Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G046400.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R228
Pfam -
Panther DB PTHR33087 PTHR33087:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g44890.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G194801 - -
2 Sobic.009G172100 GRF zinc finger family protein, expressed -
3 Sobic.005G156201 - -
4 Sobic.008G088812 - -
5 Sobic.003G260050 - -
6 Sobic.003G111700 - -
7 Sobic.009G062701 - -
8 Sobic.003G019500 - -
9 Sobic.002G015950 - -
10 Sobic.001G310000 - -
11 Sobic.005G208425 - -
12 Sobic.004G071850 - -
13 Sobic.008G069100 expressed protein -
14 Sobic.008G016600 hydrolase, putative, expressed K14664: IAA-amino acid hydrolase
15 Sobic.002G382200 - -
16 Sobic.010G143666 - -
17 Sobic.002G344800 - -
18 Sobic.001G450200 - -
19 Sobic.006G247200 AMP-binding enzyme, putative, expressed -
20 Sobic.009G043900 O-methyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G046400 Sobic009G046400 Sobic010G194801 Sobic010G194801 Sobic009G046400--Sobic010G194801 Sobic009G172100 Sobic009G172100 Sobic009G046400--Sobic009G172100 Sobic005G156201 Sobic005G156201 Sobic009G046400--Sobic005G156201 Sobic008G088812 Sobic008G088812 Sobic009G046400--Sobic008G088812 Sobic003G260050 Sobic003G260050 Sobic009G046400--Sobic003G260050 Sobic003G111700 Sobic003G111700 Sobic009G046400--Sobic003G111700 Sobic009G062701 Sobic009G062701 Sobic009G046400--Sobic009G062701 Sobic003G019500 Sobic003G019500 Sobic009G046400--Sobic003G019500 Sobic002G015950 Sobic002G015950 Sobic009G046400--Sobic002G015950 Sobic010G194801--Sobic003G111700 Sobic010G194801--Sobic003G019500 Sobic010G194801--Sobic003G260050 Sobic010G194801--Sobic008G088812 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic010G194801--Sobic002G202050 Sobic006G247200 Sobic006G247200 Sobic010G194801--Sobic006G247200 Sobic009G172100--Sobic005G156201 Sobic009G172100--Sobic008G088812 Sobic009G018100 Sobic009G018100 Sobic009G172100--Sobic009G018100 Sobic009G172100--Sobic010G194801 Sobic009G172100--Sobic003G019500 Sobic005G208425 Sobic005G208425 Sobic009G172100--Sobic005G208425 Sobic009G172100--Sobic003G111700 Sobic001G310000 Sobic001G310000 Sobic009G172100--Sobic001G310000 Sobic005G205100 Sobic005G205100 Sobic009G172100--Sobic005G205100 Sobic005G156201--Sobic003G019500 Sobic005G156201--Sobic009G018100 Sobic005G156201--Sobic008G088812 Sobic005G156201--Sobic010G194801 Sobic005G156201--Sobic009G172100 Sobic005G156201--Sobic003G111700 Sobic005G156201--Sobic001G310000 Sobic005G156201--Sobic005G208425 Sobic005G156201--Sobic005G205100 Sobic008G088812--Sobic010G194801 Sobic008G088812--Sobic003G019500 Sobic008G088812--Sobic005G156201 Sobic008G088812--Sobic003G111700 Sobic008G088812--Sobic003G260050 Sobic008G088812--Sobic001G310000 Sobic008G088812--Sobic005G208425 Sobic009G043900 Sobic009G043900 Sobic008G088812--Sobic009G043900 Sobic008G088812--Sobic002G015950 Sobic003G260050--Sobic003G111700 Sobic003G260050--Sobic010G194801 Sobic003G260050--Sobic002G202050 Sobic003G260050--Sobic006G247200 Sobic003G260050--Sobic002G015950 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic003G260050--Sobic003G281000 Sobic003G111700--Sobic003G260050 Sobic003G111700--Sobic010G194801 Sobic003G111700--Sobic002G202050 Sobic003G111700--Sobic006G247200 Sobic003G111700--Sobic003G281000 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic003G111700--Sobic010G143666 Sobic002G014100 Sobic002G014100 Sobic009G062701--Sobic002G014100 Sobic005G133750 Sobic005G133750 Sobic009G062701--Sobic005G133750 Sobic009G062701--Sobic010G143666 Sobic009G062701--Sobic003G281000 Sobic009G062701--Sobic006G247200 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic009G062701--Sobic002G069300 Sobic009G062701--Sobic002G202050 Sobic003G019500--Sobic010G194801 Sobic003G019500--Sobic003G111700 Sobic003G019500--Sobic005G156201 Sobic003G019500--Sobic008G088812 Sobic003G019500--Sobic003G260050 Sobic003G019500--Sobic009G043900 Sobic003G019500--Sobic002G202050 Sobic002G015950--Sobic003G260050 Sobic002G015950--Sobic003G111700 Sobic009G193600 Sobic009G193600 Sobic002G015950--Sobic009G193600 Sobic002G015950--Sobic001G310000 Sobic002G015950--Sobic010G194801 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic002G015950--Sobic010G011500 Sobic004G071850 Sobic004G071850 Sobic002G015950--Sobic004G071850 Sobic002G266700 Sobic002G266700 Sobic002G015950--Sobic002G266700 Sobic002G015950--Sobic009G043900
Octagon: transcription factors


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