Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G179560.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S690
Pfam -
Panther DB PTHR33059 PTHR33059:SF18
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g41010.1 : DUF581 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G106800 cytochrome P450, putative, expressed -
2 Sobic.008G045600 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.005G061100 - -
4 Sobic.005G043400 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed -
5 Sobic.008G106400 - -
6 Sobic.005G148400 OsFBX404 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.005G043100 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed K12619: XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2
8 Sobic.008G150200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.001G239300 AT hook motif domain containing protein, expressed -
10 Sobic.010G184900 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
11 Sobic.009G101600 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G517200 tRNA nucleotidyltransferase/polyA polymerase family protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G152601 - -
14 Sobic.002G060500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.006G099501 - -
16 Sobic.004G196500 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G210300 - -
18 Sobic.007G129401 - -
19 Sobic.001G355400 40S ribosomal protein S9-2, putative, expressed K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
20 Sobic.007G005000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G179560 Sobic001G179560 Sobic010G106800 Sobic010G106800 Sobic001G179560--Sobic010G106800 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic001G179560--Sobic008G045600 Sobic005G061100 Sobic005G061100 Sobic001G179560--Sobic005G061100 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic001G179560--Sobic005G043400 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic001G179560--Sobic008G106400 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic001G179560--Sobic005G148400 Sobic005G043100 Sobic005G043100 Sobic001G179560--Sobic005G043100 Sobic008G150200 Sobic008G150200 Sobic001G179560--Sobic008G150200 Sobic001G239300 Sobic001G239300 Sobic001G179560--Sobic001G239300 Sobic010G106800--Sobic005G043400 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic010G106800--Sobic009G101600 Sobic010G068200 Sobic010G068200 Sobic010G106800--Sobic010G068200 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic010G106800--Sobic001G271000 Sobic005G043800 Sobic005G043800 Sobic010G106800--Sobic005G043800 Sobic010G106800--Sobic005G148400 Sobic010G106800--Sobic008G045600 Sobic005G210300 Sobic005G210300 Sobic010G106800--Sobic005G210300 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic010G106800--Sobic004G196500 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic008G045600--Sobic007G005000 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic008G045600--Sobic005G142200 Sobic008G045600--Sobic005G061100 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic008G045600--Sobic003G436900 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic008G045600--Sobic004G121000 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic008G045600--Sobic010G144000 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic008G045600--Sobic004G317600 Sobic008G045600--Sobic009G101600 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic008G045600--Sobic001G305400 Sobic005G061100--Sobic003G436900 Sobic005G061100--Sobic009G101600 Sobic005G061100--Sobic005G142200 Sobic005G061100--Sobic001G305400 Sobic005G061100--Sobic004G121000 Sobic005G061100--Sobic008G045600 Sobic005G061100--Sobic004G317600 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic005G061100--Sobic001G240400 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic005G061100--Sobic002G060500 Sobic005G043400--Sobic002G060500 Sobic005G043400--Sobic009G101600 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G043400--Sobic009G026400 Sobic005G043400--Sobic004G196500 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic005G043400--Sobic007G129401 SobicK010000 SobicK010000 Sobic005G043400--SobicK010000 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic005G043400--Sobic005G085100 Sobic005G043400--Sobic005G142200 Sobic003G201850 Sobic003G201850 Sobic005G043400--Sobic003G201850 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic008G106400--Sobic008G065400 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic008G106400--Sobic005G079700 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic008G106400--Sobic002G431200 Sobic001G355400 Sobic001G355400 Sobic008G106400--Sobic001G355400 Sobic008G106400--Sobic008G045600 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic008G106400--Sobic002G059800 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic008G106400--Sobic004G152601 Sobic008G106400--Sobic007G005000 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic008G106400--Sobic005G221550 Sobic005G148400--Sobic005G085100 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic005G148400--Sobic005G148500 Sobic005G148400--Sobic005G043400 Sobic005G148400--Sobic005G221550 Sobic005G148400--Sobic002G060500 Sobic005G148400--Sobic009G101600 Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic005G148400--Sobic005G170800 Sobic005G148400--Sobic005G142200 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic005G148400--Sobic002G128400 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic005G043100--Sobic002G171400 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic005G043100--Sobic003G429500 Sobic005G043100--Sobic008G065400 Sobic005G043100--Sobic002G431200 Sobic005G043100--Sobic008G106400 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic005G043100--Sobic003G366850 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic005G043100--Sobic009G121750 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic005G043100--Sobic001G278600 Sobic005G043100--Sobic008G045600 Sobic008G150200--Sobic001G305400 Sobic008G150200--Sobic002G060500 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic008G150200--Sobic002G221200 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic008G150200--Sobic001G261480 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic008G150200--Sobic004G200866 Sobic008G150200--Sobic001G240400 Sobic008G150200--Sobic005G142200 Sobic008G150200--Sobic004G121000 Sobic008G150200--Sobic009G101600 Sobic001G239300--Sobic008G106400 Sobic006G057733 Sobic006G057733 Sobic001G239300--Sobic006G057733 Sobic001G239300--Sobic004G152601 Sobic006G190800 Sobic006G190800 Sobic001G239300--Sobic006G190800 Sobic001G239300--Sobic008G065400 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic001G239300--Sobic003G374500 Sobic001G239300--Sobic003G366850 Sobic002G114400 Sobic002G114400 Sobic001G239300--Sobic002G114400 Sobic007G037301 Sobic007G037301 Sobic001G239300--Sobic007G037301
Octagon: transcription factors


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