Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G262100.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt C6JSP2 , C6JRL4 , C6JS35 , A0A1B6QL73
Pfam -
Panther DB PTHR33063
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g27610.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G262200 expressed protein -
2 Sobic.001G253800 - -
3 Sobic.003G385401 - -
4 Sobic.002G073700 cycloartenol-C-24-methyltransferase 1, putative, expressed K00559: SMT1, sterol 24-C-methyltransferase
5 Sobic.008G121240 - -
6 Sobic.001G091100 - -
7 Sobic.010G142700 - -
8 Sobic.001G262800 - -
9 Sobic.005G163866 - -
10 Sobic.006G057600 - -
11 Sobic.001G290832 - -
12 Sobic.003G439900 40S ribosomal protein S15, putative, expressed -
13 Sobic.004G096801 - -
14 Sobic.003G164600 - -
15 Sobic.006G275700 expressed protein -
16 Sobic.004G324300 expressed protein -
17 Sobic.007G188800 "Candidate orthologue to the wheat Pm40 gene, Disease resistance RGA1"(PubMedID : 27755575)@CC-NBS-LRR, putative, expressed -
18 Sobic.005G065200 - -
19 Sobic.001G309800 - -
20 Sobic.003G351401 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G262100 Sobic001G262100 Sobic001G262200 Sobic001G262200 Sobic001G262100--Sobic001G262200 Sobic001G253800 Sobic001G253800 Sobic001G262100--Sobic001G253800 Sobic003G385401 Sobic003G385401 Sobic001G262100--Sobic003G385401 Sobic002G073700 Sobic002G073700 Sobic001G262100--Sobic002G073700 Sobic008G121240 Sobic008G121240 Sobic001G262100--Sobic008G121240 Sobic001G091100 Sobic001G091100 Sobic001G262100--Sobic001G091100 Sobic010G142700 Sobic010G142700 Sobic001G262100--Sobic010G142700 Sobic001G262800 Sobic001G262800 Sobic001G262100--Sobic001G262800 Sobic005G163866 Sobic005G163866 Sobic001G262100--Sobic005G163866 Sobic001G262200--Sobic001G262100 Sobic003G439900 Sobic003G439900 Sobic001G262200--Sobic003G439900 Sobic001G262200--Sobic001G262800 Sobic001G262200--Sobic008G121240 Sobic005G065200 Sobic005G065200 Sobic001G262200--Sobic005G065200 Sobic003G351401 Sobic003G351401 Sobic001G262200--Sobic003G351401 Sobic001G262200--Sobic001G091100 Sobic001G262200--Sobic001G253800 Sobic001G260300 Sobic001G260300 Sobic001G262200--Sobic001G260300 Sobic001G165000 Sobic001G165000 Sobic001G253800--Sobic001G165000 Sobic001G253800--Sobic001G262100 Sobic010G243700 Sobic010G243700 Sobic001G253800--Sobic010G243700 Sobic001G253800--Sobic001G262200 Sobic010G243600 Sobic010G243600 Sobic001G253800--Sobic010G243600 Sobic004G032100 Sobic004G032100 Sobic001G253800--Sobic004G032100 Sobic008G139000 Sobic008G139000 Sobic001G253800--Sobic008G139000 Sobic004G096801 Sobic004G096801 Sobic001G253800--Sobic004G096801 Sobic006G200800 Sobic006G200800 Sobic001G253800--Sobic006G200800 Sobic005G189300 Sobic005G189300 Sobic003G385401--Sobic005G189300 Sobic007G188800 Sobic007G188800 Sobic003G385401--Sobic007G188800 Sobic007G163001 Sobic007G163001 Sobic003G385401--Sobic007G163001 Sobic003G385401--Sobic010G142700 Sobic003G164600 Sobic003G164600 Sobic003G385401--Sobic003G164600 Sobic005G145550 Sobic005G145550 Sobic003G385401--Sobic005G145550 Sobic003G385401--Sobic001G262100 Sobic003G385401--Sobic003G351401 Sobic004G324700 Sobic004G324700 Sobic003G385401--Sobic004G324700 Sobic008G190100 Sobic008G190100 Sobic002G073700--Sobic008G190100 Sobic002G231500 Sobic002G231500 Sobic002G073700--Sobic002G231500 Sobic006G147600 Sobic006G147600 Sobic002G073700--Sobic006G147600 Sobic006G213400 Sobic006G213400 Sobic002G073700--Sobic006G213400 Sobic009G176700 Sobic009G176700 Sobic002G073700--Sobic009G176700 Sobic001G447300 Sobic001G447300 Sobic002G073700--Sobic001G447300 Sobic003G039000 Sobic003G039000 Sobic002G073700--Sobic003G039000 Sobic006G237000 Sobic006G237000 Sobic002G073700--Sobic006G237000 Sobic003G388000 Sobic003G388000 Sobic002G073700--Sobic003G388000 Sobic008G121240--Sobic001G262800 Sobic008G121240--Sobic001G262200 Sobic002G069500 Sobic002G069500 Sobic008G121240--Sobic002G069500 Sobic008G121240--Sobic005G065200 Sobic008G121240--Sobic003G439900 Sobic002G035300 Sobic002G035300 Sobic008G121240--Sobic002G035300 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic008G121240--Sobic001G318100 Sobic002G101100 Sobic002G101100 Sobic008G121240--Sobic002G101100 Sobic002G056400 Sobic002G056400 Sobic008G121240--Sobic002G056400 Sobic003G251100 Sobic003G251100 Sobic001G091100--Sobic003G251100 Sobic001G475200 Sobic001G475200 Sobic001G091100--Sobic001G475200 Sobic001G091100--Sobic007G188800 Sobic006G057600 Sobic006G057600 Sobic001G091100--Sobic006G057600 Sobic001G091100--Sobic003G351401 Sobic006G275700 Sobic006G275700 Sobic001G091100--Sobic006G275700 Sobic005G104300 Sobic005G104300 Sobic001G091100--Sobic005G104300 Sobic008G061201 Sobic008G061201 Sobic001G091100--Sobic008G061201 Sobic001G475100 Sobic001G475100 Sobic001G091100--Sobic001G475100 Sobic001G431400 Sobic001G431400 Sobic010G142700--Sobic001G431400 Sobic002G047000 Sobic002G047000 Sobic010G142700--Sobic002G047000 Sobic010G142700--Sobic002G231500 Sobic002G389900 Sobic002G389900 Sobic010G142700--Sobic002G389900 Sobic010G142700--Sobic005G189300 Sobic009G016400 Sobic009G016400 Sobic010G142700--Sobic009G016400 Sobic002G112100 Sobic002G112100 Sobic010G142700--Sobic002G112100 Sobic010G142700--Sobic006G057600 Sobic007G197450 Sobic007G197450 Sobic010G142700--Sobic007G197450 Sobic001G262800--Sobic001G260300 Sobic001G262800--Sobic008G121240 Sobic001G262800--Sobic001G262200 Sobic001G262800--Sobic003G439900 Sobic001G262800--Sobic002G069500 Sobic001G262800--Sobic002G035300 Sobic001G312400 Sobic001G312400 Sobic001G262800--Sobic001G312400 Sobic001G273000 Sobic001G273000 Sobic001G262800--Sobic001G273000 Sobic005G128800 Sobic005G128800 Sobic001G262800--Sobic005G128800 Sobic005G184050 Sobic005G184050 Sobic005G163866--Sobic005G184050 Sobic005G163866--Sobic005G145550 Sobic005G163866--Sobic004G096801 Sobic010G214500 Sobic010G214500 Sobic005G163866--Sobic010G214500 Sobic006G165600 Sobic006G165600 Sobic005G163866--Sobic006G165600 Sobic005G163866--Sobic003G351401 Sobic005G163866--Sobic003G164600 Sobic005G163866--Sobic007G188800 Sobic005G159801 Sobic005G159801 Sobic005G163866--Sobic005G159801
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.