Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G093666.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S509
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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TAIR -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G049700 expressed protein -
2 Sobic.010G143633 - -
3 Sobic.004G116050 - -
4 Sobic.005G144500 glycosyltransferase, putative, expressed -
5 Sobic.005G048950 - -
6 Sobic.002G382100 LTPL56 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
7 Sobic.007G171700 miro, putative, expressed K07953: GTP-binding protein SAR1
8 Sobic.002G361500 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf and root, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@Indole-acetic acid (IAA)-amido synthetase(PubMedID : 30367619)@OsGH3.8 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14487: auxin responsive GH3 gene family
9 Sobic.004G329201 - K02260: cytochrome c oxidase assembly protein subunit 17
10 Sobic.006G064450 - -
11 Sobic.008G105600 - -
12 Sobic.002G424200 SNF1-related protein kinase regulatory subunit beta-1, putative, expressed K07199: 5'-AMP-activated protein kinase, regulatory beta subunit
13 Sobic.001G117701 - -
14 Sobic.006G038700 - -
15 Sobic.006G254400 expressed protein -
16 Sobic.001G345500 - -
17 Sobic.009G006700 vacuolar ATP synthase, putative, expressed K02155: ATPeV0C, V-type H+-transporting ATPase 16kDa proteolipid subunit
18 Sobic.004G020200 expressed protein -
19 Sobic.009G107140 - -
20 Sobic.007G219601 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G093666 Sobic001G093666 Sobic010G049700 Sobic010G049700 Sobic001G093666--Sobic010G049700 Sobic010G143633 Sobic010G143633 Sobic001G093666--Sobic010G143633 Sobic004G116050 Sobic004G116050 Sobic001G093666--Sobic004G116050 Sobic005G144500 Sobic005G144500 Sobic001G093666--Sobic005G144500 Sobic005G048950 Sobic005G048950 Sobic001G093666--Sobic005G048950 Sobic002G382100 Sobic002G382100 Sobic001G093666--Sobic002G382100 Sobic007G171700 Sobic007G171700 Sobic001G093666--Sobic007G171700 Sobic002G361500 Sobic002G361500 Sobic001G093666--Sobic002G361500 Sobic004G329201 Sobic004G329201 Sobic001G093666--Sobic004G329201 Sobic010G049700--Sobic004G116050 Sobic010G049700--Sobic005G144500 Sobic010G049700--Sobic010G143633 Sobic006G064450 Sobic006G064450 Sobic010G049700--Sobic006G064450 Sobic001G345500 Sobic001G345500 Sobic010G049700--Sobic001G345500 Sobic009G006700 Sobic009G006700 Sobic010G049700--Sobic009G006700 Sobic007G219601 Sobic007G219601 Sobic010G049700--Sobic007G219601 Sobic006G038700 Sobic006G038700 Sobic010G049700--Sobic006G038700 Sobic007G094700 Sobic007G094700 Sobic010G049700--Sobic007G094700 Sobic008G105600 Sobic008G105600 Sobic010G143633--Sobic008G105600 Sobic010G143633--Sobic005G048950 Sobic010G143633--Sobic010G049700 Sobic010G143633--Sobic004G116050 Sobic010G143633--Sobic006G038700 Sobic001G117701 Sobic001G117701 Sobic010G143633--Sobic001G117701 Sobic010G143633--Sobic005G144500 Sobic010G143633--Sobic007G171700 Sobic010G143633--Sobic009G006700 Sobic004G116050--Sobic010G049700 Sobic004G116050--Sobic010G143633 Sobic004G116050--Sobic005G144500 Sobic004G116050--Sobic001G117701 Sobic004G116050--Sobic006G038700 Sobic004G116050--Sobic001G345500 Sobic004G116050--Sobic006G064450 Sobic004G116050--Sobic009G006700 Sobic004G116050--Sobic008G105600 Sobic005G144500--Sobic006G064450 Sobic005G144500--Sobic007G219601 Sobic005G144500--Sobic007G094700 Sobic008G155700 Sobic008G155700 Sobic005G144500--Sobic008G155700 Sobic005G144500--Sobic009G006700 Sobic003G133600 Sobic003G133600 Sobic005G144500--Sobic003G133600 Sobic004G203150 Sobic004G203150 Sobic005G144500--Sobic004G203150 Sobic005G144500--Sobic010G049700 Sobic010G038000 Sobic010G038000 Sobic005G144500--Sobic010G038000 Sobic005G048950--Sobic010G143633 Sobic005G048950--Sobic008G105600 Sobic005G048950--Sobic010G049700 Sobic005G048950--Sobic004G116050 Sobic005G048950--Sobic001G093666 Sobic005G048950--Sobic006G038700 Sobic003G167200 Sobic003G167200 Sobic005G048950--Sobic003G167200 Sobic005G048950--Sobic007G171700 Sobic005G048950--Sobic001G117701 Sobic002G382100--Sobic002G361500 Sobic004G328100 Sobic004G328100 Sobic002G382100--Sobic004G328100 Sobic010G198400 Sobic010G198400 Sobic002G382100--Sobic010G198400 Sobic002G424200 Sobic002G424200 Sobic002G382100--Sobic002G424200 Sobic002G382100--Sobic001G093666 Sobic002G382100--Sobic006G038700 Sobic006G199500 Sobic006G199500 Sobic002G382100--Sobic006G199500 Sobic002G382100--Sobic005G144500 Sobic004G020200 Sobic004G020200 Sobic002G382100--Sobic004G020200 Sobic003G001901 Sobic003G001901 Sobic007G171700--Sobic003G001901 Sobic007G171700--Sobic010G049700 Sobic005G173700 Sobic005G173700 Sobic007G171700--Sobic005G173700 Sobic003G218000 Sobic003G218000 Sobic007G171700--Sobic003G218000 Sobic006G254400 Sobic006G254400 Sobic007G171700--Sobic006G254400 Sobic002G080450 Sobic002G080450 Sobic007G171700--Sobic002G080450 Sobic007G171700--Sobic005G144500 Sobic002G099700 Sobic002G099700 Sobic007G171700--Sobic002G099700 Sobic007G171700--Sobic010G143633 Sobic002G361500--Sobic002G424200 Sobic002G361500--Sobic009G006700 Sobic002G361500--Sobic005G144500 Sobic002G361500--Sobic006G038700 Sobic002G361500--Sobic010G198400 Sobic002G361500--Sobic007G219601 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic002G361500--Sobic009G008000 Sobic002G361500--Sobic004G020200 Sobic002G361500--Sobic006G254400 Sobic004G329201--Sobic005G144500 Sobic004G329201--Sobic006G254400 Sobic004G329201--Sobic002G424200 Sobic004G329201--Sobic004G116050 Sobic004G329201--Sobic002G361500 Sobic008G095633 Sobic008G095633 Sobic004G329201--Sobic008G095633 Sobic004G329201--Sobic010G049700 Sobic004G329201--Sobic010G198400 Sobic004G329201--Sobic010G038000
Octagon: transcription factors


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