Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G230100.1
Synonym
Functional annotation GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PU74
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636 PTHR31636:SF59
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G37650 : GRAS family transcription factor
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g47870.1 : GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS4D02G136500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G134000 - -
2 Sobic.002G182900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
3 Sobic.004G248000 expressed protein -
4 Sobic.002G319900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AAA family ATPase, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
5 Sobic.006G050550 - -
6 Sobic.004G149150 - -
7 Sobic.003G334500 - -
8 Sobic.007G177901 - -
9 Sobic.001G454850 - -
10 Sobic.004G271350 - -
11 Sobic.006G159500 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
12 Sobic.009G115800 REX1 DNA Repair family protein, expressed K10845: TTDA, GTF2H5, TFIIH basal transcription factor complex TTD-A subunit
13 Sobic.004G262550 - -
14 Sobic.004G264900 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K00817: histidinol-phosphate aminotransferase
15 Sobic.004G313000 leucine rich repeat containing protein, expressed -
16 Sobic.003G267150 - -
17 Sobic.003G261766 - -
18 Sobic.005G216833 - -
19 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
20 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1


Gene co-expression network
sample Sobic005G230100 Sobic005G230100 Sobic001G134000 Sobic001G134000 Sobic005G230100--Sobic001G134000 Sobic002G182900 Sobic002G182900 Sobic005G230100--Sobic002G182900 Sobic004G248000 Sobic004G248000 Sobic005G230100--Sobic004G248000 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic005G230100--Sobic002G319900 Sobic006G050550 Sobic006G050550 Sobic005G230100--Sobic006G050550 Sobic004G149150 Sobic004G149150 Sobic005G230100--Sobic004G149150 Sobic003G334500 Sobic003G334500 Sobic005G230100--Sobic003G334500 Sobic007G177901 Sobic007G177901 Sobic005G230100--Sobic007G177901 Sobic001G454850 Sobic001G454850 Sobic005G230100--Sobic001G454850 Sobic001G134000--Sobic002G319900 Sobic007G014500 Sobic007G014500 Sobic001G134000--Sobic007G014500 Sobic001G134000--Sobic003G334500 Sobic004G271350 Sobic004G271350 Sobic001G134000--Sobic004G271350 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic001G134000--Sobic003G267150 Sobic005G216833 Sobic005G216833 Sobic001G134000--Sobic005G216833 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic001G134000--Sobic008G041500 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic001G134000--Sobic003G282400 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic001G134000--Sobic007G179100 Sobic009G253950 Sobic009G253950 Sobic002G182900--Sobic009G253950 Sobic002G182800 Sobic002G182800 Sobic002G182900--Sobic002G182800 Sobic009G216900 Sobic009G216900 Sobic002G182900--Sobic009G216900 Sobic003G040800 Sobic003G040800 Sobic002G182900--Sobic003G040800 Sobic003G233900 Sobic003G233900 Sobic002G182900--Sobic003G233900 Sobic009G128300 Sobic009G128300 Sobic002G182900--Sobic009G128300 Sobic002G182900--Sobic006G050550 Sobic010G085400 Sobic010G085400 Sobic002G182900--Sobic010G085400 Sobic003G227600 Sobic003G227600 Sobic002G182900--Sobic003G227600 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic004G248000--Sobic002G160500 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic004G248000--Sobic004G313000 Sobic004G248000--Sobic003G267150 Sobic004G262550 Sobic004G262550 Sobic004G248000--Sobic004G262550 Sobic004G248000--Sobic002G319900 Sobic002G319900--Sobic003G267150 Sobic002G319900--Sobic002G160500 Sobic002G319900--Sobic004G262550 Sobic002G319900--Sobic004G313000 Sobic009G091940 Sobic009G091940 Sobic002G319900--Sobic009G091940 Sobic005G181600 Sobic005G181600 Sobic006G050550--Sobic005G181600 Sobic006G050550--Sobic002G182900 Sobic006G050550--Sobic005G230100 Sobic010G245900 Sobic010G245900 Sobic006G050550--Sobic010G245900 Sobic003G267300 Sobic003G267300 Sobic006G050550--Sobic003G267300 Sobic006G050550--Sobic009G253950 Sobic008G016850 Sobic008G016850 Sobic006G050550--Sobic008G016850 Sobic006G050550--Sobic001G134000 Sobic006G050550--Sobic003G334500 Sobic004G149150--Sobic002G160500 Sobic004G149150--Sobic003G267150 Sobic004G149150--Sobic004G262550 Sobic004G149150--Sobic009G091940 Sobic003G389150 Sobic003G389150 Sobic004G149150--Sobic003G389150 Sobic003G334500--Sobic008G041500 Sobic003G334500--Sobic007G179100 Sobic009G134700 Sobic009G134700 Sobic003G334500--Sobic009G134700 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic003G334500--Sobic006G083050 Sobic006G214800 Sobic006G214800 Sobic003G334500--Sobic006G214800 Sobic001G180950 Sobic001G180950 Sobic003G334500--Sobic001G180950 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic003G334500--Sobic010G156300 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic003G334500--Sobic008G142500 Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic003G334500--Sobic010G166850 Sobic008G134401 Sobic008G134401 Sobic007G177901--Sobic008G134401 Sobic007G177901--Sobic004G248000 Sobic002G145600 Sobic002G145600 Sobic007G177901--Sobic002G145600 Sobic004G259800 Sobic004G259800 Sobic007G177901--Sobic004G259800 Sobic004G313750 Sobic004G313750 Sobic007G177901--Sobic004G313750 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic007G177901--Sobic006G159500 Sobic001G237250 Sobic001G237250 Sobic007G177901--Sobic001G237250 Sobic005G044101 Sobic005G044101 Sobic007G177901--Sobic005G044101 Sobic007G177901--Sobic009G134700 Sobic001G217850 Sobic001G217850 Sobic001G454850--Sobic001G217850 Sobic003G357900 Sobic003G357900 Sobic001G454850--Sobic003G357900 Sobic004G176550 Sobic004G176550 Sobic001G454850--Sobic004G176550 Sobic007G132300 Sobic007G132300 Sobic001G454850--Sobic007G132300 Sobic010G241400 Sobic010G241400 Sobic001G454850--Sobic010G241400 Sobic001G454850--Sobic005G216833 Sobic001G334800 Sobic001G334800 Sobic001G454850--Sobic001G334800 Sobic006G192900 Sobic006G192900 Sobic001G454850--Sobic006G192900 Sobic005G165300 Sobic005G165300 Sobic001G454850--Sobic005G165300
Octagon: transcription factors


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