Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G098700.3,Sobic.010G098700.4,Sobic.010G098700.7,Sobic.010G098700.6,Sobic.010G098700.5,Sobic.010G098700.8
Synonym Sb10g008590
Functional annotation hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, putative, expressed
UniProt C5Z7I0
Pfam PF00730
Panther DB PTHR10359 PTHR10359:SF31
NCBI CDD KOG1918; 3-methyladenine DNA glycosidase
KEGG Orthology K10773; endonuclease III
Gene Ontology GO:0006284; base-excision repair


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G47830 : DNA glycosylase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g13070.1 : hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a042638
Brachypodium KQK18796 , KQK18798
Barley HORVU7Hr1G039710.1 , HORVU7Hr1G039710.3 , HORVU7Hr1G039710.2 , HORVU7Hr1G039710.5 , HORVU7Hr1G039710.4 , HORVU7Hr1G039710.7 , HORVU7Hr1G039710.6 , HORVU7Hr1G039710.9 , HORVU7Hr1G039710.8 , HORVU7Hr1G039710.14 , HORVU7Hr1G039710.11 , HORVU7Hr1G039710.10 , HORVU7Hr1G039710.13 , HORVU7Hr1G039710.12
Wheat TraesCS7B02G100500 , TraesCS7A02G194800 , TraesCS7D02G196400 , TraesCS7D02G196400
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Gene co-expression network
sample Sobic010G098700 Sobic010G098700 Sobic010G121401 Sobic010G121401 Sobic010G098700--Sobic010G121401 Sobic008G181701 Sobic008G181701 Sobic010G098700--Sobic008G181701 Sobic010G122900 Sobic010G122900 Sobic010G098700--Sobic010G122900 Sobic006G004800 Sobic006G004800 Sobic010G098700--Sobic006G004800 Sobic009G121150 Sobic009G121150 Sobic010G098700--Sobic009G121150 Sobic002G017100 Sobic002G017100 Sobic010G098700--Sobic002G017100 Sobic001G165401 Sobic001G165401 Sobic010G098700--Sobic001G165401 Sobic003G013950 Sobic003G013950 Sobic010G098700--Sobic003G013950 Sobic009G081900 Sobic009G081900 Sobic010G098700--Sobic009G081900 Sobic010G121401--Sobic003G013950 Sobic002G040201 Sobic002G040201 Sobic010G121401--Sobic002G040201 Sobic004G091401 Sobic004G091401 Sobic010G121401--Sobic004G091401 Sobic010G121401--Sobic010G098700 Sobic010G111450 Sobic010G111450 Sobic010G121401--Sobic010G111450 Sobic010G121401--Sobic009G121150 Sobic010G121401--Sobic009G081900 Sobic002G251050 Sobic002G251050 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Octagon: transcription factors


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