Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G454850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SB10
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G217850 - -
2 Sobic.003G357900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@strictosidine synthase, putative, expressed -
3 Sobic.004G176550 - -
4 Sobic.007G132300 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -
5 Sobic.010G241400 expressed protein -
6 Sobic.005G216833 - -
7 Sobic.001G334800 - -
8 Sobic.006G192900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@protein kinase domain containing protein, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
9 Sobic.005G165300 cyclin-dependent kinase G-1, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
10 Sobic.005G168900 expressed protein -
11 Sobic.009G170050 - -
12 Sobic.002G062400 - -
13 Sobic.006G009200 expressed protein -
14 Sobic.002G018800 expressed protein -
15 Sobic.009G236150 - -
16 Sobic.002G319900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AAA family ATPase, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
17 Sobic.004G313000 leucine rich repeat containing protein, expressed -
18 Sobic.009G115800 REX1 DNA Repair family protein, expressed K10845: TTDA, GTF2H5, TFIIH basal transcription factor complex TTD-A subunit
19 Sobic.009G134700 - -
20 Sobic.003G261766 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G454850 Sobic001G454850 Sobic001G217850 Sobic001G217850 Sobic001G454850--Sobic001G217850 Sobic003G357900 Sobic003G357900 Sobic001G454850--Sobic003G357900 Sobic004G176550 Sobic004G176550 Sobic001G454850--Sobic004G176550 Sobic007G132300 Sobic007G132300 Sobic001G454850--Sobic007G132300 Sobic010G241400 Sobic010G241400 Sobic001G454850--Sobic010G241400 Sobic005G216833 Sobic005G216833 Sobic001G454850--Sobic005G216833 Sobic001G334800 Sobic001G334800 Sobic001G454850--Sobic001G334800 Sobic006G192900 Sobic006G192900 Sobic001G454850--Sobic006G192900 Sobic005G165300 Sobic005G165300 Sobic001G454850--Sobic005G165300 Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic001G217850--Sobic005G168900 Sobic009G170050 Sobic009G170050 Sobic001G217850--Sobic009G170050 Sobic001G217850--Sobic010G241400 Sobic001G217850--Sobic004G176550 Sobic001G217850--Sobic003G357900 Sobic001G217850--Sobic006G192900 Sobic006G174050 Sobic006G174050 Sobic001G217850--Sobic006G174050 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic001G217850--Sobic002G062400 Sobic006G009200 Sobic006G009200 Sobic001G217850--Sobic006G009200 Sobic001G443400 Sobic001G443400 Sobic003G357900--Sobic001G443400 Sobic003G357900--Sobic005G165300 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic003G357900--Sobic009G025750 Sobic003G357900--Sobic005G168900 Sobic003G357900--Sobic006G174050 Sobic003G357900--Sobic001G334800 Sobic006G250350 Sobic006G250350 Sobic003G357900--Sobic006G250350 Sobic002G018800 Sobic002G018800 Sobic003G357900--Sobic002G018800 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic003G357900--Sobic010G166201 Sobic005G119400 Sobic005G119400 Sobic004G176550--Sobic005G119400 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic004G176550--Sobic003G261766 Sobic004G176550--Sobic006G009200 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic004G176550--Sobic009G115800 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic004G176550--Sobic007G045750 Sobic004G176550--Sobic002G062400 Sobic010G124100 Sobic010G124100 Sobic004G176550--Sobic010G124100 Sobic004G176550--Sobic009G025750 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic004G176550--Sobic006G083050 Sobic007G132300--Sobic001G334800 Sobic010G003800 Sobic010G003800 Sobic007G132300--Sobic010G003800 Sobic007G132300--Sobic005G165300 Sobic007G132300--Sobic002G018800 Sobic001G112550 Sobic001G112550 Sobic007G132300--Sobic001G112550 Sobic007G132300--Sobic005G216833 Sobic005G161750 Sobic005G161750 Sobic007G132300--Sobic005G161750 Sobic007G050750 Sobic007G050750 Sobic007G132300--Sobic007G050750 Sobic007G132300--Sobic006G250350 Sobic010G241400--Sobic006G192900 Sobic010G241400--Sobic006G009200 Sobic010G241400--Sobic002G062400 Sobic010G241400--Sobic005G168900 Sobic010G241400--Sobic001G217850 Sobic010G241400--Sobic004G176550 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic010G241400--Sobic009G035000 Sobic010G241400--Sobic009G170050 Sobic001G134150 Sobic001G134150 Sobic010G241400--Sobic001G134150 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic005G216833--Sobic004G313000 Sobic005G216833--Sobic009G115800 Sobic009G236150 Sobic009G236150 Sobic005G216833--Sobic009G236150 Sobic005G216833--Sobic003G261766 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic005G216833--Sobic003G267150 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic005G216833--Sobic006G159500 Sobic008G108100 Sobic008G108100 Sobic005G216833--Sobic008G108100 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic005G216833--Sobic002G160500 Sobic001G334800--Sobic005G165300 Sobic001G334800--Sobic002G018800 Sobic001G334800--Sobic010G003800 Sobic001G334800--Sobic005G216833 Sobic001G334800--Sobic005G161750 Sobic001G334800--Sobic001G112550 Sobic001G334800--Sobic007G132300 Sobic001G334800--Sobic006G250350 Sobic001G334800--Sobic009G236150 Sobic006G192900--Sobic010G241400 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic006G192900--Sobic010G002600 Sobic002G307500 Sobic002G307500 Sobic006G192900--Sobic002G307500 Sobic006G192900--Sobic009G035000 Sobic006G192900--Sobic006G009200 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic006G192900--Sobic008G041500 Sobic004G181400 Sobic004G181400 Sobic006G192900--Sobic004G181400 Sobic004G093800 Sobic004G093800 Sobic006G192900--Sobic004G093800 Sobic006G192900--Sobic002G062400 Sobic005G165300--Sobic001G334800 Sobic005G165300--Sobic002G018800 Sobic005G165300--Sobic005G216833 Sobic005G165300--Sobic003G261766 Sobic005G165300--Sobic010G003800 Sobic005G165300--Sobic009G115800 Sobic005G165300--Sobic006G250350 Sobic005G165300--Sobic006G083050 Sobic005G165300--Sobic009G236150
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.