Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G019700.1
Synonym Sb08g001740
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YQR2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G06670 : binding
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g03450.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028992
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G196201 - -
2 Sobic.003G038901 - -
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7 Sobic.005G190100 MBTB64 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
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11 Sobic.010G057250 - -
12 Sobic.004G319500 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
13 Sobic.003G257050 - -
14 Sobic.005G219800 - -
15 Sobic.010G111500 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
16 Sobic.002G289900 carbohydrate binding protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G364200 cytochrome P450, putative, expressed -
18 Sobic.002G277900 ki1 protein, putative, expressed -
19 Sobic.009G196100 dof zinc finger domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G022000 hydrolase, putative, expressed K14664: IAA-amino acid hydrolase


Gene co-expression network
sample Sobic008G019700 Sobic008G019700 Sobic007G196201 Sobic007G196201 Sobic008G019700--Sobic007G196201 Sobic003G038901 Sobic003G038901 Sobic008G019700--Sobic003G038901 Sobic001G181300 Sobic001G181300 Sobic008G019700--Sobic001G181300 Sobic005G019900 Sobic005G019900 Sobic008G019700--Sobic005G019900 Sobic007G090418 Sobic007G090418 Sobic008G019700--Sobic007G090418 Sobic001G080500 Sobic001G080500 Sobic008G019700--Sobic001G080500 Sobic005G190100 Sobic005G190100 Sobic008G019700--Sobic005G190100 Sobic003G201800 Sobic003G201800 Sobic008G019700--Sobic003G201800 Sobic002G156700 Sobic002G156700 Sobic008G019700--Sobic002G156700 Sobic007G196201--Sobic003G038901 Sobic009G117800 Sobic009G117800 Sobic007G196201--Sobic009G117800 Sobic002G018166 Sobic002G018166 Sobic007G196201--Sobic002G018166 Sobic001G022000 Sobic001G022000 Sobic007G196201--Sobic001G022000 Sobic002G078600 Sobic002G078600 Sobic007G196201--Sobic002G078600 Sobic002G303950 Sobic002G303950 Sobic007G196201--Sobic002G303950 Sobic003G391700 Sobic003G391700 Sobic007G196201--Sobic003G391700 Sobic007G196201--Sobic007G090418 Sobic010G111500 Sobic010G111500 Sobic007G196201--Sobic010G111500 Sobic003G038901--Sobic009G117800 Sobic003G038901--Sobic002G018166 Sobic001G421200 Sobic001G421200 Sobic003G038901--Sobic001G421200 Sobic003G038901--Sobic010G111500 Sobic003G038901--Sobic002G078600 Sobic003G038901--Sobic003G391700 Sobic003G038901--Sobic007G196201 Sobic003G038901--Sobic007G090418 Sobic008G059566 Sobic008G059566 Sobic003G038901--Sobic008G059566 Sobic001G270200 Sobic001G270200 Sobic001G181300--Sobic001G270200 Sobic003G125000 Sobic003G125000 Sobic001G181300--Sobic003G125000 Sobic007G165000 Sobic007G165000 Sobic001G181300--Sobic007G165000 Sobic001G288900 Sobic001G288900 Sobic001G181300--Sobic001G288900 Sobic001G149500 Sobic001G149500 Sobic001G181300--Sobic001G149500 Sobic005G161500 Sobic005G161500 Sobic001G181300--Sobic005G161500 Sobic010G132000 Sobic010G132000 Sobic001G181300--Sobic010G132000 Sobic004G133301 Sobic004G133301 Sobic001G181300--Sobic004G133301 Sobic003G039100 Sobic003G039100 Sobic001G181300--Sobic003G039100 Sobic003G407400 Sobic003G407400 Sobic005G019900--Sobic003G407400 Sobic009G196100 Sobic009G196100 Sobic005G019900--Sobic009G196100 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic005G019900--Sobic005G013700 Sobic004G325150 Sobic004G325150 Sobic005G019900--Sobic004G325150 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic005G019900--Sobic008G045100 Sobic008G078966 Sobic008G078966 Sobic005G019900--Sobic008G078966 Sobic005G025500 Sobic005G025500 Sobic005G019900--Sobic005G025500 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic005G019900--Sobic006G137900 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic005G019900--Sobic001G138500 Sobic007G090418--Sobic008G078966 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic007G090418--Sobic008G045900 Sobic009G258200 Sobic009G258200 Sobic007G090418--Sobic009G258200 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic007G090418--Sobic009G142600 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic007G090418--Sobic001G234700 Sobic003G056900 Sobic003G056900 Sobic001G080500--Sobic003G056900 Sobic001G439050 Sobic001G439050 Sobic001G080500--Sobic001G439050 Sobic002G382400 Sobic002G382400 Sobic001G080500--Sobic002G382400 Sobic004G319500 Sobic004G319500 Sobic001G080500--Sobic004G319500 Sobic003G246900 Sobic003G246900 Sobic001G080500--Sobic003G246900 Sobic001G080500--Sobic003G201800 Sobic010G120350 Sobic010G120350 Sobic001G080500--Sobic010G120350 Sobic007G185000 Sobic007G185000 Sobic001G080500--Sobic007G185000 Sobic006G001600 Sobic006G001600 Sobic001G080500--Sobic006G001600 Sobic005G190700 Sobic005G190700 Sobic005G190100--Sobic005G190700 Sobic002G070400 Sobic002G070400 Sobic005G190100--Sobic002G070400 Sobic003G161950 Sobic003G161950 Sobic005G190100--Sobic003G161950 Sobic005G190100--Sobic002G156700 Sobic001G364200 Sobic001G364200 Sobic005G190100--Sobic001G364200 Sobic006G163066 Sobic006G163066 Sobic005G190100--Sobic006G163066 Sobic002G384800 Sobic002G384800 Sobic005G190100--Sobic002G384800 Sobic002G267050 Sobic002G267050 Sobic005G190100--Sobic002G267050 Sobic002G407500 Sobic002G407500 Sobic005G190100--Sobic002G407500 Sobic003G201800--Sobic002G382400 Sobic003G201800--Sobic010G120350 Sobic002G249400 Sobic002G249400 Sobic003G201800--Sobic002G249400 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic003G201800--Sobic010G025200 Sobic001G223000 Sobic001G223000 Sobic003G201800--Sobic001G223000 Sobic003G201800--Sobic004G319500 Sobic003G201800--Sobic006G001600 Sobic003G201800--Sobic003G056900 Sobic007G180800 Sobic007G180800 Sobic003G201800--Sobic007G180800 Sobic002G156700--Sobic005G013700 Sobic002G156700--Sobic002G070400 Sobic002G156700--Sobic004G325150 Sobic002G156700--Sobic003G407400 Sobic002G156700--Sobic008G045100 Sobic002G156700--Sobic006G137900 Sobic002G046400 Sobic002G046400 Sobic002G156700--Sobic002G046400 Sobic005G005100 Sobic005G005100 Sobic002G156700--Sobic005G005100 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic002G156700--Sobic001G045300
Octagon: transcription factors


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