Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G060300.2,Sobic.009G060300.1
Synonym TAR2, Sb09g005080
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
alliin lyase precursor, putative, expressed
UniProt A0A1B6P6W1 , A0A1Z5R154
Pfam PF04864
Panther DB PTHR11751 PTHR11751:SF434
NCBI CDD -
KEGG Orthology K16903; L-tryptophan---pyruvate aminotransferase
Gene Ontology GO:0016846; carbon-sulfur lyase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G24670 : tryptophan aminotransferase related 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g07500.1 : alliin lyase precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043077 , Zm00025a023267 , Zm00025a035713
Brachypodium -
Barley HORVU1Hr1G072230.1 , HORVU1Hr1G072230.3 , HORVU1Hr1G072230.2 , HORVU1Hr1G025020.5 , HORVU1Hr1G025020.6 , HORVU1Hr1G025020.2 , HORVU1Hr1G025020.3
Wheat TraesCS3D02G093300 , TraesCSU02G199800 , TraesCSU02G199800 , TraesCS3A02G093000 , TraesCS1B02G133900 , TraesCS1B02G004400 , TraesCS1A02G113600 , TraesCS3B02G108200 , TraesCS1D02G238100 , TraesCS1B02G004300
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G060300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.006G105300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic009G060300 Sobic009G060300 Sobic009G132650 Sobic009G132650 Sobic009G060300--Sobic009G132650 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic009G060300--Sobic004G071100 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic009G060300--Sobic005G033400 Sobic004G029800 Sobic004G029800 Sobic009G060300--Sobic004G029800 Sobic002G286800 Sobic002G286800 Sobic009G060300--Sobic002G286800 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic009G060300--Sobic006G081400 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic009G060300--Sobic005G185400 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic009G060300--Sobic005G184500 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic009G060300--Sobic005G188800 Sobic005G176875 Sobic005G176875 Sobic009G132650--Sobic005G176875 Sobic009G132650--Sobic009G060300 Sobic002G273000 Sobic002G273000 Sobic009G132650--Sobic002G273000 Sobic009G132650--Sobic004G071100 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic009G132650--Sobic002G015500 Sobic009G132650--Sobic005G184500 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic009G132650--Sobic008G184500 Sobic009G132650--Sobic005G033400 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic009G132650--Sobic003G319050 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic004G071100--Sobic009G057100 Sobic004G071100--Sobic005G033400 Sobic004G071100--Sobic006G081400 Sobic004G071100--Sobic005G185400 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic004G071100--Sobic005G147500 Sobic002G097100 Sobic002G097100 Sobic004G071100--Sobic002G097100 Sobic004G071100--Sobic003G319050 Sobic004G071100--Sobic002G015500 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic004G071100--Sobic001G297700 Sobic005G033400--Sobic006G081400 Sobic005G033400--Sobic009G057100 Sobic005G033400--Sobic004G071100 Sobic005G033400--Sobic005G185400 Sobic005G033400--Sobic005G188800 Sobic005G033400--Sobic005G147500 Sobic005G033400--Sobic004G029800 Sobic005G033400--Sobic005G184500 Sobic010G031400 Sobic010G031400 Sobic005G033400--Sobic010G031400 Sobic004G029800--Sobic006G081400 Sobic004G029800--Sobic005G188800 Sobic004G029800--Sobic005G185400 Sobic004G029800--Sobic005G147500 Sobic004G029800--Sobic009G057100 Sobic004G029800--Sobic005G033400 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic004G029800--Sobic003G294800 Sobic004G029800--Sobic005G184500 Sobic004G029800--Sobic004G071100 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic002G286800--Sobic010G035000 Sobic007G199500 Sobic007G199500 Sobic002G286800--Sobic007G199500 Sobic002G286800--Sobic001G297700 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic002G286800--Sobic007G131100 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic002G286800--Sobic006G105300 Sobic002G286800--Sobic005G184500 Sobic002G286800--Sobic005G185400 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic002G286800--Sobic005G184400 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic002G286800--Sobic007G025100 Sobic006G081400--Sobic005G188800 Sobic006G081400--Sobic009G057100 Sobic006G081400--Sobic005G147500 Sobic006G081400--Sobic004G029800 Sobic006G081400--Sobic005G033400 Sobic006G081400--Sobic005G185400 Sobic006G081400--Sobic004G071100 Sobic006G081400--Sobic003G294800 Sobic006G081400--Sobic005G184500 Sobic005G185400--Sobic005G184500 Sobic005G185400--Sobic006G105300 Sobic005G185400--Sobic006G081400 Sobic005G185400--Sobic001G297700 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic005G185400--Sobic005G184600 Sobic005G185400--Sobic005G033400 Sobic005G185400--Sobic005G184400 Sobic005G185400--Sobic010G031400 Sobic005G185400--Sobic010G035000 Sobic005G184500--Sobic005G185400 Sobic005G184500--Sobic006G105300 Sobic005G184500--Sobic005G184600 Sobic005G184500--Sobic005G184400 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic005G184500--Sobic007G049000 Sobic005G184500--Sobic010G035000 Sobic005G184500--Sobic001G297700 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic005G184500--Sobic006G142850 Sobic005G184500--Sobic010G031400 Sobic005G188800--Sobic003G294800 Sobic005G188800--Sobic006G081400 Sobic005G188800--Sobic005G147500 Sobic005G188800--Sobic004G029800 Sobic005G188800--Sobic009G057100 Sobic005G082300 Sobic005G082300 Sobic005G188800--Sobic005G082300 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic005G188800--Sobic002G172100 Sobic008G109600 Sobic008G109600 Sobic005G188800--Sobic008G109600 Sobic005G188800--Sobic005G033400
Octagon: transcription factors


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