Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G085200.3,Sobic.001G085200.2,Sobic.001G085200.1
Synonym Sb01g007670, PDCB3
Functional annotation X8 domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QHX8 , A0A1Z5S4U2 , A0A1Z5S4T9 , Q8LKU1
Pfam PF07983
Panther DB PTHR32227 PTHR32227:SF75
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G18650 : plasmodesmata callose-binding protein 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g54910.1 : X8 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016775 , Zm00025a027447 , Zm00025a008209
Brachypodium KQK09884 , KQK13126
Barley HORVU5Hr1G096090.9 , HORVU5Hr1G096090.8 , HORVU5Hr1G096090.3 , HORVU5Hr1G096090.2 , HORVU5Hr1G096090.1 , HORVU5Hr1G096090.7 , HORVU5Hr1G096090.6 , HORVU5Hr1G096090.5 , HORVU5Hr1G096090.4 , HORVU3Hr1G074010.1 , HORVU3Hr1G074010.3 , HORVU3Hr1G074010.2 , HORVU5Hr1G096090.11
Wheat TraesCS5B02G399400 , TraesCS5B02G398000 , TraesCS5B02G398000 , TraesCS3A02G302400 , TraesCS5A02G393200 , TraesCS5D02G403000 , TraesCS5D02G403000
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G051500 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
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20 Sobic.008G181200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G085200 Sobic001G085200 Sobic008G051500 Sobic008G051500 Sobic001G085200--Sobic008G051500 Sobic010G029800 Sobic010G029800 Sobic001G085200--Sobic010G029800 Sobic003G232332 Sobic003G232332 Sobic001G085200--Sobic003G232332 Sobic005G052200 Sobic005G052200 Sobic001G085200--Sobic005G052200 Sobic001G541400 Sobic001G541400 Sobic001G085200--Sobic001G541400 Sobic001G269650 Sobic001G269650 Sobic001G085200--Sobic001G269650 Sobic007G066200 Sobic007G066200 Sobic001G085200--Sobic007G066200 Sobic004G008700 Sobic004G008700 Sobic001G085200--Sobic004G008700 Sobic005G042400 Sobic005G042400 Sobic001G085200--Sobic005G042400 Sobic008G051500--Sobic010G029800 Sobic008G051500--Sobic001G085200 Sobic008G069000 Sobic008G069000 Sobic008G051500--Sobic008G069000 Sobic004G048300 Sobic004G048300 Sobic008G051500--Sobic004G048300 Sobic008G051500--Sobic004G008700 Sobic007G040900 Sobic007G040900 Sobic008G051500--Sobic007G040900 Sobic007G036400 Sobic007G036400 Sobic008G051500--Sobic007G036400 Sobic003G179300 Sobic003G179300 Sobic008G051500--Sobic003G179300 Sobic003G099800 Sobic003G099800 Sobic008G051500--Sobic003G099800 Sobic010G029800--Sobic004G008700 Sobic010G029800--Sobic005G042400 Sobic010G029800--Sobic008G069000 Sobic010G029800--Sobic003G099800 Sobic010G029800--Sobic005G052200 Sobic010G137600 Sobic010G137600 Sobic010G029800--Sobic010G137600 Sobic008G181200 Sobic008G181200 Sobic010G029800--Sobic008G181200 Sobic010G029800--Sobic007G040900 Sobic004G114700 Sobic004G114700 Sobic010G029800--Sobic004G114700 Sobic005G176875 Sobic005G176875 Sobic003G232332--Sobic005G176875 Sobic003G232332--Sobic007G066200 Sobic003G232332--Sobic001G269650 Sobic002G161600 Sobic002G161600 Sobic003G232332--Sobic002G161600 Sobic005G033600 Sobic005G033600 Sobic003G232332--Sobic005G033600 Sobic005G226800 Sobic005G226800 Sobic003G232332--Sobic005G226800 Sobic003G211600 Sobic003G211600 Sobic003G232332--Sobic003G211600 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic003G232332--Sobic002G015500 Sobic010G084800 Sobic010G084800 Sobic003G232332--Sobic010G084800 Sobic005G052200--Sobic004G114700 Sobic004G316300 Sobic004G316300 Sobic005G052200--Sobic004G316300 Sobic003G103100 Sobic003G103100 Sobic005G052200--Sobic003G103100 Sobic009G020000 Sobic009G020000 Sobic005G052200--Sobic009G020000 Sobic005G052200--Sobic005G042400 Sobic002G098100 Sobic002G098100 Sobic005G052200--Sobic002G098100 Sobic005G150000 Sobic005G150000 Sobic005G052200--Sobic005G150000 Sobic005G052200--Sobic004G008700 Sobic005G052200--Sobic003G099800 Sobic002G197800 Sobic002G197800 Sobic001G541400--Sobic002G197800 Sobic002G273000 Sobic002G273000 Sobic001G541400--Sobic002G273000 Sobic010G195450 Sobic010G195450 Sobic001G541400--Sobic010G195450 Sobic010G195301 Sobic010G195301 Sobic001G541400--Sobic010G195301 Sobic001G541400--Sobic001G085200 Sobic009G201100 Sobic009G201100 Sobic001G541400--Sobic009G201100 Sobic001G541400--Sobic005G176875 Sobic002G066000 Sobic002G066000 Sobic001G541400--Sobic002G066000 Sobic004G286301 Sobic004G286301 Sobic001G541400--Sobic004G286301 Sobic001G269650--Sobic007G066200 Sobic009G062300 Sobic009G062300 Sobic001G269650--Sobic009G062300 Sobic001G269650--Sobic005G176875 Sobic001G269650--Sobic005G226800 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic001G269650--Sobic001G495700 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic001G269650--Sobic008G184500 Sobic001G269650--Sobic003G211600 Sobic001G269650--Sobic002G015500 Sobic005G124400 Sobic005G124400 Sobic001G269650--Sobic005G124400 Sobic007G066200--Sobic005G226800 Sobic007G066200--Sobic003G211600 Sobic007G066200--Sobic009G062300 Sobic007G066200--Sobic001G269650 Sobic007G066200--Sobic005G124400 Sobic001G374600 Sobic001G374600 Sobic007G066200--Sobic001G374600 Sobic007G066200--Sobic005G033600 Sobic007G066200--Sobic001G495700 Sobic005G174200 Sobic005G174200 Sobic007G066200--Sobic005G174200 Sobic004G008700--Sobic003G099800 Sobic004G008700--Sobic010G029800 Sobic004G008700--Sobic005G042400 Sobic004G008700--Sobic007G040900 Sobic004G008700--Sobic005G052200 Sobic004G008700--Sobic002G098100 Sobic004G008700--Sobic004G114700 Sobic004G008700--Sobic009G020000 Sobic004G008700--Sobic008G069000 Sobic005G042400--Sobic010G029800 Sobic005G042400--Sobic003G103100 Sobic005G042400--Sobic004G008700 Sobic005G042400--Sobic005G052200 Sobic005G042400--Sobic005G124400 Sobic005G042400--Sobic009G062300 Sobic005G042400--Sobic010G137600 Sobic005G042400--Sobic004G114700 Sobic005G042400--Sobic005G226800
Octagon: transcription factors


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