Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G541400.1
Synonym
Functional annotation LTPL112 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
UniProt A0A1Z5SC19
Pfam PF14547
Panther DB PTHR31731 PTHR31731:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G12500 : Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g01320.1 : LTPL116 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000125
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G087780.8 , HORVU4Hr1G087780.4 , HORVU4Hr1G087780.5 , HORVU4Hr1G087780.6 , HORVU4Hr1G087780.1 , HORVU4Hr1G087780.7 , HORVU4Hr1G087780.3 , HORVU4Hr1G087770.1
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G541400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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19 Sobic.008G144201 - -
20 Sobic.008G181250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G541400 Sobic001G541400 Sobic002G197800 Sobic002G197800 Sobic001G541400--Sobic002G197800 Sobic002G273000 Sobic002G273000 Sobic001G541400--Sobic002G273000 Sobic010G195450 Sobic010G195450 Sobic001G541400--Sobic010G195450 Sobic010G195301 Sobic010G195301 Sobic001G541400--Sobic010G195301 Sobic001G085200 Sobic001G085200 Sobic001G541400--Sobic001G085200 Sobic009G201100 Sobic009G201100 Sobic001G541400--Sobic009G201100 Sobic005G176875 Sobic005G176875 Sobic001G541400--Sobic005G176875 Sobic002G066000 Sobic002G066000 Sobic001G541400--Sobic002G066000 Sobic004G286301 Sobic004G286301 Sobic001G541400--Sobic004G286301 Sobic006G047700 Sobic006G047700 Sobic002G197800--Sobic006G047700 Sobic002G197800--Sobic010G195450 Sobic004G254500 Sobic004G254500 Sobic002G197800--Sobic004G254500 Sobic010G054800 Sobic010G054800 Sobic002G197800--Sobic010G054800 Sobic002G197800--Sobic001G541400 Sobic005G073700 Sobic005G073700 Sobic002G197800--Sobic005G073700 Sobic002G244800 Sobic002G244800 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Octagon: transcription factors


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