic003G185300 Sobic003G185300 Sobic007G192000--Sobic003G185300 Sobic009G259800 Sobic009G259800 Sobic007G192000--Sobic009G259800 Sobic002G003400 Sobic002G003400 Sobic007G192000--Sobic002G003400 Sobic006G196400 Sobic006G196400 Sobic007G192000--Sobic006G196400 Sobic005G080600 Sobic005G080600 Sobic007G192000--Sobic005G080600 Sobic007G020700 Sobic007G020700 Sobic007G192000--Sobic007G020700 Sobic003G426200 Sobic003G426200 Sobic007G192000--Sobic003G426200 Sobic009G058400 Sobic009G058400 Sobic007G192000--Sobic009G058400 Sobic004G008600 Sobic004G008600 Sobic007G192000--Sobic004G008600 Sobic003G185300--Sobic009G259800 Sobic002G068000 Sobic002G068000 Sobic003G185300--Sobic002G068000 Sobic009G032900 Sobic009G032900 Sobic003G185300--Sobic009G032900 Sobic010G158400 Sobic010G158400 Sobic003G185300--Sobic010G158400 Sobic003G185300--Sobic005G080600 Sobic003G426500 Sobic003G426500 Sobic003G185300--Sobic003G426500 Sobic005G216500 Sobic005G216500 Sobic003G185300--Sobic005G216500 Sobic003G269900 Sobic003G269900 Sobic003G185300--Sobic003G269900 Sobic005G115300 Sobic005G115300 Sobic003G185300--Sobic005G115300 Sobic009G259800--Sobic005G080600 Sobic009G259800--Sobic003G185300 Sobic007G206800 Sobic007G206800 Sobic009G259800--Sobic007G206800 Sobic006G019700 Sobic006G019700 Sobic009G259800--Sobic006G019700 Sobic007G100700 Sobic007G100700 Sobic009G259800--Sobic007G100700 Sobic009G259800--Sobic006G196400 Sobic009G259800--Sobic002G068000 Sobic010G234500 Sobic010G234500 Sobic009G259800--Sobic010G234500 Sobic009G259800--Sobic003G426500 Sobic005G175900 Sobic005G175900 Sobic002G003400--Sobic005G175900 Sobic001G232000 Sobic001G232000 Sobic002G003400--Sobic001G232000 Sobic002G003400--Sobic006G196400 Sobic002G115600 Sobic002G115600 Sobic002G003400--Sobic002G115600 Sobic007G090600 Sobic007G090600 Sobic002G003400--Sobic007G090600 Sobic009G060700 Sobic009G060700 Sobic002G003400--Sobic009G060700 Sobic001G263300 Sobic001G263300 Sobic002G003400--Sobic001G263300 Sobic002G003400--Sobic004G008600 Sobic002G118900 Sobic002G118900 Sobic002G003400--Sobic002G118900 Sobic006G031100 Sobic006G031100 Sobic006G196400--Sobic006G031100 Sobic006G196400--Sobic007G090600 Sobic006G196400--Sobic005G080600 Sobic003G240400 Sobic003G240400 Sobic006G196400--Sobic003G240400 Sobic003G215300 Sobic003G215300 Sobic006G196400--Sobic003G215300 Sobic006G196400--Sobic002G115600 Sobic006G196400--Sobic005G175900 Sobic010G082000 Sobic010G082000 Sobic006G196400--Sobic010G082000 Sobic006G205700 Sobic006G205700 Sobic006G196400--Sobic006G205700 Sobic005G080600--Sobic007G206800 Sobic005G080600--Sobic006G196400 Sobic007G220400 Sobic007G220400 Sobic005G080600--Sobic007G220400 Sobic002G391400 Sobic002G391400 Sobic005G080600--Sobic002G391400 Sobic005G080600--Sobic009G259800 Sobic004G119800 Sobic004G119800 Sobic005G080600--Sobic004G119800 Sobic002G334000 Sobic002G334000 Sobic005G080600--Sobic002G334000 Sobic005G080600--Sobic002G068000 Sobic010G241900 Sobic010G241900 Sobic005G080600--Sobic010G241900 Sobic002G029600 Sobic002G029600 Sobic007G020700--Sobic002G029600 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic007G020700--Sobic005G071900 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic007G020700--Sobic006G009700 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic007G020700--Sobic004G312500 Sobic007G020700--Sobic009G060700 Sobic002G019100 Sobic002G019100 Sobic007G020700--Sobic002G019100 Sobic006G108300 Sobic006G108300 Sobic007G020700--Sobic006G108300 Sobic009G079900 Sobic009G079900 Sobic007G020700--Sobic009G079900 Sobic003G079100 Sobic003G079100 Sobic007G020700--Sobic003G079100 Sobic003G426200--Sobic006G205700 Sobic003G426200--Sobic002G391400 Sobic008G022100 Sobic008G022100 Sobic003G426200--Sobic008G022100 Sobic003G167300 Sobic003G167300 Sobic003G426200--Sobic003G167300 Sobic003G426200--Sobic007G206800 Sobic003G426200--Sobic002G115600 Sobic003G426200--Sobic010G241900 Sobic003G426200--Sobic007G220400 Sobic003G426200--Sobic009G259800 Sobic005G052700 Sobic005G052700 Sobic009G058400--Sobic005G052700 Sobic009G058400--Sobic007G090600 Sobic009G058400--Sobic009G060700 Sobic009G208700 Sobic009G208700 Sobic009G058400--Sobic009G208700 Sobic004G014600 Sobic004G014600 Sobic009G058400--Sobic004G014600 Sobic005G222600 Sobic005G222600 Sobic009G058400--Sobic005G222600 Sobic009G058400--Sobic007G220400 Sobic009G058400--Sobic002G003400 Sobic009G058400--Sobic002G115600 Sobic010G269000 Sobic010G269000 Sobic004G008600--Sobic010G269000 Sobic005G134200 Sobic005G134200 Sobic004G008600--Sobic005G134200 Sobic004G008600--Sobic005G216500 Sobic003G046700 Sobic003G046700 Sobic004G008600--Sobic003G046700 Sobic005G226350 Sobic005G226350 Sobic004G008600--Sobic005G226350 Sobic005G120900 Sobic005G120900 Sobic004G008600--Sobic005G120900 Sobic004G008600--Sobic007G220400 Sobic005G226400 Sobic005G226400 Sobic004G008600--Sobic005G226400 Sobic010G191700 Sobic010G191700 Sobic004G008600--Sobic010G191700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.