Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G172100.1,Sobic.010G172100.2
Synonym Sb10g022460
Functional annotation CPuORF31 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed
UniProt C5Z516
Pfam -
Panther DB PTHR12565 PTHR12565:SF155
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G29950 : basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g39432.2,LOC_Os03g39432.1 : CPuORF31 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a042392 , Zm00025a051109 , Zm00025a042300
Brachypodium KQJ94524
Barley HORVU7Hr1G083390.8 , HORVU7Hr1G083390.9 , HORVU7Hr1G083390.1 , HORVU7Hr1G083390.2 , HORVU7Hr1G083390.3 , HORVU7Hr1G083390.4 , HORVU7Hr1G083390.5 , HORVU7Hr1G083390.6 , HORVU7Hr1G083390.7 , HORVU7Hr1G083390.10
Wheat TraesCS7D02G346300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.002G367850 - -
20 Sobic.003G015800 endoglucanase precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G172100 Sobic010G172100 Sobic004G310000 Sobic004G310000 Sobic010G172100--Sobic004G310000 Sobic010G155500 Sobic010G155500 Sobic010G172100--Sobic010G155500 Sobic004G258800 Sobic004G258800 Sobic010G172100--Sobic004G258800 Sobic003G217000 Sobic003G217000 Sobic010G172100--Sobic003G217000 Sobic001G075900 Sobic001G075900 Sobic010G172100--Sobic001G075900 Sobic009G151500 Sobic009G151500 Sobic010G172100--Sobic009G151500 Sobic001G523500 Sobic001G523500 Sobic010G172100--Sobic001G523500 Sobic010G078800 Sobic010G078800 Sobic010G172100--Sobic010G078800 Sobic009G177600 Sobic009G177600 Sobic010G172100--Sobic009G177600 Sobic004G310000--Sobic009G151500 Sobic002G331200 Sobic002G331200 Sobic004G310000--Sobic002G331200 Sobic001G214400 Sobic001G214400 Sobic004G310000--Sobic001G214400 Sobic002G284300 Sobic002G284300 Sobic004G310000--Sobic002G284300 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic004G310000--Sobic009G094000 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic004G310000--Sobic002G018133 Sobic006G045301 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Sobic010G029200 Sobic009G177600--Sobic010G029200
Octagon: transcription factors


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