Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G265500.3,Sobic.001G265500.2,Sobic.001G265500.1
Synonym Sb01g025910
Functional annotation amidase, putative, expressed
UniProt A0A1B6QL89 , A0A1B6QL99 , A0A1Z5S7R4
Pfam PF01425
Panther DB PTHR11895:SF85 PTHR11895 PTHR11895 PTHR11895:SF85
NCBI CDD KOG1211; Amidases
KEGG Orthology K01426; E3.5.1.4, amidase
Gene Ontology GO:0016884; carbon-nitrogen ligase activity, with glutamine as amido-N-donor


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G34880 : Amidase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g06710.1 : amidase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ96087
Barley HORVU1Hr1G091420.15 , HORVU1Hr1G091420.14 , HORVU1Hr1G091420.13 , HORVU1Hr1G091420.12 , HORVU1Hr1G091420.11 , HORVU1Hr1G091420.10 , HORVU1Hr1G091420.9 , HORVU1Hr1G091420.8 , HORVU1Hr1G091420.7 , HORVU1Hr1G091420.6 , HORVU1Hr1G091420.5 , HORVU1Hr1G091420.4 , HORVU1Hr1G091420.3 , HORVU1Hr1G091420.2 , HORVU1Hr1G091420.1 , HORVU1Hr1G091390.1
Wheat TraesCS1B02G448000 , TraesCS1A02G417900 , TraesCS1D02G425500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G265500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic001G265500 Sobic001G265500 Sobic003G145200 Sobic003G145200 Sobic001G265500--Sobic003G145200 Sobic004G202900 Sobic004G202900 Sobic001G265500--Sobic004G202900 Sobic008G041100 Sobic008G041100 Sobic001G265500--Sobic008G041100 Sobic007G056300 Sobic007G056300 Sobic001G265500--Sobic007G056300 Sobic003G119200 Sobic003G119200 Sobic001G265500--Sobic003G119200 Sobic001G355700 Sobic001G355700 Sobic001G265500--Sobic001G355700 Sobic003G445750 Sobic003G445750 Sobic001G265500--Sobic003G445750 Sobic001G394000 Sobic001G394000 Sobic001G265500--Sobic001G394000 Sobic001G521800 Sobic001G521800 Sobic001G265500--Sobic001G521800 Sobic001G536300 Sobic001G536300 Sobic003G145200--Sobic001G536300 Sobic001G354900 Sobic001G354900 Sobic003G145200--Sobic001G354900 Sobic010G275600 Sobic010G275600 Sobic003G145200--Sobic010G275600 Sobic002G268200 Sobic002G268200 Sobic003G145200--Sobic002G268200 Sobic010G078800 Sobic010G078800 Sobic003G145200--Sobic010G078800 Sobic003G350000 Sobic003G350000 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Octagon: transcription factors


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