Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G324800.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W022
Pfam -
Panther DB PTHR33672 PTHR33672:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G20190 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g31660.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027208
Brachypodium KQK10106
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G123300 rhamnogalacturonate lyase, putative, expressed K18195: RGL4, rhamnogalacturonan endolyase
2 Sobic.005G104850 - -
3 Sobic.004G291300 expressed protein -
4 Sobic.001G502801 - -
5 Sobic.005G020501 - -
6 Sobic.002G312550 - -
7 Sobic.009G170050 - -
8 Sobic.010G214150 - -
9 Sobic.009G143750 - -
10 Sobic.006G243300 expressed protein -
11 Sobic.003G096750 - -
12 Sobic.006G174050 - K12662: PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP4
13 Sobic.008G040501 - -
14 Sobic.002G413100 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G300301 - -
16 Sobic.009G158150 - -
17 Sobic.002G178900 SNARE domain containing protein, putative, expressed K08506: syntaxin of plants SYP7
18 Sobic.001G163500 - -
19 Sobic.004G252300 CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G045250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G324800 Sobic003G324800 Sobic005G123300 Sobic005G123300 Sobic003G324800--Sobic005G123300 Sobic005G104850 Sobic005G104850 Sobic003G324800--Sobic005G104850 Sobic004G291300 Sobic004G291300 Sobic003G324800--Sobic004G291300 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic003G324800--Sobic001G502801 Sobic005G020501 Sobic005G020501 Sobic003G324800--Sobic005G020501 Sobic002G312550 Sobic002G312550 Sobic003G324800--Sobic002G312550 Sobic009G170050 Sobic009G170050 Sobic003G324800--Sobic009G170050 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic003G324800--Sobic010G214150 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic003G324800--Sobic009G143750 Sobic005G123300--Sobic002G312550 Sobic004G252300 Sobic004G252300 Sobic005G123300--Sobic004G252300 Sobic005G123300--Sobic010G214150 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic005G123300--Sobic009G158150 Sobic003G013300 Sobic003G013300 Sobic005G123300--Sobic003G013300 Sobic002G178900 Sobic002G178900 Sobic005G123300--Sobic002G178900 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic005G123300--Sobic001G163500 Sobic004G249950 Sobic004G249950 Sobic005G123300--Sobic004G249950 Sobic001G516400 Sobic001G516400 Sobic005G123300--Sobic001G516400 Sobic005G104850--Sobic003G013300 Sobic005G104850--Sobic005G123300 Sobic005G104850--Sobic002G312550 Sobic005G104850--Sobic010G214150 Sobic003G096750 Sobic003G096750 Sobic005G104850--Sobic003G096750 Sobic003G116200 Sobic003G116200 Sobic005G104850--Sobic003G116200 Sobic006G243300 Sobic006G243300 Sobic005G104850--Sobic006G243300 Sobic005G104850--Sobic001G502801 Sobic005G104850--Sobic004G252300 Sobic001G137900 Sobic001G137900 Sobic004G291300--Sobic001G137900 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic004G291300--Sobic003G163000 Sobic002G033550 Sobic002G033550 Sobic004G291300--Sobic002G033550 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic004G291300--Sobic005G045250 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic004G291300--Sobic002G214000 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic004G291300--Sobic005G019250 Sobic005G152866 Sobic005G152866 Sobic004G291300--Sobic005G152866 Sobic001G422432 Sobic001G422432 Sobic004G291300--Sobic001G422432 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic004G291300--Sobic001G202450 Sobic001G300301 Sobic001G300301 Sobic001G502801--Sobic001G300301 Sobic001G502801--Sobic009G143750 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic001G502801--Sobic008G040501 Sobic001G502801--Sobic005G045250 Sobic006G016950 Sobic006G016950 Sobic001G502801--Sobic006G016950 Sobic007G183200 Sobic007G183200 Sobic001G502801--Sobic007G183200 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic001G502801--Sobic003G161900 Sobic001G502801--Sobic010G214150 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic001G502801--Sobic002G358450 Sobic005G020501--Sobic001G502801 Sobic005G020501--Sobic005G045250 Sobic005G020501--Sobic005G123300 Sobic005G020501--Sobic001G137900 Sobic005G020501--Sobic010G214150 Sobic005G020501--Sobic009G170050 Sobic005G020501--Sobic001G300301 Sobic006G174050 Sobic006G174050 Sobic005G020501--Sobic006G174050 Sobic005G020501--Sobic002G178900 Sobic002G312550--Sobic010G214150 Sobic002G312550--Sobic005G123300 Sobic002G312550--Sobic001G163500 Sobic002G312550--Sobic003G096750 Sobic002G312550--Sobic004G252300 Sobic002G312550--Sobic009G158150 Sobic009G148400 Sobic009G148400 Sobic002G312550--Sobic009G148400 Sobic002G312550--Sobic003G013300 Sobic001G314350 Sobic001G314350 Sobic002G312550--Sobic001G314350 Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic009G170050--Sobic005G168900 Sobic009G170050--Sobic006G174050 Sobic009G170050--Sobic002G178900 Sobic009G170050--Sobic009G158150 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic009G170050--Sobic003G129700 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic009G170050--Sobic006G097600 Sobic007G226900 Sobic007G226900 Sobic009G170050--Sobic007G226900 Sobic009G170050--Sobic001G516400 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic009G170050--Sobic002G062400 Sobic010G214150--Sobic008G040501 Sobic010G214150--Sobic002G312550 Sobic010G214150--Sobic001G300301 Sobic010G214150--Sobic001G502801 Sobic010G214150--Sobic004G252300 Sobic010G214150--Sobic005G045250 Sobic010G214150--Sobic005G123300 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic010G214150--Sobic009G077000 Sobic010G214150--Sobic003G096750 Sobic001G487900 Sobic001G487900 Sobic009G143750--Sobic001G487900 Sobic009G143750--Sobic001G502801 Sobic009G143750--Sobic007G183200 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic009G143750--Sobic003G172600 Sobic009G143750--Sobic002G358450 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic009G143750--Sobic006G124800 Sobic007G207100 Sobic007G207100 Sobic009G143750--Sobic007G207100 Sobic009G143750--Sobic006G016950 Sobic007G126150 Sobic007G126150 Sobic009G143750--Sobic007G126150
Octagon: transcription factors


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