Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G102600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PH88
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G274300 no apical meristem protein, putative, expressed -
2 Sobic.010G039150 - -
3 Sobic.001G323101 - -
4 Sobic.009G079600 - -
5 Sobic.001G249800 no apical meristem protein, expressed -
6 Sobic.001G340100 - -
7 Sobic.002G118000 ATP synthase, putative, expressed -
8 Sobic.004G134400 - -
9 Sobic.007G127200 ECT protein, putative, expressed K07877: Ras-related protein Rab-2A
10 Sobic.001G045100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
11 Sobic.010G247750 - -
12 Sobic.007G103200 - -
13 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4
14 Sobic.007G132650 - -
15 Sobic.001G400601 - -
16 Sobic.003G260500 - -
17 Sobic.006G029850 - -
18 Sobic.003G187600 PPR repeat containing protein, expressed -
19 Sobic.004G129400 pectinesterase, putative, expressed -
20 Sobic.001G045900 polygalacturonase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G102600 Sobic007G102600 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic007G102600--Sobic004G274300 Sobic010G039150 Sobic010G039150 Sobic007G102600--Sobic010G039150 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic007G102600--Sobic001G323101 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic007G102600--Sobic009G079600 Sobic001G249800 Sobic001G249800 Sobic007G102600--Sobic001G249800 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic007G102600--Sobic001G340100 Sobic002G118000 Sobic002G118000 Sobic007G102600--Sobic002G118000 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic007G102600--Sobic004G134400 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic007G102600--Sobic007G127200 Sobic004G274300--Sobic004G134400 Sobic004G274300--Sobic009G079600 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic004G274300--Sobic003G187600 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic004G274300--Sobic003G260500 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic004G274300--Sobic004G133201 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic004G274300--Sobic007G132650 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic004G274300--Sobic006G107766 Sobic004G274300--Sobic007G127200 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic004G274300--Sobic003G394701 Sobic010G039150--Sobic009G079600 Sobic006G029850 Sobic006G029850 Sobic010G039150--Sobic006G029850 Sobic010G039150--Sobic004G274300 Sobic010G039150--Sobic007G132650 Sobic010G039150--Sobic004G134400 Sobic010G039150--Sobic003G187600 Sobic010G039150--Sobic003G260500 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic010G039150--Sobic004G115100 Sobic010G039150--Sobic001G323101 Sobic001G323101--Sobic009G079600 Sobic001G323101--Sobic004G134400 Sobic001G323101--Sobic003G187600 Sobic001G323101--Sobic004G274300 Sobic001G323101--Sobic007G132650 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic001G323101--Sobic003G112100 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic001G323101--Sobic004G129400 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic001G323101--Sobic003G169550 Sobic001G323101--Sobic007G127200 Sobic009G079600--Sobic004G134400 Sobic009G079600--Sobic004G274300 Sobic009G079600--Sobic003G187600 Sobic009G079600--Sobic001G323101 Sobic009G079600--Sobic007G127200 Sobic009G079600--Sobic010G039150 Sobic009G079600--Sobic007G132650 Sobic009G079600--Sobic003G260500 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic009G079600--Sobic010G247750 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic001G249800--Sobic001G436450 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic001G249800--Sobic006G176900 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic001G249800--Sobic008G119600 Sobic001G249800--Sobic006G107766 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic001G249800--Sobic007G103200 Sobic004G130500 Sobic004G130500 Sobic001G249800--Sobic004G130500 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic001G249800--Sobic004G127733 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic001G249800--Sobic002G134800 Sobic002G042700 Sobic002G042700 Sobic001G249800--Sobic002G042700 Sobic001G340100--Sobic004G274300 Sobic001G400601 Sobic001G400601 Sobic001G340100--Sobic001G400601 Sobic001G340100--Sobic007G132650 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic001G340100--Sobic002G067900 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic001G340100--Sobic002G074900 Sobic004G223800 Sobic004G223800 Sobic001G340100--Sobic004G223800 Sobic001G340100--Sobic003G187600 Sobic001G340100--Sobic006G107766 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic001G340100--Sobic001G373850 Sobic009G209650 Sobic009G209650 Sobic002G118000--Sobic009G209650 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic002G118000--Sobic003G168600 Sobic005G194400 Sobic005G194400 Sobic002G118000--Sobic005G194400 Sobic002G118000--Sobic007G103200 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic002G118000--Sobic004G272950 Sobic005G173100 Sobic005G173100 Sobic002G118000--Sobic005G173100 Sobic002G118000--Sobic007G132650 Sobic003G296250 Sobic003G296250 Sobic002G118000--Sobic003G296250 SobicK032350 SobicK032350 Sobic002G118000--SobicK032350 Sobic004G134400--Sobic009G079600 Sobic004G134400--Sobic004G274300 Sobic004G134400--Sobic007G127200 Sobic004G134400--Sobic003G187600 Sobic004G134400--Sobic010G247750 Sobic004G134400--Sobic003G260500 Sobic004G134400--Sobic001G323101 Sobic004G134400--Sobic004G133201 Sobic004G134400--Sobic007G132650 Sobic007G127200--Sobic010G247750 Sobic007G127200--Sobic004G127733 Sobic007G127200--Sobic004G134400 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic007G127200--Sobic010G052100 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic007G127200--Sobic001G045900 Sobic007G127200--Sobic009G079600 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic007G127200--Sobic006G035350 Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic007G127200--Sobic008G093300 Sobic007G127200--Sobic003G260500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.