Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G166650.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R316
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G166400 MCM8 - Putative minichromosome maintenance MCM family subunit 8, expressed K10737: DNA helicase MCM8
2 Sobic.002G095800 expressed protein -
3 Sobic.002G305900 expressed protein -
4 Sobic.001G455300 ZOS3-05 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
5 Sobic.002G390700 serine/threonine-protein kinase Haspin, putative, expressed K16315: serine/threonine-protein kinase haspin
6 Sobic.001G221601 - -
7 Sobic.007G102600 - -
8 Sobic.001G394000 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
9 Sobic.004G073800 STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 7 precursor, putative, expressed -
10 Sobic.009G128400 peptide-N4-asparagine amidase A, putative, expressed -
11 Sobic.009G097500 - -
12 Sobic.009G195100 NLI interacting factor-like phosphatase, putative, expressed K17496: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50
13 Sobic.003G207400 OsFBX18 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G032301 - -
15 Sobic.007G103200 - -
16 Sobic.001G045100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
17 Sobic.002G152100 alpha-galactosidase precursor, putative, expressed -
18 Sobic.001G249800 no apical meristem protein, expressed -
19 Sobic.004G130500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
20 Sobic.009G209650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G166650 Sobic009G166650 Sobic009G166400 Sobic009G166400 Sobic009G166650--Sobic009G166400 Sobic002G095800 Sobic002G095800 Sobic009G166650--Sobic002G095800 Sobic002G305900 Sobic002G305900 Sobic009G166650--Sobic002G305900 Sobic001G455300 Sobic001G455300 Sobic009G166650--Sobic001G455300 Sobic002G390700 Sobic002G390700 Sobic009G166650--Sobic002G390700 Sobic001G221601 Sobic001G221601 Sobic009G166650--Sobic001G221601 Sobic007G102600 Sobic007G102600 Sobic009G166650--Sobic007G102600 Sobic001G394000 Sobic001G394000 Sobic009G166650--Sobic001G394000 Sobic004G073800 Sobic004G073800 Sobic009G166650--Sobic004G073800 Sobic009G166400--Sobic009G166650 Sobic009G097500 Sobic009G097500 Sobic009G166400--Sobic009G097500 Sobic009G166400--Sobic002G305900 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic009G166400--Sobic004G272950 SobicK031300 SobicK031300 Sobic009G166400--SobicK031300 SobicK043600 SobicK043600 Sobic009G166400--SobicK043600 Sobic009G166400--Sobic001G455300 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic009G166400--Sobic003G168600 Sobic009G209650 Sobic009G209650 Sobic009G166400--Sobic009G209650 Sobic003G384100 Sobic003G384100 Sobic002G095800--Sobic003G384100 Sobic002G095800--Sobic009G166650 Sobic002G074500 Sobic002G074500 Sobic002G095800--Sobic002G074500 Sobic002G095800--Sobic002G390700 Sobic007G172900 Sobic007G172900 Sobic002G095800--Sobic007G172900 Sobic006G234500 Sobic006G234500 Sobic002G095800--Sobic006G234500 Sobic002G095200 Sobic002G095200 Sobic002G095800--Sobic002G095200 Sobic010G046200 Sobic010G046200 Sobic002G095800--Sobic010G046200 Sobic001G303300 Sobic001G303300 Sobic002G095800--Sobic001G303300 Sobic002G305900--Sobic009G097500 Sobic003G436100 Sobic003G436100 Sobic002G305900--Sobic003G436100 Sobic009G188200 Sobic009G188200 Sobic002G305900--Sobic009G188200 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic002G305900--Sobic003G173200 Sobic005G176300 Sobic005G176300 Sobic002G305900--Sobic005G176300 SobicK031400 SobicK031400 Sobic002G305900--SobicK031400 Sobic002G334700 Sobic002G334700 Sobic002G305900--Sobic002G334700 Sobic003G172000 Sobic003G172000 Sobic002G305900--Sobic003G172000 Sobic002G152100 Sobic002G152100 Sobic002G305900--Sobic002G152100 Sobic002G149600 Sobic002G149600 Sobic001G455300--Sobic002G149600 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic001G455300--Sobic004G072600 Sobic002G163400 Sobic002G163400 Sobic001G455300--Sobic002G163400 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic001G455300--Sobic003G263450 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic001G455300--Sobic002G074700 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic001G455300--Sobic003G251000 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic001G455300--Sobic006G094900 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic001G455300--Sobic008G056000 Sobic002G168750 Sobic002G168750 Sobic001G455300--Sobic002G168750 Sobic010G078400 Sobic010G078400 Sobic002G390700--Sobic010G078400 Sobic002G390700--Sobic001G303300 Sobic002G390700--Sobic001G221601 Sobic002G390700--Sobic002G074500 Sobic003G106800 Sobic003G106800 Sobic002G390700--Sobic003G106800 Sobic003G092000 Sobic003G092000 Sobic002G390700--Sobic003G092000 Sobic002G390700--Sobic009G166650 Sobic009G014500 Sobic009G014500 Sobic002G390700--Sobic009G014500 Sobic002G239800 Sobic002G239800 Sobic002G390700--Sobic002G239800 Sobic004G312400 Sobic004G312400 Sobic001G221601--Sobic004G312400 Sobic001G221601--Sobic002G390700 Sobic004G064700 Sobic004G064700 Sobic001G221601--Sobic004G064700 Sobic001G221601--Sobic009G166650 Sobic001G221601--Sobic004G073800 Sobic003G107000 Sobic003G107000 Sobic001G221601--Sobic003G107000 Sobic010G213000 Sobic010G213000 Sobic001G221601--Sobic010G213000 Sobic001G088400 Sobic001G088400 Sobic001G221601--Sobic001G088400 Sobic001G088000 Sobic001G088000 Sobic001G221601--Sobic001G088000 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic007G102600--Sobic004G274300 Sobic010G039150 Sobic010G039150 Sobic007G102600--Sobic010G039150 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic007G102600--Sobic001G323101 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic007G102600--Sobic009G079600 Sobic001G249800 Sobic001G249800 Sobic007G102600--Sobic001G249800 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic007G102600--Sobic001G340100 Sobic002G118000 Sobic002G118000 Sobic007G102600--Sobic002G118000 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic007G102600--Sobic004G134400 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic007G102600--Sobic007G127200 Sobic003G105200 Sobic003G105200 Sobic001G394000--Sobic003G105200 Sobic001G394000--Sobic001G455300 Sobic001G394000--Sobic003G172000 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic001G394000--Sobic002G121050 Sobic001G394000--Sobic002G149600 Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic001G394000--Sobic005G024500 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic001G394000--Sobic004G127350 Sobic001G394000--Sobic002G074700 Sobic001G394000--Sobic009G097500 Sobic009G128400 Sobic009G128400 Sobic004G073800--Sobic009G128400 Sobic001G449500 Sobic001G449500 Sobic004G073800--Sobic001G449500 Sobic004G073800--Sobic004G312400 Sobic004G073800--Sobic001G088400 Sobic004G073800--Sobic001G221601 Sobic004G073800--Sobic009G166400 Sobic004G073800--Sobic009G166650 Sobic004G073800--Sobic002G390700 Sobic007G067900 Sobic007G067900 Sobic004G073800--Sobic007G067900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.