Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G292100.9,Sobic.001G292100.1,Sobic.001G292100.5,Sobic.001G292100.2,Sobic.001G292100.6,Sobic.001G292100.4,Sobic.001G292100.7,Sobic.001G292100.8,Sobic.001G292100.3
Synonym Sb01g028550
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S8Q9 , A0A1Z5S867 , A0A1B6QLW0
Pfam PF08458 PF05703
Panther DB PTHR31351 PTHR31351:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G17350 : Plant protein of unknown function (DUF828) with plant pleckstrin homology-like region
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g41870.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a003440
Brachypodium KQJ97873 , PNT67935 , PNT67934 , PNT67937 , PNT67936
Barley HORVU1Hr1G054520.1 , HORVU1Hr1G054520.3 , HORVU1Hr1G054520.2 , HORVU1Hr1G054520.5 , HORVU1Hr1G054520.4 , HORVU1Hr1G054520.7
Wheat TraesCS1D02G216500 , TraesCS1A02G213700 , TraesCS1B02G227300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G119200 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G324800 expressed protein -
3 Sobic.005G057401 - -
4 Sobic.010G130400 SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed K08241: jasmonate O-methyltransferase
5 Sobic.003G315166 - K13024: PPIP5K, inositol-hexakisphosphate/diphosphoinositol-pentakisphosphate 1-kinase
6 Sobic.002G071201 - -
7 Sobic.001G137900 cytochrome P450, putative, expressed -
8 Sobic.006G004900 erythronate-4-phosphate dehydrogenase domain containing protein, expressed K15919: glyoxylate/hydroxypyruvate reductase
9 Sobic.007G055900 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
10 Sobic.002G215866 - -
11 Sobic.001G339000 terpene synthase, N-terminal domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G063566 - -
13 Sobic.005G048400 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
14 Sobic.002G091700 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein
15 Sobic.002G281100 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.008G028900 cytokinesis negative regulator RCP1, putative, expressed -
17 Sobic.008G123700 expressed protein -
18 Sobic.004G358800 protein kinase, putative, expressed -
19 Sobic.005G049100 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
20 Sobic.005G192350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G292100 Sobic001G292100 Sobic003G119200 Sobic003G119200 Sobic001G292100--Sobic003G119200 Sobic003G324800 Sobic003G324800 Sobic001G292100--Sobic003G324800 Sobic005G057401 Sobic005G057401 Sobic001G292100--Sobic005G057401 Sobic010G130400 Sobic010G130400 Sobic001G292100--Sobic010G130400 Sobic003G315166 Sobic003G315166 Sobic001G292100--Sobic003G315166 Sobic002G071201 Sobic002G071201 Sobic001G292100--Sobic002G071201 Sobic001G137900 Sobic001G137900 Sobic001G292100--Sobic001G137900 Sobic006G004900 Sobic006G004900 Sobic001G292100--Sobic006G004900 Sobic007G055900 Sobic007G055900 Sobic001G292100--Sobic007G055900 Sobic006G232100 Sobic006G232100 Sobic003G119200--Sobic006G232100 Sobic003G142800 Sobic003G142800 Sobic003G119200--Sobic003G142800 Sobic004G270100 Sobic004G270100 Sobic003G119200--Sobic004G270100 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic003G119200--Sobic010G132400 Sobic003G105200 Sobic003G105200 Sobic003G119200--Sobic003G105200 Sobic006G212200 Sobic006G212200 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Octagon: transcription factors


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