Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G203400.2,Sobic.009G203400.4,Sobic.009G203400.3,Sobic.009G203400.1
Synonym Sb09g026070, IQD26
Functional annotation IQ calmodulin-binding motif family protein, putative, expressed
UniProt C5Z1D2 , A0A1B6P9J5 , A0A1B6PA75
Pfam PF00612 PF13178
Panther DB PTHR32295 PTHR32295:SF30
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G16490 : IQ-domain 26
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g44630.1 : IQ calmodulin-binding motif family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a037983 , Zm00025a044316
Brachypodium PNT70878 , PNT70879 , PNT70877 , PNT70880 , PNT70883 , KQK09675 , KQK09674 , KQK09677 , KQK09676 , KQK09673 , KQK09672 , KQK09678 , KQK05321 , PNT70884 , PNT70881 , PNT70882
Barley HORVU1Hr1G075880.5 , HORVU1Hr1G075880.4 , HORVU1Hr1G075880.3 , HORVU1Hr1G075880.2 , HORVU1Hr1G075880.1 , HORVU1Hr1G075880.7 , HORVU1Hr1G075880.6 , HORVU1Hr1G075880.9 , HORVU1Hr1G075880.8 , HORVU1Hr1G075880.19 , HORVU1Hr1G075880.18 , HORVU1Hr1G075880.17 , HORVU1Hr1G075880.16 , HORVU1Hr1G075880.15 , HORVU1Hr1G075880.14 , HORVU1Hr1G075880.13 , HORVU1Hr1G075880.12 , HORVU1Hr1G075880.11 , HORVU1Hr1G075880.10
Wheat TraesCS1A02G341900 , TraesCS1D02G344200
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G273500 expressed protein -
2 Sobic.001G104400 expressed protein -
3 Sobic.007G208500 expressed protein -
4 Sobic.004G180600 expressed protein K18172: COX assembly mitochondrial protein 2
5 Sobic.008G098098 - -
6 Sobic.006G186200 exostosin family domain containing protein, expressed -
7 Sobic.004G061600 expressed protein -
8 Sobic.008G119200 - -
9 Sobic.004G107400 expressed protein -
10 Sobic.003G390300 expressed protein -
11 Sobic.009G005800 formin-like protein 6 precursor, putative, expressed -
12 Sobic.010G002850 - -
13 Sobic.002G173600 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G000900 expressed protein -
15 Sobic.009G088401 - -
16 Sobic.007G076800 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
17 Sobic.002G285525 - -
18 Sobic.005G231800 tropinone reductase, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
19 Sobic.006G171000 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@OsSPL7 - SBP-box gene family member, expressed -
20 Sobic.005G209800 nodulin, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G203400 Sobic009G203400 Sobic006G273500 Sobic006G273500 Sobic009G203400--Sobic006G273500 Sobic001G104400 Sobic001G104400 Sobic009G203400--Sobic001G104400 Sobic007G208500 Sobic007G208500 Sobic009G203400--Sobic007G208500 Sobic004G180600 Sobic004G180600 Sobic009G203400--Sobic004G180600 Sobic008G098098 Sobic008G098098 Sobic009G203400--Sobic008G098098 Sobic006G186200 Sobic006G186200 Sobic009G203400--Sobic006G186200 Sobic004G061600 Sobic004G061600 Sobic009G203400--Sobic004G061600 Sobic008G119200 Sobic008G119200 Sobic009G203400--Sobic008G119200 Sobic004G107400 Sobic004G107400 Sobic009G203400--Sobic004G107400 Sobic006G273500--Sobic008G098098 Sobic006G273500--Sobic008G119200 Sobic006G273500--Sobic004G107400 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic006G273500--Sobic002G285525 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic006G273500--Sobic001G137200 Sobic010G002850 Sobic010G002850 Sobic006G273500--Sobic010G002850 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic006G273500--Sobic006G171000 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic006G273500--Sobic005G209800 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic006G273500--Sobic005G231800 Sobic001G104400--Sobic010G002850 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic001G104400--Sobic004G089700 Sobic006G075700 Sobic006G075700 Sobic001G104400--Sobic006G075700 Sobic001G104400--Sobic005G209800 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic001G104400--Sobic002G048250 Sobic001G483700 Sobic001G483700 Sobic001G104400--Sobic001G483700 Sobic001G104400--Sobic002G285525 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic001G104400--Sobic007G183000 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic001G104400--Sobic004G224300 Sobic007G208500--Sobic006G273500 Sobic007G208500--Sobic009G203400 Sobic007G208500--Sobic004G180600 Sobic007G208500--Sobic008G098098 Sobic007G208500--Sobic006G186200 Sobic002G256500 Sobic002G256500 Sobic007G208500--Sobic002G256500 Sobic007G208500--Sobic004G061600 Sobic004G043200 Sobic004G043200 Sobic007G208500--Sobic004G043200 Sobic003G390300 Sobic003G390300 Sobic007G208500--Sobic003G390300 Sobic004G180600--Sobic006G273500 Sobic004G180600--Sobic008G098098 Sobic009G088401 Sobic009G088401 Sobic004G180600--Sobic009G088401 Sobic007G016000 Sobic007G016000 Sobic004G180600--Sobic007G016000 Sobic004G180600--Sobic008G119200 Sobic004G180600--Sobic004G107400 Sobic003G407500 Sobic003G407500 Sobic004G180600--Sobic003G407500 Sobic007G072400 Sobic007G072400 Sobic004G180600--Sobic007G072400 Sobic004G180600--Sobic005G209800 Sobic008G098098--Sobic008G119200 Sobic001G000900 Sobic001G000900 Sobic008G098098--Sobic001G000900 Sobic008G098098--Sobic006G273500 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic008G098098--Sobic009G223700 Sobic008G098098--Sobic005G231800 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic008G098098--Sobic004G226300 Sobic008G098098--Sobic007G183000 Sobic008G098098--Sobic009G088401 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic008G098098--Sobic001G527400 Sobic006G186200--Sobic006G273500 Sobic006G186200--Sobic004G061600 Sobic006G186200--Sobic004G107400 Sobic006G186200--Sobic003G390300 Sobic010G014900 Sobic010G014900 Sobic006G186200--Sobic010G014900 Sobic007G158400 Sobic007G158400 Sobic006G186200--Sobic007G158400 Sobic004G156600 Sobic004G156600 Sobic006G186200--Sobic004G156600 Sobic003G290700 Sobic003G290700 Sobic006G186200--Sobic003G290700 Sobic006G186200--Sobic001G137200 Sobic004G061600--Sobic003G390300 Sobic004G061600--Sobic007G158400 Sobic008G136900 Sobic008G136900 Sobic004G061600--Sobic008G136900 Sobic004G061600--Sobic010G014900 Sobic001G062700 Sobic001G062700 Sobic004G061600--Sobic001G062700 Sobic004G061600--Sobic004G107400 Sobic005G168500 Sobic005G168500 Sobic004G061600--Sobic005G168500 Sobic004G061600--Sobic001G137200 Sobic004G061600--Sobic006G273500 Sobic008G119200--Sobic002G048250 Sobic008G119200--Sobic007G183000 Sobic008G119200--Sobic004G226300 Sobic008G119200--Sobic005G231800 Sobic008G119200--Sobic001G527400 Sobic008G119200--Sobic002G285525 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic008G119200--Sobic008G023000 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic008G119200--Sobic008G002100 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic008G119200--Sobic004G347866 Sobic004G107400--Sobic006G171000 Sobic004G107400--Sobic010G014900 Sobic004G107400--Sobic001G137200 Sobic004G107400--Sobic003G390300 Sobic004G107400--Sobic005G209800 Sobic002G078850 Sobic002G078850 Sobic004G107400--Sobic002G078850 Sobic003G104900 Sobic003G104900 Sobic004G107400--Sobic003G104900 Sobic004G107400--Sobic005G231800 Sobic004G107400--Sobic008G002100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.