Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G095200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P827
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G116850 - -
2 Sobic.004G269300 - -
3 Sobic.010G238000 - -
4 Sobic.008G068700 DUF1336 domain containing protein, expressed -
5 Sobic.008G025000 expressed protein -
6 Sobic.009G106601 - -
7 Sobic.002G000900 lachrymatory factor synthase, putative, expressed -
8 Sobic.010G126700 expressed protein -
9 Sobic.010G276301 - -
10 Sobic.001G273875 - -
11 Sobic.004G201000 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
12 Sobic.002G033550 - -
13 Sobic.010G155401 - -
14 Sobic.004G065950 - -
15 Sobic.006G093700 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
16 Sobic.003G125751 - -
17 Sobic.006G011450 - -
18 Sobic.004G290850 - -
19 Sobic.010G102700 alpha/beta hydrolase fold, putative, expressed -
20 Sobic.001G217850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G095200 Sobic009G095200 Sobic003G116850 Sobic003G116850 Sobic009G095200--Sobic003G116850 Sobic004G269300 Sobic004G269300 Sobic009G095200--Sobic004G269300 Sobic010G238000 Sobic010G238000 Sobic009G095200--Sobic010G238000 Sobic008G068700 Sobic008G068700 Sobic009G095200--Sobic008G068700 Sobic008G025000 Sobic008G025000 Sobic009G095200--Sobic008G025000 Sobic009G106601 Sobic009G106601 Sobic009G095200--Sobic009G106601 Sobic002G000900 Sobic002G000900 Sobic009G095200--Sobic002G000900 Sobic010G126700 Sobic010G126700 Sobic009G095200--Sobic010G126700 Sobic010G276301 Sobic010G276301 Sobic009G095200--Sobic010G276301 Sobic003G116850--Sobic009G106601 Sobic004G023600 Sobic004G023600 Sobic003G116850--Sobic004G023600 Sobic002G033550 Sobic002G033550 Sobic003G116850--Sobic002G033550 Sobic003G116850--Sobic002G000900 Sobic006G174050 Sobic006G174050 Sobic003G116850--Sobic006G174050 Sobic001G217850 Sobic001G217850 Sobic003G116850--Sobic001G217850 Sobic001G137900 Sobic001G137900 Sobic003G116850--Sobic001G137900 Sobic009G170050 Sobic009G170050 Sobic003G116850--Sobic009G170050 Sobic003G116850--Sobic009G095200 Sobic004G269300--Sobic010G238000 Sobic004G269300--Sobic008G025000 Sobic004G269300--Sobic002G033550 Sobic004G269300--Sobic008G068700 Sobic004G269300--Sobic002G000900 Sobic002G245700 Sobic002G245700 Sobic004G269300--Sobic002G245700 Sobic004G269300--Sobic009G106601 Sobic004G176950 Sobic004G176950 Sobic004G269300--Sobic004G176950 Sobic001G472050 Sobic001G472050 Sobic004G269300--Sobic001G472050 Sobic010G238000--Sobic001G472050 Sobic001G489550 Sobic001G489550 Sobic010G238000--Sobic001G489550 Sobic010G238000--Sobic004G269300 Sobic002G423901 Sobic002G423901 Sobic010G238000--Sobic002G423901 Sobic010G238000--Sobic002G245700 Sobic010G102700 Sobic010G102700 Sobic010G238000--Sobic010G102700 Sobic004G169401 Sobic004G169401 Sobic010G238000--Sobic004G169401 Sobic010G008433 Sobic010G008433 Sobic010G238000--Sobic010G008433 Sobic007G199901 Sobic007G199901 Sobic010G238000--Sobic007G199901 Sobic001G273875 Sobic001G273875 Sobic008G068700--Sobic001G273875 Sobic001G529100 Sobic001G529100 Sobic008G068700--Sobic001G529100 Sobic004G201000 Sobic004G201000 Sobic008G068700--Sobic004G201000 Sobic006G011450 Sobic006G011450 Sobic008G068700--Sobic006G011450 Sobic010G276850 Sobic010G276850 Sobic008G068700--Sobic010G276850 Sobic010G155401 Sobic010G155401 Sobic008G068700--Sobic010G155401 Sobic004G065950 Sobic004G065950 Sobic008G068700--Sobic004G065950 Sobic001G038050 Sobic001G038050 Sobic008G068700--Sobic001G038050 Sobic003G125751 Sobic003G125751 Sobic008G068700--Sobic003G125751 Sobic008G025000--Sobic008G068700 Sobic008G025000--Sobic002G000900 Sobic008G025000--Sobic004G269300 Sobic008G025000--Sobic009G106601 Sobic008G025000--Sobic002G033550 Sobic003G143600 Sobic003G143600 Sobic008G025000--Sobic003G143600 Sobic001G094100 Sobic001G094100 Sobic008G025000--Sobic001G094100 Sobic002G109700 Sobic002G109700 Sobic008G025000--Sobic002G109700 Sobic008G025000--Sobic001G529100 Sobic009G106601--Sobic001G137900 Sobic009G106601--Sobic002G033550 Sobic004G199100 Sobic004G199100 Sobic009G106601--Sobic004G199100 Sobic004G252250 Sobic004G252250 Sobic009G106601--Sobic004G252250 Sobic009G106601--Sobic002G109700 Sobic009G106601--Sobic002G000900 Sobic008G142450 Sobic008G142450 Sobic009G106601--Sobic008G142450 Sobic002G121201 Sobic002G121201 Sobic009G106601--Sobic002G121201 Sobic009G106601--Sobic003G143600 Sobic007G050650 Sobic007G050650 Sobic002G000900--Sobic007G050650 Sobic001G324300 Sobic001G324300 Sobic002G000900--Sobic001G324300 Sobic005G049100 Sobic005G049100 Sobic002G000900--Sobic005G049100 Sobic007G050750 Sobic007G050750 Sobic002G000900--Sobic007G050750 Sobic001G112550 Sobic001G112550 Sobic002G000900--Sobic001G112550 Sobic002G000900--Sobic002G109700 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic002G000900--Sobic010G266400 Sobic002G000900--Sobic008G025000 Sobic004G358800 Sobic004G358800 Sobic002G000900--Sobic004G358800 Sobic010G126700--Sobic004G201000 Sobic002G427600 Sobic002G427600 Sobic010G126700--Sobic002G427600 Sobic010G126700--Sobic010G155401 Sobic010G126700--Sobic004G065950 Sobic010G126700--Sobic003G125751 Sobic004G290850 Sobic004G290850 Sobic010G126700--Sobic004G290850 Sobic007G220033 Sobic007G220033 Sobic010G126700--Sobic007G220033 Sobic007G212250 Sobic007G212250 Sobic010G126700--Sobic007G212250 Sobic010G126700--Sobic001G273875 Sobic006G190150 Sobic006G190150 Sobic010G276301--Sobic006G190150 Sobic003G277550 Sobic003G277550 Sobic010G276301--Sobic003G277550 Sobic010G276301--Sobic002G427600 Sobic010G276301--Sobic007G212250 Sobic010G276301--Sobic007G220033 Sobic001G382332 Sobic001G382332 Sobic010G276301--Sobic001G382332 Sobic010G276301--Sobic010G126700 Sobic002G406000 Sobic002G406000 Sobic010G276301--Sobic002G406000 Sobic010G276301--Sobic004G201000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.