Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G017400.1
Synonym Sb08g001510
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YQN2
Pfam -
Panther DB PTHR36794 PTHR36794:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G09270 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g64190.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a026754
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G163033 - -
2 Sobic.003G123800 expressed protein -
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6 Sobic.004G279900 tRNA-splicing endonuclease positive effector-related, putative, expressed K10706: SETX, senataxin
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13 Sobic.007G002400 - -
14 Sobic.001G196950 - -
15 Sobic.001G013701 - -
16 Sobic.007G079500 hypothetical protein -
17 Sobic.006G174000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cis-zeatin O-glucosyltransferase, putative, expressed K13495: cis-zeatin O-glucosyltransferase
18 Sobic.010G079150 - -
19 Sobic.001G250150 - -
20 Sobic.001G476201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G017400 Sobic008G017400 Sobic006G163033 Sobic006G163033 Sobic008G017400--Sobic006G163033 Sobic003G123800 Sobic003G123800 Sobic008G017400--Sobic003G123800 Sobic004G093300 Sobic004G093300 Sobic008G017400--Sobic004G093300 Sobic003G223600 Sobic003G223600 Sobic008G017400--Sobic003G223600 Sobic003G277850 Sobic003G277850 Sobic008G017400--Sobic003G277850 Sobic004G279900 Sobic004G279900 Sobic008G017400--Sobic004G279900 Sobic008G035300 Sobic008G035300 Sobic008G017400--Sobic008G035300 Sobic002G117300 Sobic002G117300 Sobic008G017400--Sobic002G117300 Sobic001G383600 Sobic001G383600 Sobic008G017400--Sobic001G383600 Sobic006G163033--Sobic003G223600 Sobic007G159300 Sobic007G159300 Sobic006G163033--Sobic007G159300 Sobic006G163033--Sobic004G279900 Sobic006G174000 Sobic006G174000 Sobic006G163033--Sobic006G174000 Sobic007G079500 Sobic007G079500 Sobic006G163033--Sobic007G079500 Sobic007G122866 Sobic007G122866 Sobic006G163033--Sobic007G122866 Sobic006G163033--Sobic004G093300 Sobic006G205800 Sobic006G205800 Sobic006G163033--Sobic006G205800 Sobic006G209200 Sobic006G209200 Sobic006G163033--Sobic006G209200 Sobic009G005000 Sobic009G005000 Sobic003G123800--Sobic009G005000 Sobic003G123800--Sobic004G093300 Sobic005G120466 Sobic005G120466 Sobic003G123800--Sobic005G120466 Sobic001G002900 Sobic001G002900 Sobic003G123800--Sobic001G002900 Sobic003G123800--Sobic003G277850 Sobic003G123800--Sobic006G209200 Sobic001G185700 Sobic001G185700 Sobic003G123800--Sobic001G185700 Sobic001G328850 Sobic001G328850 Sobic003G123800--Sobic001G328850 Sobic008G031800 Sobic008G031800 Sobic003G123800--Sobic008G031800 Sobic009G185601 Sobic009G185601 Sobic004G093300--Sobic009G185601 Sobic004G093300--Sobic005G120466 Sobic007G086400 Sobic007G086400 Sobic004G093300--Sobic007G086400 Sobic001G097300 Sobic001G097300 Sobic004G093300--Sobic001G097300 Sobic003G095301 Sobic003G095301 Sobic004G093300--Sobic003G095301 Sobic003G437900 Sobic003G437900 Sobic004G093300--Sobic003G437900 Sobic007G002400 Sobic007G002400 Sobic004G093300--Sobic007G002400 Sobic004G093300--Sobic003G123800 Sobic004G093300--Sobic009G005000 Sobic001G476201 Sobic001G476201 Sobic003G223600--Sobic001G476201 Sobic003G223600--Sobic004G279900 Sobic001G013701 Sobic001G013701 Sobic003G223600--Sobic001G013701 Sobic003G223600--Sobic001G383600 Sobic001G210500 Sobic001G210500 Sobic003G223600--Sobic001G210500 Sobic007G118700 Sobic007G118700 Sobic003G223600--Sobic007G118700 Sobic001G173251 Sobic001G173251 Sobic003G223600--Sobic001G173251 Sobic005G217400 Sobic005G217400 Sobic003G223600--Sobic005G217400 Sobic004G171350 Sobic004G171350 Sobic003G223600--Sobic004G171350 Sobic003G277850--Sobic003G123800 Sobic003G277850--Sobic004G093300 Sobic003G277850--Sobic009G005000 Sobic003G277850--Sobic006G209200 Sobic003G277850--Sobic001G173251 Sobic003G277850--Sobic007G079500 Sobic004G022700 Sobic004G022700 Sobic003G277850--Sobic004G022700 Sobic005G144900 Sobic005G144900 Sobic003G277850--Sobic005G144900 Sobic006G175100 Sobic006G175100 Sobic003G277850--Sobic006G175100 Sobic004G279900--Sobic001G476201 Sobic004G279900--Sobic001G013701 Sobic004G279900--Sobic001G383600 Sobic004G279900--Sobic004G093300 Sobic004G279900--Sobic003G223600 Sobic004G279900--Sobic003G095301 Sobic004G279900--Sobic006G209200 Sobic004G279900--Sobic005G120466 Sobic003G294550 Sobic003G294550 Sobic004G279900--Sobic003G294550 Sobic006G110101 Sobic006G110101 Sobic008G035300--Sobic006G110101 Sobic008G068133 Sobic008G068133 Sobic008G035300--Sobic008G068133 Sobic010G079150 Sobic010G079150 Sobic008G035300--Sobic010G079150 Sobic008G126100 Sobic008G126100 Sobic008G035300--Sobic008G126100 Sobic003G196500 Sobic003G196500 Sobic008G035300--Sobic003G196500 Sobic002G030100 Sobic002G030100 Sobic008G035300--Sobic002G030100 Sobic008G035300--Sobic008G017400 Sobic001G369550 Sobic001G369550 Sobic008G035300--Sobic001G369550 Sobic003G213500 Sobic003G213500 Sobic008G035300--Sobic003G213500 Sobic001G194401 Sobic001G194401 Sobic002G117300--Sobic001G194401 Sobic001G349300 Sobic001G349300 Sobic002G117300--Sobic001G349300 Sobic002G117300--Sobic007G122866 Sobic002G117300--Sobic008G017400 Sobic002G242100 Sobic002G242100 Sobic002G117300--Sobic002G242100 Sobic002G117300--Sobic006G163033 Sobic003G383400 Sobic003G383400 Sobic002G117300--Sobic003G383400 Sobic001G052500 Sobic001G052500 Sobic002G117300--Sobic001G052500 Sobic009G013600 Sobic009G013600 Sobic002G117300--Sobic009G013600 Sobic001G383600--Sobic001G013701 Sobic010G197632 Sobic010G197632 Sobic001G383600--Sobic010G197632 Sobic002G400050 Sobic002G400050 Sobic001G383600--Sobic002G400050 Sobic004G337132 Sobic004G337132 Sobic001G383600--Sobic004G337132 Sobic009G196500 Sobic009G196500 Sobic001G383600--Sobic009G196500 Sobic001G383600--Sobic003G294550 Sobic004G300400 Sobic004G300400 Sobic001G383600--Sobic004G300400 Sobic002G034900 Sobic002G034900 Sobic001G383600--Sobic002G034900 Sobic003G095750 Sobic003G095750 Sobic001G383600--Sobic003G095750
Octagon: transcription factors


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