Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G051700.1
Synonym GATA12, Sb08g004370
Functional annotation GATA zinc finger domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PBN1
Pfam PF00320
Panther DB PTHR10071 PTHR10071:SF200
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0006355regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G25830 : GATA transcription factor 12
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g07120.1 : GATA zinc finger domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK23690
Barley -
Wheat TraesCS3A02G274900 , TraesCS3B02G308500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic008G051700 Sobic008G051700 Sobic006G118100 Sobic006G118100 Sobic008G051700--Sobic006G118100 Sobic003G404700 Sobic003G404700 Sobic008G051700--Sobic003G404700 Sobic006G227100 Sobic006G227100 Sobic008G051700--Sobic006G227100 Sobic009G039200 Sobic009G039200 Sobic008G051700--Sobic009G039200 Sobic008G126300 Sobic008G126300 Sobic008G051700--Sobic008G126300 Sobic007G040600 Sobic007G040600 Sobic008G051700--Sobic007G040600 Sobic006G022900 Sobic006G022900 Sobic008G051700--Sobic006G022900 Sobic005G147032 Sobic005G147032 Sobic008G051700--Sobic005G147032 Sobic005G227800 Sobic005G227800 Sobic008G051700--Sobic005G227800 Sobic004G314300 Sobic004G314300 Sobic006G118100--Sobic004G314300 Sobic008G135901 Sobic008G135901 Sobic006G118100--Sobic008G135901 Sobic006G118100--Sobic003G404700 Sobic005G027100 Sobic005G027100 Sobic006G118100--Sobic005G027100 Sobic008G188300 Sobic008G188300 Sobic006G118100--Sobic008G188300 Sobic002G352501 Sobic002G352501 Sobic006G118100--Sobic002G352501 Sobic006G194900 Sobic006G194900 Sobic006G118100--Sobic006G194900 Sobic006G118100--Sobic006G227100 Sobic002G345500 Sobic002G345500 Sobic006G118100--Sobic002G345500 Sobic003G404700--Sobic009G039200 Sobic003G404700--Sobic008G188300 Sobic003G404700--Sobic008G135901 Sobic003G404700--Sobic005G027100 Sobic005G098300 Sobic005G098300 Sobic003G404700--Sobic005G098300 Sobic003G404700--Sobic006G022900 Sobic003G404700--Sobic006G227100 Sobic003G404700--Sobic004G314300 Sobic010G039600 Sobic010G039600 Sobic003G404700--Sobic010G039600 Sobic006G227100--Sobic009G039200 Sobic006G227100--Sobic005G098300 Sobic005G147100 Sobic005G147100 Sobic006G227100--Sobic005G147100 Sobic006G227100--Sobic008G188300 Sobic010G010500 Sobic010G010500 Sobic006G227100--Sobic010G010500 Sobic005G223000 Sobic005G223000 Sobic006G227100--Sobic005G223000 Sobic008G120200 Sobic008G120200 Sobic006G227100--Sobic008G120200 Sobic005G221100 Sobic005G221100 Sobic006G227100--Sobic005G221100 Sobic010G191500 Sobic010G191500 Sobic006G227100--Sobic010G191500 Sobic009G039200--Sobic005G223000 Sobic009G039200--Sobic005G221100 Sobic009G039200--Sobic005G147100 Sobic005G147200 Sobic005G147200 Sobic009G039200--Sobic005G147200 Sobic010G029600 Sobic010G029600 Sobic009G039200--Sobic010G029600 Sobic008G045650 Sobic008G045650 Sobic009G039200--Sobic008G045650 Sobic009G039200--Sobic010G191500 Sobic009G039200--Sobic005G098300 Sobic005G145900 Sobic005G145900 Sobic009G039200--Sobic005G145900 Sobic004G076600 Sobic004G076600 Sobic008G126300--Sobic004G076600 Sobic008G126300--Sobic005G227800 Sobic008G126300--Sobic010G029600 Sobic008G126300--Sobic005G147200 Sobic008G126300--Sobic005G147032 Sobic008G126300--Sobic007G040600 Sobic002G250800 Sobic002G250800 Sobic008G126300--Sobic002G250800 Sobic008G126300--Sobic005G221100 Sobic008G126300--Sobic005G145900 Sobic008G050300 Sobic008G050300 Sobic007G040600--Sobic008G050300 Sobic007G040600--Sobic002G250800 Sobic005G212000 Sobic005G212000 Sobic007G040600--Sobic005G212000 Sobic005G133100 Sobic005G133100 Sobic007G040600--Sobic005G133100 Sobic007G040600--Sobic008G126300 Sobic005G150100 Sobic005G150100 Sobic007G040600--Sobic005G150100 Sobic007G040600--Sobic005G147032 Sobic007G040600--Sobic005G227800 Sobic005G221300 Sobic005G221300 Sobic007G040600--Sobic005G221300 Sobic008G181600 Sobic008G181600 Sobic006G022900--Sobic008G181600 Sobic006G022900--Sobic009G039200 Sobic005G064300 Sobic005G064300 Sobic006G022900--Sobic005G064300 Sobic001G345700 Sobic001G345700 Sobic006G022900--Sobic001G345700 Sobic009G019900 Sobic009G019900 Sobic006G022900--Sobic009G019900 Sobic001G345600 Sobic001G345600 Sobic006G022900--Sobic001G345600 Sobic006G022900--Sobic010G039600 Sobic006G022900--Sobic006G227100 Sobic002G096400 Sobic002G096400 Sobic006G022900--Sobic002G096400 Sobic005G147032--Sobic005G147200 Sobic005G147032--Sobic005G150100 Sobic005G147032--Sobic010G029600 Sobic005G147032--Sobic005G227800 Sobic004G076400 Sobic004G076400 Sobic005G147032--Sobic004G076400 Sobic005G147032--Sobic010G010500 Sobic005G147032--Sobic005G147100 Sobic005G147032--Sobic005G221100 Sobic005G147032--Sobic005G098300 Sobic005G227800--Sobic010G029600 Sobic005G227800--Sobic005G147200 Sobic005G227800--Sobic004G076600 Sobic005G227800--Sobic005G147032 Sobic005G227800--Sobic005G221100 Sobic005G227800--Sobic005G145900 Sobic005G227800--Sobic008G045650 Sobic005G227800--Sobic008G126300 Sobic005G227800--Sobic005G223000
Octagon: transcription factors


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