Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G090401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VS34
Pfam PF11250
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Wheat -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G062701 - -
2 Sobic.001G357650 - -
3 Sobic.009G047150 - -
4 Sobic.006G135525 - -
5 Sobic.010G210900 O-acyltransferase, putative, expressed -
6 Sobic.003G137000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G124832 - -
8 Sobic.001G387700 LTPL66 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
9 Sobic.003G155700 transcription initiation factor IID, 18kD subunit family protein, expressed K03127: transcription initiation factor TFIID subunit 13
10 Sobic.009G043800 SbDFR4 expression was not detectable in the seedlings of either sorghum cultivar under our experimental conditions.(PubMedID : 20529887)@dihydroflavonol-4-reductase, putative, expressed K13082: bifunctional dihydroflavonol 4-reductase/flavanone 4-reductase
11 Sobic.009G046400 expressed protein -
12 Sobic.004G264800 expressed protein -
13 Sobic.002G014100 OsFBX212 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G165401 - -
15 Sobic.007G072700 - -
16 Sobic.003G229900 - -
17 Sobic.005G133750 - -
18 Sobic.002G191450 - -
19 Sobic.001G064400 expressed protein -
20 Sobic.006G247200 AMP-binding enzyme, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G090401 Sobic010G090401 Sobic009G062701 Sobic009G062701 Sobic010G090401--Sobic009G062701 Sobic001G357650 Sobic001G357650 Sobic010G090401--Sobic001G357650 Sobic009G047150 Sobic009G047150 Sobic010G090401--Sobic009G047150 Sobic006G135525 Sobic006G135525 Sobic010G090401--Sobic006G135525 Sobic010G210900 Sobic010G210900 Sobic010G090401--Sobic010G210900 Sobic003G137000 Sobic003G137000 Sobic010G090401--Sobic003G137000 Sobic002G124832 Sobic002G124832 Sobic010G090401--Sobic002G124832 Sobic001G387700 Sobic001G387700 Sobic010G090401--Sobic001G387700 Sobic003G155700 Sobic003G155700 Sobic010G090401--Sobic003G155700 Sobic002G014100 Sobic002G014100 Sobic009G062701--Sobic002G014100 Sobic005G133750 Sobic005G133750 Sobic009G062701--Sobic005G133750 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic009G062701--Sobic010G143666 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic009G062701--Sobic003G281000 Sobic006G247200 Sobic006G247200 Sobic009G062701--Sobic006G247200 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic009G062701--Sobic002G069300 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic009G062701--Sobic002G202050 Sobic001G357650--Sobic009G062701 Sobic001G357650--Sobic005G133750 Sobic001G357650--Sobic002G202050 Sobic001G357650--Sobic006G247200 Sobic001G357650--Sobic002G014100 Sobic002G344800 Sobic002G344800 Sobic001G357650--Sobic002G344800 Sobic005G119300 Sobic005G119300 Sobic009G047150--Sobic005G119300 Sobic009G047150--Sobic002G124832 Sobic009G047150--Sobic003G137000 Sobic001G064400 Sobic001G064400 Sobic009G047150--Sobic001G064400 Sobic002G191450 Sobic002G191450 Sobic009G047150--Sobic002G191450 Sobic009G043800 Sobic009G043800 Sobic009G047150--Sobic009G043800 Sobic003G165401 Sobic003G165401 Sobic009G047150--Sobic003G165401 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic009G047150--Sobic008G140500 Sobic007G072700 Sobic007G072700 Sobic009G047150--Sobic007G072700 Sobic003G230200 Sobic003G230200 Sobic006G135525--Sobic003G230200 Sobic001G006300 Sobic001G006300 Sobic006G135525--Sobic001G006300 Sobic006G135525--Sobic001G387700 Sobic007G116700 Sobic007G116700 Sobic006G135525--Sobic007G116700 Sobic006G135525--Sobic009G062701 Sobic004G264800 Sobic004G264800 Sobic006G135525--Sobic004G264800 Sobic005G188900 Sobic005G188900 Sobic006G135525--Sobic005G188900 Sobic009G169300 Sobic009G169300 Sobic006G135525--Sobic009G169300 Sobic002G015950 Sobic002G015950 Sobic006G135525--Sobic002G015950 Sobic004G090000 Sobic004G090000 Sobic010G210900--Sobic004G090000 Sobic010G210900--Sobic001G387700 Sobic010G210900--Sobic010G090401 Sobic007G060550 Sobic007G060550 Sobic010G210900--Sobic007G060550 Sobic010G210900--Sobic005G188900 Sobic002G064900 Sobic002G064900 Sobic010G210900--Sobic002G064900 Sobic003G342700 Sobic003G342700 Sobic010G210900--Sobic003G342700 Sobic007G157600 Sobic007G157600 Sobic010G210900--Sobic007G157600 Sobic006G180900 Sobic006G180900 Sobic010G210900--Sobic006G180900 Sobic003G137000--Sobic003G165401 Sobic003G137000--Sobic002G124832 Sobic003G137000--Sobic002G069300 Sobic003G137000--Sobic002G014100 Sobic003G137000--Sobic010G143666 Sobic003G137000--Sobic003G281000 Sobic006G142925 Sobic006G142925 Sobic003G137000--Sobic006G142925 Sobic003G137000--Sobic008G140500 Sobic003G137000--Sobic002G344800 Sobic002G124832--Sobic003G137000 Sobic002G124832--Sobic003G165401 Sobic002G124832--Sobic002G069300 Sobic002G124832--Sobic002G014100 Sobic002G124832--Sobic006G142925 Sobic002G124832--Sobic010G143666 Sobic002G124832--Sobic003G281000 Sobic002G124832--Sobic008G140500 Sobic002G124832--Sobic002G202050 Sobic005G162000 Sobic005G162000 Sobic001G387700--Sobic005G162000 Sobic003G009900 Sobic003G009900 Sobic001G387700--Sobic003G009900 Sobic005G121600 Sobic005G121600 Sobic001G387700--Sobic005G121600 Sobic008G163200 Sobic008G163200 Sobic001G387700--Sobic008G163200 Sobic005G029400 Sobic005G029400 Sobic001G387700--Sobic005G029400 Sobic001G387700--Sobic001G006300 Sobic003G058600 Sobic003G058600 Sobic001G387700--Sobic003G058600 Sobic007G009600 Sobic007G009600 Sobic001G387700--Sobic007G009600 Sobic001G387700--Sobic003G230200 Sobic003G155700--Sobic010G143666 Sobic003G155700--Sobic002G014100 Sobic003G155700--Sobic003G281000 Sobic003G155700--Sobic002G202050 Sobic003G155700--Sobic006G247200 Sobic003G155700--Sobic002G344800
Octagon: transcription factors


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