Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G051500.1
Synonym Sb08g004360, GATA12
Functional annotation GATA zinc finger domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PBM5
Pfam PF00320
Panther DB PTHR10071 PTHR10071:SF200
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0006355regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G66320 : GATA transcription factor 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g07120.1 : GATA zinc finger domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054029
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.008G182100 - -
20 Sobic.005G177200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G051500 Sobic008G051500 Sobic010G029800 Sobic010G029800 Sobic008G051500--Sobic010G029800 Sobic001G085200 Sobic001G085200 Sobic008G051500--Sobic001G085200 Sobic008G069000 Sobic008G069000 Sobic008G051500--Sobic008G069000 Sobic004G048300 Sobic004G048300 Sobic008G051500--Sobic004G048300 Sobic004G008700 Sobic004G008700 Sobic008G051500--Sobic004G008700 Sobic007G040900 Sobic007G040900 Sobic008G051500--Sobic007G040900 Sobic007G036400 Sobic007G036400 Sobic008G051500--Sobic007G036400 Sobic003G179300 Sobic003G179300 Sobic008G051500--Sobic003G179300 Sobic003G099800 Sobic003G099800 Sobic008G051500--Sobic003G099800 Sobic010G029800--Sobic004G008700 Sobic005G042400 Sobic005G042400 Sobic010G029800--Sobic005G042400 Sobic010G029800--Sobic008G069000 Sobic010G029800--Sobic003G099800 Sobic005G052200 Sobic005G052200 Sobic010G029800--Sobic005G052200 Sobic010G137600 Sobic010G137600 Sobic010G029800--Sobic010G137600 Sobic008G181200 Sobic008G181200 Sobic010G029800--Sobic008G181200 Sobic010G029800--Sobic007G040900 Sobic004G114700 Sobic004G114700 Sobic010G029800--Sobic004G114700 Sobic001G085200--Sobic008G051500 Sobic001G085200--Sobic010G029800 Sobic003G232332 Sobic003G232332 Sobic001G085200--Sobic003G232332 Sobic001G085200--Sobic005G052200 Sobic001G541400 Sobic001G541400 Sobic001G085200--Sobic001G541400 Sobic001G269650 Sobic001G269650 Sobic001G085200--Sobic001G269650 Sobic007G066200 Sobic007G066200 Sobic001G085200--Sobic007G066200 Sobic001G085200--Sobic004G008700 Sobic001G085200--Sobic005G042400 Sobic008G069000--Sobic010G029800 Sobic008G069000--Sobic004G048300 Sobic006G139400 Sobic006G139400 Sobic008G069000--Sobic006G139400 Sobic003G238900 Sobic003G238900 Sobic008G069000--Sobic003G238900 Sobic008G069000--Sobic004G008700 Sobic002G238900 Sobic002G238900 Sobic008G069000--Sobic002G238900 Sobic005G177200 Sobic005G177200 Sobic008G069000--Sobic005G177200 Sobic008G069000--Sobic007G040900 Sobic008G069000--Sobic008G181200 Sobic004G048300--Sobic003G179300 Sobic008G070100 Sobic008G070100 Sobic004G048300--Sobic008G070100 Sobic004G048300--Sobic007G040900 Sobic003G010000 Sobic003G010000 Sobic004G048300--Sobic003G010000 Sobic004G316200 Sobic004G316200 Sobic004G048300--Sobic004G316200 Sobic005G174800 Sobic005G174800 Sobic004G048300--Sobic005G174800 Sobic006G144201 Sobic006G144201 Sobic004G048300--Sobic006G144201 Sobic010G258900 Sobic010G258900 Sobic004G048300--Sobic010G258900 Sobic008G182100 Sobic008G182100 Sobic004G048300--Sobic008G182100 Sobic004G008700--Sobic003G099800 Sobic004G008700--Sobic010G029800 Sobic004G008700--Sobic005G042400 Sobic004G008700--Sobic007G040900 Sobic004G008700--Sobic005G052200 Sobic002G098100 Sobic002G098100 Sobic004G008700--Sobic002G098100 Sobic004G008700--Sobic004G114700 Sobic009G020000 Sobic009G020000 Sobic004G008700--Sobic009G020000 Sobic004G008700--Sobic008G069000 Sobic007G040900--Sobic003G179300 Sobic007G040900--Sobic010G258900 Sobic007G040900--Sobic008G182100 Sobic007G040900--Sobic004G048300 Sobic007G040900--Sobic008G070100 Sobic003G330800 Sobic003G330800 Sobic007G040900--Sobic003G330800 Sobic007G040900--Sobic004G316200 Sobic007G040900--Sobic003G010000 Sobic007G040900--Sobic003G099800 Sobic007G036400--Sobic005G174800 Sobic007G036400--Sobic004G048300 Sobic007G036400--Sobic008G070100 Sobic007G036400--Sobic003G010000 Sobic007G036400--Sobic006G144201 Sobic005G058400 Sobic005G058400 Sobic007G036400--Sobic005G058400 Sobic007G036400--Sobic003G179300 Sobic008G069600 Sobic008G069600 Sobic007G036400--Sobic008G069600 Sobic003G167566 Sobic003G167566 Sobic007G036400--Sobic003G167566 Sobic003G179300--Sobic008G070100 Sobic003G179300--Sobic007G040900 Sobic003G179300--Sobic010G258900 Sobic003G179300--Sobic008G182100 Sobic003G179300--Sobic004G048300 Sobic003G179300--Sobic003G010000 Sobic003G179300--Sobic003G330800 Sobic003G179300--Sobic004G316200 Sobic003G179300--Sobic006G144201 Sobic003G099800--Sobic004G008700 Sobic003G099800--Sobic002G098100 Sobic003G099800--Sobic009G020000 Sobic003G099800--Sobic007G040900 Sobic003G099800--Sobic004G114700 Sobic003G099800--Sobic005G052200 Sobic004G316300 Sobic004G316300 Sobic003G099800--Sobic004G316300 Sobic003G099800--Sobic010G258900 Sobic005G150000 Sobic005G150000 Sobic003G099800--Sobic005G150000
Octagon: transcription factors


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