Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G104850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RHQ5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G013300 expressed protein -
2 Sobic.005G123300 rhamnogalacturonate lyase, putative, expressed K18195: RGL4, rhamnogalacturonan endolyase
3 Sobic.002G312550 - -
4 Sobic.010G214150 - -
5 Sobic.003G096750 - -
6 Sobic.003G116200 expressed protein -
7 Sobic.006G243300 expressed protein -
8 Sobic.001G502801 - -
9 Sobic.004G252300 CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
10 Sobic.005G045250 - -
11 Sobic.008G040501 - -
12 Sobic.001G300301 - -
13 Sobic.002G312500 - -
14 Sobic.001G314350 - -
15 Sobic.001G308350 - -
16 Sobic.003G324800 expressed protein -
17 Sobic.005G020501 - -
18 Sobic.009G158150 - -
19 Sobic.004G032200 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K02201: pantetheine-phosphate adenylyltransferase
20 Sobic.006G174050 - K12662: PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP4


Gene co-expression network
sample Sobic005G104850 Sobic005G104850 Sobic003G013300 Sobic003G013300 Sobic005G104850--Sobic003G013300 Sobic005G123300 Sobic005G123300 Sobic005G104850--Sobic005G123300 Sobic002G312550 Sobic002G312550 Sobic005G104850--Sobic002G312550 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic005G104850--Sobic010G214150 Sobic003G096750 Sobic003G096750 Sobic005G104850--Sobic003G096750 Sobic003G116200 Sobic003G116200 Sobic005G104850--Sobic003G116200 Sobic006G243300 Sobic006G243300 Sobic005G104850--Sobic006G243300 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic005G104850--Sobic001G502801 Sobic004G252300 Sobic004G252300 Sobic005G104850--Sobic004G252300 Sobic005G192350 Sobic005G192350 Sobic003G013300--Sobic005G192350 Sobic003G013300--Sobic004G252300 Sobic003G013300--Sobic002G312550 Sobic009G077901 Sobic009G077901 Sobic003G013300--Sobic009G077901 Sobic003G013300--Sobic005G123300 Sobic003G013300--Sobic003G116200 Sobic003G013300--Sobic010G214150 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic003G013300--Sobic002G199300 Sobic010G246800 Sobic010G246800 Sobic003G013300--Sobic010G246800 Sobic005G123300--Sobic002G312550 Sobic005G123300--Sobic004G252300 Sobic005G123300--Sobic010G214150 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic005G123300--Sobic009G158150 Sobic005G123300--Sobic003G013300 Sobic002G178900 Sobic002G178900 Sobic005G123300--Sobic002G178900 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic005G123300--Sobic001G163500 Sobic004G249950 Sobic004G249950 Sobic005G123300--Sobic004G249950 Sobic001G516400 Sobic001G516400 Sobic005G123300--Sobic001G516400 Sobic002G312550--Sobic010G214150 Sobic002G312550--Sobic005G123300 Sobic002G312550--Sobic001G163500 Sobic002G312550--Sobic003G096750 Sobic002G312550--Sobic004G252300 Sobic002G312550--Sobic009G158150 Sobic009G148400 Sobic009G148400 Sobic002G312550--Sobic009G148400 Sobic002G312550--Sobic003G013300 Sobic001G314350 Sobic001G314350 Sobic002G312550--Sobic001G314350 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic010G214150--Sobic008G040501 Sobic010G214150--Sobic002G312550 Sobic001G300301 Sobic001G300301 Sobic010G214150--Sobic001G300301 Sobic010G214150--Sobic001G502801 Sobic010G214150--Sobic004G252300 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic010G214150--Sobic005G045250 Sobic010G214150--Sobic005G123300 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic010G214150--Sobic009G077000 Sobic010G214150--Sobic003G096750 Sobic003G096750--Sobic002G312550 Sobic003G096750--Sobic010G214150 Sobic004G103450 Sobic004G103450 Sobic003G096750--Sobic004G103450 Sobic001G291701 Sobic001G291701 Sobic003G096750--Sobic001G291701 Sobic003G096750--Sobic008G040501 Sobic008G040201 Sobic008G040201 Sobic003G096750--Sobic008G040201 Sobic003G096750--Sobic001G502801 Sobic004G073232 Sobic004G073232 Sobic003G096750--Sobic004G073232 Sobic003G096750--Sobic001G314350 Sobic003G116200--Sobic001G314350 Sobic003G116200--Sobic010G246800 Sobic010G120900 Sobic010G120900 Sobic003G116200--Sobic010G120900 Sobic003G116200--Sobic010G214150 Sobic003G116200--Sobic002G312550 Sobic003G116200--Sobic003G013300 Sobic001G308350 Sobic001G308350 Sobic003G116200--Sobic001G308350 Sobic005G122000 Sobic005G122000 Sobic003G116200--Sobic005G122000 Sobic003G116200--Sobic006G243300 Sobic010G207175 Sobic010G207175 Sobic006G243300--Sobic010G207175 Sobic006G210266 Sobic006G210266 Sobic006G243300--Sobic006G210266 Sobic006G243300--Sobic001G163500 Sobic006G243300--Sobic001G314350 Sobic006G243300--Sobic003G116200 Sobic009G258800 Sobic009G258800 Sobic006G243300--Sobic009G258800 Sobic006G243300--Sobic002G312550 Sobic006G243300--Sobic005G192350 Sobic006G243300--Sobic003G013300 Sobic001G502801--Sobic001G300301 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic001G502801--Sobic009G143750 Sobic001G502801--Sobic008G040501 Sobic001G502801--Sobic005G045250 Sobic006G016950 Sobic006G016950 Sobic001G502801--Sobic006G016950 Sobic007G183200 Sobic007G183200 Sobic001G502801--Sobic007G183200 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic001G502801--Sobic003G161900 Sobic001G502801--Sobic010G214150 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic001G502801--Sobic002G358450 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic004G252300--Sobic001G497400 Sobic004G252300--Sobic009G077000 Sobic006G053550 Sobic006G053550 Sobic004G252300--Sobic006G053550 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic004G252300--Sobic002G214000 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic004G252300--Sobic004G310350 Sobic009G215100 Sobic009G215100 Sobic004G252300--Sobic009G215100 SobicK031900 SobicK031900 Sobic004G252300--SobicK031900 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic004G252300--Sobic007G042700 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic004G252300--Sobic010G219200
Octagon: transcription factors


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