Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G145000.2
Synonym Sb08g019530, SbERF90, RAP2.11, ethylene response factor 90
Functional annotation Not investigated (PubMedID : 23766026)
AP2 domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5R6M7
Pfam PF00847
Panther DB PTHR31194 PTHR31194:SF0
NCBI CDD -
KEGG Orthology K09286; EREBP-like factor
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G19790 : related to AP2 11
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g39330.1 : AP2 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004419 , Zm00025a011662 , Zm00025a048480
Brachypodium KQJ91112 , PNT62439 , KQK15572 , KQJ86112
Barley HORVU5Hr1G018720.1 , HORVU4Hr1G013410.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G127350 - -
2 Sobic.001G449300 LYK, putative, expressed -
3 Sobic.003G172000 - -
4 Sobic.002G074700 receptor kinase, putative, expressed -
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7 Sobic.002G121050 - -
8 Sobic.002G118000 ATP synthase, putative, expressed -
9 Sobic.007G103200 - -
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13 Sobic.002G149600 - -
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19 Sobic.004G272950 - -
20 Sobic.009G229500 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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