Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G149300.2,Sobic.001G149300.1
Synonym Sb01g012980
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WQH3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g46730.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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1 Sobic.009G230800 Up-regulation in phyB-1 mutant(PubMedID : 26893475)@inhibiting the nuclear localization of BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 2(PubMedID : 28273925)@decreased the cell proliferation rates(PubMedID : 27329702)@gibberellin 2-beta-dioxygenase, putative, expressed K04125: gibberellin 2beta-dioxygenase
2 Sobic.004G057300 expressed protein -
3 Sobic.003G428500 expressed protein -
4 Sobic.004G052600 - -
5 Sobic.005G058600 csAtPR5, putative, expressed -
6 Sobic.005G007200 DEFL53 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
7 Sobic.008G155500 ankyrin repeat domain-containing protein 44, putative, expressed -
8 Sobic.007G110800 expressed protein -
9 Sobic.006G224400 ubiquitin family protein, putative, expressed K08770: ubiquitin C
K12158: ubiquitin-like protein Nedd8
K04551: ubiquitin B
10 Sobic.004G086900 - -
11 Sobic.005G087732 - -
12 Sobic.007G167950 - -
13 Sobic.007G082300 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
14 Sobic.003G191200 expressed protein -
15 Sobic.008G177001 - -
16 Sobic.003G133201 - -
17 Sobic.006G170500 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
18 Sobic.005G058300 expressed protein -
19 Sobic.009G121200 stromal membrane-associated protein, putative, expressed K12486: stromal membrane-associated protein
20 Sobic.005G000900 OsFBX103 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G149300 Sobic001G149300 Sobic009G230800 Sobic009G230800 Sobic001G149300--Sobic009G230800 Sobic004G057300 Sobic004G057300 Sobic001G149300--Sobic004G057300 Sobic003G428500 Sobic003G428500 Sobic001G149300--Sobic003G428500 Sobic004G052600 Sobic004G052600 Sobic001G149300--Sobic004G052600 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic001G149300--Sobic005G058600 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic001G149300--Sobic005G007200 Sobic008G155500 Sobic008G155500 Sobic001G149300--Sobic008G155500 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic001G149300--Sobic007G110800 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic001G149300--Sobic006G224400 Sobic010G202200 Sobic010G202200 Sobic009G230800--Sobic010G202200 Sobic006G269101 Sobic006G269101 Sobic009G230800--Sobic006G269101 Sobic009G230800--Sobic004G052600 Sobic008G136601 Sobic008G136601 Sobic009G230800--Sobic008G136601 Sobic001G340800 Sobic001G340800 Sobic009G230800--Sobic001G340800 Sobic004G328500 Sobic004G328500 Sobic009G230800--Sobic004G328500 Sobic008G148600 Sobic008G148600 Sobic009G230800--Sobic008G148600 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic009G230800--Sobic005G000900 Sobic005G221675 Sobic005G221675 Sobic009G230800--Sobic005G221675 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic004G057300--Sobic003G191200 Sobic004G057300--Sobic004G052600 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic004G057300--Sobic007G082100 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic004G057300--Sobic007G081100 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic004G057300--Sobic007G031200 Sobic007G198900 Sobic007G198900 Sobic004G057300--Sobic007G198900 Sobic001G538425 Sobic001G538425 Sobic004G057300--Sobic001G538425 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic004G057300--Sobic010G123800 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic004G057300--Sobic005G058300 Sobic001G021200 Sobic001G021200 Sobic003G428500--Sobic001G021200 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic003G428500--Sobic008G168500 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic003G428500--Sobic008G088500 Sobic002G096600 Sobic002G096600 Sobic003G428500--Sobic002G096600 Sobic005G058000 Sobic005G058000 Sobic003G428500--Sobic005G058000 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic003G428500--Sobic001G364300 Sobic003G428500--Sobic005G007200 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic003G428500--Sobic005G058200 Sobic004G003300 Sobic004G003300 Sobic003G428500--Sobic004G003300 Sobic004G052600--Sobic005G000900 Sobic002G182701 Sobic002G182701 Sobic004G052600--Sobic002G182701 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic004G052600--Sobic006G017700 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic004G052600--Sobic004G100300 Sobic006G017900 Sobic006G017900 Sobic004G052600--Sobic006G017900 Sobic001G211700 Sobic001G211700 Sobic004G052600--Sobic001G211700 Sobic002G156400 Sobic002G156400 Sobic004G052600--Sobic002G156400 Sobic009G182100 Sobic009G182100 Sobic004G052600--Sobic009G182100 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic004G052600--Sobic002G384900 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic005G058600--Sobic003G133201 Sobic005G058600--Sobic007G031200 Sobic004G050900 Sobic004G050900 Sobic005G058600--Sobic004G050900 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic005G058600--Sobic008G169101 Sobic005G058600--Sobic003G191200 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic005G058600--Sobic009G110333 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic005G058600--Sobic002G402900 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic005G058600--Sobic005G077001 Sobic005G058600--Sobic005G000900 Sobic005G007200--Sobic005G058200 Sobic005G007200--Sobic001G364300 Sobic005G007200--Sobic008G088500 Sobic005G007200--Sobic008G168500 Sobic007G082300 Sobic007G082300 Sobic005G007200--Sobic007G082300 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic005G007200--Sobic004G086900 Sobic005G007200--Sobic002G096600 Sobic005G007200--Sobic005G058000 Sobic008G177001 Sobic008G177001 Sobic005G007200--Sobic008G177001 Sobic008G155500--Sobic008G088500 Sobic008G155500--Sobic002G096600 Sobic008G155500--Sobic005G058000 Sobic008G155500--Sobic008G168500 Sobic008G155500--Sobic005G058200 Sobic008G155500--Sobic001G364300 Sobic008G155500--Sobic005G007200 Sobic008G155500--Sobic001G021200 Sobic009G047900 Sobic009G047900 Sobic008G155500--Sobic009G047900 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic007G110800--Sobic005G087732 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic007G110800--Sobic007G167950 Sobic007G110800--Sobic004G086900 Sobic007G110800--Sobic007G082300 Sobic007G110800--Sobic005G058300 Sobic007G110800--Sobic006G224400 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic007G110800--Sobic007G081800 Sobic007G110800--Sobic010G123800 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic007G110800--Sobic004G046700 Sobic006G224400--Sobic005G058300 Sobic006G224400--Sobic007G167950 Sobic006G224400--Sobic007G081800 Sobic006G224400--Sobic005G087732 Sobic006G224400--Sobic007G110800 Sobic006G224400--Sobic010G123800 Sobic006G224400--Sobic004G046700 Sobic006G224400--Sobic004G086900 Sobic006G224400--Sobic007G082300
Octagon: transcription factors


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