Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G183900.1
Synonym NAC042, Sb08g022560, anac042
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
no apical meristem protein, putative, expressed
UniProt C5YSW0
Pfam PF02365
Panther DB PTHR31719 PTHR31719:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G43000 : NAC domain containing protein 42
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g56580.1 : no apical meristem protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004806
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS5B02G415600 , TraesCS5A02G411700 , TraesCS5B02G415400 , TraesCS5D02G421000 , TraesCS5D02G421000 , TraesCS5D02G420800 , TraesCS5A02G411800 , TraesCS5D02G421100
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G183900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic008G183900 Sobic008G183900 Sobic005G114000 Sobic005G114000 Sobic008G183900--Sobic005G114000 Sobic004G304900 Sobic004G304900 Sobic008G183900--Sobic004G304900 Sobic005G061300 Sobic005G061300 Sobic008G183900--Sobic005G061300 Sobic008G139200 Sobic008G139200 Sobic008G183900--Sobic008G139200 Sobic008G172400 Sobic008G172400 Sobic008G183900--Sobic008G172400 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic008G183900--Sobic006G144900 Sobic001G001000 Sobic001G001000 Sobic008G183900--Sobic001G001000 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic008G183900--Sobic003G333150 Sobic005G005100 Sobic005G005100 Sobic008G183900--Sobic005G005100 Sobic005G114000--Sobic005G061300 Sobic005G114000--Sobic006G144900 Sobic005G114000--Sobic001G001000 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic005G114000--Sobic003G210701 Sobic003G002800 Sobic003G002800 Sobic005G114000--Sobic003G002800 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic005G114000--Sobic001G033701 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic005G114000--Sobic001G160300 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic005G114000--Sobic008G045900 Sobic010G081500 Sobic010G081500 Sobic005G114000--Sobic010G081500 Sobic010G265100 Sobic010G265100 Sobic004G304900--Sobic010G265100 Sobic004G304900--Sobic008G183900 Sobic004G304900--Sobic005G114000 Sobic006G198200 Sobic006G198200 Sobic004G304900--Sobic006G198200 Sobic004G304900--Sobic006G144900 Sobic004G304900--Sobic003G333150 Sobic001G494350 Sobic001G494350 Sobic004G304900--Sobic001G494350 Sobic003G243750 Sobic003G243750 Sobic004G304900--Sobic003G243750 Sobic005G175700 Sobic005G175700 Sobic004G304900--Sobic005G175700 Sobic005G061300--Sobic003G333150 Sobic005G061300--Sobic005G114000 Sobic005G061300--Sobic006G144900 Sobic005G061300--Sobic008G045900 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic005G061300--Sobic002G345100 Sobic005G061300--Sobic001G001000 Sobic005G061300--Sobic003G002800 Sobic005G061300--Sobic003G210701 Sobic002G067050 Sobic002G067050 Sobic005G061300--Sobic002G067050 Sobic004G173900 Sobic004G173900 Sobic008G139200--Sobic004G173900 Sobic003G118750 Sobic003G118750 Sobic008G139200--Sobic003G118750 Sobic005G059300 Sobic005G059300 Sobic008G139200--Sobic005G059300 Sobic004G200501 Sobic004G200501 Sobic008G139200--Sobic004G200501 Sobic003G141400 Sobic003G141400 Sobic008G139200--Sobic003G141400 Sobic009G174833 Sobic009G174833 Sobic008G139200--Sobic009G174833 Sobic010G010100 Sobic010G010100 Sobic008G139200--Sobic010G010100 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic008G139200--Sobic010G091750 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic008G139200--Sobic007G087500 Sobic008G172400--Sobic005G061300 Sobic008G172400--Sobic001G001000 Sobic008G172400--Sobic005G114000 Sobic005G085800 Sobic005G085800 Sobic008G172400--Sobic005G085800 Sobic008G172400--Sobic003G333150 Sobic005G030200 Sobic005G030200 Sobic008G172400--Sobic005G030200 Sobic008G045232 Sobic008G045232 Sobic008G172400--Sobic008G045232 Sobic002G289701 Sobic002G289701 Sobic008G172400--Sobic002G289701 Sobic002G191300 Sobic002G191300 Sobic008G172400--Sobic002G191300 Sobic006G144900--Sobic002G345100 Sobic006G144900--Sobic003G002800 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic006G144900--Sobic010G025200 Sobic006G144900--Sobic003G333150 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic006G144900--Sobic002G260500 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic006G144900--Sobic009G142600 Sobic009G160900 Sobic009G160900 Sobic006G144900--Sobic009G160900 Sobic006G144900--Sobic005G061300 Sobic006G144900--Sobic003G210701 Sobic001G001000--Sobic001G033701 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic001G001000--Sobic001G138500 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic001G001000--Sobic008G008701 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic001G001000--Sobic001G045300 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic001G001000--Sobic007G027400 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic001G001000--Sobic005G207550 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic001G001000--Sobic008G045100 Sobic001G001000--Sobic003G210701 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic001G001000--Sobic004G122700 Sobic003G333150--Sobic005G061300 Sobic003G333150--Sobic006G144900 Sobic008G045300 Sobic008G045300 Sobic003G333150--Sobic008G045300 Sobic003G333150--Sobic002G345100 Sobic003G333150--Sobic005G114000 Sobic003G333150--Sobic003G002800 Sobic004G293600 Sobic004G293600 Sobic003G333150--Sobic004G293600 Sobic003G333150--Sobic010G025200 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic003G333150--Sobic009G203600 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic005G005100--Sobic006G004700 Sobic002G070400 Sobic002G070400 Sobic005G005100--Sobic002G070400 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic005G005100--Sobic008G053700 Sobic005G005100--Sobic007G087500 Sobic004G173800 Sobic004G173800 Sobic005G005100--Sobic004G173800 Sobic005G144101 Sobic005G144101 Sobic005G005100--Sobic005G144101 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic005G005100--Sobic002G063500 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic005G005100--Sobic002G103400 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic005G005100--Sobic005G013700
Octagon: transcription factors


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