Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G169000.2
Synonym Sb01g014780
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S617
Pfam -
Panther DB PTHR36316
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G20430 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g11060.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049567
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G293600 OsFBX15 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G086100 - -
3 Sobic.003G333150 - -
4 Sobic.009G043200 BTBN17 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -
5 Sobic.008G045300 citrate-binding protein precursor, putative, expressed -
6 Sobic.009G203600 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@Receptor-like protein kinase HSL1(PubMedID : 31721651)@receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
7 Sobic.006G144900 G-patch domain containing protein, putative, expressed K13103: tuftelin-interacting protein 11
8 Sobic.003G130650 - -
9 Sobic.002G345100 expressed protein -
10 Sobic.003G250340 - K07976: Rab family, other
11 Sobic.008G139200 - -
12 Sobic.005G061300 - -
13 Sobic.003G002800 expressed protein -
14 Sobic.003G118750 - -
15 Sobic.002G334900 S-domain receptor-like protein kinase, putative, expressed -
16 Sobic.007G180800 - -
17 Sobic.004G328800 transferase family protein, putative, expressed -
18 Sobic.004G173900 - -
19 Sobic.003G141400 expressed protein -
20 Sobic.003G243750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G169000 Sobic001G169000 Sobic004G293600 Sobic004G293600 Sobic001G169000--Sobic004G293600 Sobic001G086100 Sobic001G086100 Sobic001G169000--Sobic001G086100 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic001G169000--Sobic003G333150 Sobic009G043200 Sobic009G043200 Sobic001G169000--Sobic009G043200 Sobic008G045300 Sobic008G045300 Sobic001G169000--Sobic008G045300 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic001G169000--Sobic009G203600 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic001G169000--Sobic006G144900 Sobic003G130650 Sobic003G130650 Sobic001G169000--Sobic003G130650 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic001G169000--Sobic002G345100 Sobic004G293600--Sobic001G086100 Sobic004G293600--Sobic002G345100 Sobic004G293600--Sobic006G144900 Sobic003G002800 Sobic003G002800 Sobic004G293600--Sobic003G002800 Sobic004G293600--Sobic008G045300 Sobic010G273200 Sobic010G273200 Sobic004G293600--Sobic010G273200 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic004G293600--Sobic002G103400 Sobic001G152240 Sobic001G152240 Sobic004G293600--Sobic001G152240 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic004G293600--Sobic010G091750 Sobic001G086100--Sobic004G293600 Sobic001G086100--Sobic002G345100 Sobic002G046400 Sobic002G046400 Sobic001G086100--Sobic002G046400 Sobic005G025500 Sobic005G025500 Sobic001G086100--Sobic005G025500 Sobic001G086100--Sobic003G002800 Sobic004G328800 Sobic004G328800 Sobic001G086100--Sobic004G328800 Sobic001G086100--Sobic006G144900 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic001G086100--Sobic009G142600 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic001G086100--Sobic005G014600 Sobic005G061300 Sobic005G061300 Sobic003G333150--Sobic005G061300 Sobic003G333150--Sobic006G144900 Sobic003G333150--Sobic008G045300 Sobic003G333150--Sobic002G345100 Sobic005G114000 Sobic005G114000 Sobic003G333150--Sobic005G114000 Sobic003G333150--Sobic003G002800 Sobic003G333150--Sobic004G293600 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic003G333150--Sobic010G025200 Sobic003G333150--Sobic009G203600 Sobic009G043200--Sobic001G086100 Sobic009G043200--Sobic001G169000 Sobic004G162600 Sobic004G162600 Sobic009G043200--Sobic004G162600 Sobic004G096000 Sobic004G096000 Sobic009G043200--Sobic004G096000 Sobic001G351200 Sobic001G351200 Sobic009G043200--Sobic001G351200 Sobic009G043200--Sobic004G293600 Sobic002G334900 Sobic002G334900 Sobic009G043200--Sobic002G334900 Sobic003G250340 Sobic003G250340 Sobic009G043200--Sobic003G250340 Sobic009G187900 Sobic009G187900 Sobic009G043200--Sobic009G187900 Sobic008G045300--Sobic003G333150 Sobic002G188200 Sobic002G188200 Sobic008G045300--Sobic002G188200 Sobic008G045300--Sobic004G293600 Sobic008G045300--Sobic009G203600 Sobic010G196200 Sobic010G196200 Sobic008G045300--Sobic010G196200 Sobic008G045300--Sobic004G328800 Sobic008G175933 Sobic008G175933 Sobic008G045300--Sobic008G175933 Sobic008G045300--Sobic002G345100 Sobic008G045300--Sobic006G144900 Sobic009G203600--Sobic006G144900 Sobic009G203600--Sobic008G045300 Sobic009G203600--Sobic003G333150 Sobic009G203600--Sobic002G345100 Sobic009G203600--Sobic004G293600 Sobic002G076200 Sobic002G076200 Sobic009G203600--Sobic002G076200 Sobic003G243750 Sobic003G243750 Sobic009G203600--Sobic003G243750 Sobic001G336600 Sobic001G336600 Sobic009G203600--Sobic001G336600 Sobic009G203600--Sobic003G250340 Sobic006G144900--Sobic002G345100 Sobic006G144900--Sobic003G002800 Sobic006G144900--Sobic010G025200 Sobic006G144900--Sobic003G333150 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic006G144900--Sobic002G260500 Sobic006G144900--Sobic009G142600 Sobic009G160900 Sobic009G160900 Sobic006G144900--Sobic009G160900 Sobic006G144900--Sobic005G061300 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic006G144900--Sobic003G210701 Sobic003G130650--Sobic003G250340 Sobic003G130650--Sobic008G045300 Sobic003G130650--Sobic003G243750 Sobic007G165100 Sobic007G165100 Sobic003G130650--Sobic007G165100 Sobic002G152000 Sobic002G152000 Sobic003G130650--Sobic002G152000 Sobic007G114650 Sobic007G114650 Sobic003G130650--Sobic007G114650 Sobic005G038700 Sobic005G038700 Sobic003G130650--Sobic005G038700 Sobic003G130650--Sobic003G333150 Sobic003G130650--Sobic009G203600 Sobic002G345100--Sobic002G046400 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic002G345100--Sobic008G045900 Sobic002G345100--Sobic009G142600 Sobic002G345100--Sobic003G210701 Sobic002G345100--Sobic005G025500 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic002G345100--Sobic002G084100 Sobic002G345100--Sobic005G014600 Sobic001G358101 Sobic001G358101 Sobic002G345100--Sobic001G358101 Sobic004G162800 Sobic004G162800 Sobic002G345100--Sobic004G162800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.