Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G134000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5WPJ8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.001G134000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G319900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AAA family ATPase, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
2 Sobic.007G014500 NB-ARC domain containing protein, expressed -
3 Sobic.003G334500 - -
4 Sobic.004G271350 - -
5 Sobic.003G267150 - -
6 Sobic.005G216833 - -
7 Sobic.008G041500 - -
8 Sobic.003G282400 OsMADS32 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
9 Sobic.007G179100 - -
10 Sobic.004G262550 - -
11 Sobic.009G091940 - -
12 Sobic.005G230100 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
13 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
14 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
15 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
16 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
17 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
18 Sobic.010G207175 - -
19 Sobic.004G264900 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K00817: histidinol-phosphate aminotransferase
20 Sobic.004G313000 leucine rich repeat containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G134000 Sobic001G134000 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic001G134000--Sobic002G319900 Sobic007G014500 Sobic007G014500 Sobic001G134000--Sobic007G014500 Sobic003G334500 Sobic003G334500 Sobic001G134000--Sobic003G334500 Sobic004G271350 Sobic004G271350 Sobic001G134000--Sobic004G271350 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic001G134000--Sobic003G267150 Sobic005G216833 Sobic005G216833 Sobic001G134000--Sobic005G216833 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic001G134000--Sobic008G041500 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic001G134000--Sobic003G282400 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic001G134000--Sobic007G179100 Sobic002G319900--Sobic003G267150 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic002G319900--Sobic002G160500 Sobic004G262550 Sobic004G262550 Sobic002G319900--Sobic004G262550 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic002G319900--Sobic004G313000 Sobic009G091940 Sobic009G091940 Sobic002G319900--Sobic009G091940 Sobic007G014500--Sobic002G319900 Sobic007G014500--Sobic004G262550 Sobic007G014500--Sobic003G267150 Sobic007G014500--Sobic002G160500 Sobic007G014500--Sobic004G313000 Sobic003G334500--Sobic008G041500 Sobic003G334500--Sobic007G179100 Sobic009G134700 Sobic009G134700 Sobic003G334500--Sobic009G134700 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic003G334500--Sobic006G083050 Sobic006G214800 Sobic006G214800 Sobic003G334500--Sobic006G214800 Sobic001G180950 Sobic001G180950 Sobic003G334500--Sobic001G180950 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic003G334500--Sobic010G156300 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic003G334500--Sobic008G142500 Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic003G334500--Sobic010G166850 Sobic003G389150 Sobic003G389150 Sobic004G271350--Sobic003G389150 Sobic004G271350--Sobic002G160500 Sobic004G271350--Sobic003G267150 Sobic004G271350--Sobic004G262550 Sobic004G271350--Sobic009G091940 Sobic003G267150--Sobic002G160500 Sobic003G267150--Sobic004G262550 Sobic003G267150--Sobic009G091940 Sobic003G267150--Sobic004G313000 Sobic003G267150--Sobic003G389150 Sobic005G216833--Sobic004G313000 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic005G216833--Sobic009G115800 Sobic009G236150 Sobic009G236150 Sobic005G216833--Sobic009G236150 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic005G216833--Sobic003G261766 Sobic005G216833--Sobic003G267150 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic005G216833--Sobic006G159500 Sobic008G108100 Sobic008G108100 Sobic005G216833--Sobic008G108100 Sobic005G216833--Sobic002G160500 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic008G041500--Sobic009G035000 Sobic008G041500--Sobic003G282400 Sobic008G041500--Sobic007G179100 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic008G041500--Sobic010G002600 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic008G041500--Sobic002G062400 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic008G041500--Sobic001G163500 Sobic008G041500--Sobic010G156300 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic008G041500--Sobic003G129700 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic008G041500--Sobic007G045750 Sobic003G282400--Sobic002G062400 Sobic003G282400--Sobic001G163500 Sobic003G282400--Sobic003G129700 Sobic006G009200 Sobic006G009200 Sobic003G282400--Sobic006G009200 Sobic003G282400--Sobic008G041500 Sobic003G282400--Sobic009G035000 Sobic003G282400--Sobic007G045750 Sobic006G193801 Sobic006G193801 Sobic003G282400--Sobic006G193801 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic003G282400--Sobic009G158150 Sobic007G179100--Sobic010G156300 Sobic007G179100--Sobic010G166850 Sobic007G179100--Sobic008G041500 Sobic010G207175 Sobic010G207175 Sobic007G179100--Sobic010G207175 Sobic007G179100--Sobic001G163500 Sobic007G179100--Sobic007G045750 Sobic007G179100--Sobic003G282400 Sobic007G179100--Sobic009G035000 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic007G179100--Sobic002G022500
Octagon: transcription factors


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