Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G020501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RGY4
Pfam PF04570
Panther DB PTHR33059 PTHR33059:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G39795 : Protein of unknown function (DUF581)
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g51550.1 : DUF581 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G502801 - -
2 Sobic.005G045250 - -
3 Sobic.005G123300 rhamnogalacturonate lyase, putative, expressed K18195: RGL4, rhamnogalacturonan endolyase
4 Sobic.001G137900 cytochrome P450, putative, expressed -
5 Sobic.010G214150 - -
6 Sobic.009G170050 - -
7 Sobic.001G300301 - -
8 Sobic.006G174050 - K12662: PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP4
9 Sobic.002G178900 SNARE domain containing protein, putative, expressed K08506: syntaxin of plants SYP7
10 Sobic.004G252300 CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
11 Sobic.010G268500 laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
12 Sobic.002G033550 - -
13 Sobic.002G312550 - -
14 Sobic.003G013300 expressed protein -
15 Sobic.009G106601 - -
16 Sobic.002G121201 - -
17 Sobic.008G040501 - -
18 Sobic.005G104850 - -
19 Sobic.001G497400 - -
20 Sobic.009G077000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G020501 Sobic005G020501 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic005G020501--Sobic001G502801 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic005G020501--Sobic005G045250 Sobic005G123300 Sobic005G123300 Sobic005G020501--Sobic005G123300 Sobic001G137900 Sobic001G137900 Sobic005G020501--Sobic001G137900 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic005G020501--Sobic010G214150 Sobic009G170050 Sobic009G170050 Sobic005G020501--Sobic009G170050 Sobic001G300301 Sobic001G300301 Sobic005G020501--Sobic001G300301 Sobic006G174050 Sobic006G174050 Sobic005G020501--Sobic006G174050 Sobic002G178900 Sobic002G178900 Sobic005G020501--Sobic002G178900 Sobic001G502801--Sobic001G300301 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic001G502801--Sobic009G143750 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic001G502801--Sobic008G040501 Sobic001G502801--Sobic005G045250 Sobic006G016950 Sobic006G016950 Sobic001G502801--Sobic006G016950 Sobic007G183200 Sobic007G183200 Sobic001G502801--Sobic007G183200 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic001G502801--Sobic003G161900 Sobic001G502801--Sobic010G214150 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic001G502801--Sobic002G358450 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic005G045250--Sobic001G202450 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic005G045250--Sobic009G077000 Sobic003G030450 Sobic003G030450 Sobic005G045250--Sobic003G030450 Sobic005G045250--Sobic001G300301 Sobic005G045250--Sobic001G502801 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic005G045250--Sobic002G214000 Sobic005G045250--Sobic003G161900 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic005G045250--Sobic002G401533 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic005G045250--Sobic005G019250 Sobic002G312550 Sobic002G312550 Sobic005G123300--Sobic002G312550 Sobic004G252300 Sobic004G252300 Sobic005G123300--Sobic004G252300 Sobic005G123300--Sobic010G214150 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic005G123300--Sobic009G158150 Sobic003G013300 Sobic003G013300 Sobic005G123300--Sobic003G013300 Sobic005G123300--Sobic002G178900 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic005G123300--Sobic001G163500 Sobic004G249950 Sobic004G249950 Sobic005G123300--Sobic004G249950 Sobic001G516400 Sobic001G516400 Sobic005G123300--Sobic001G516400 Sobic002G033550 Sobic002G033550 Sobic001G137900--Sobic002G033550 Sobic004G199100 Sobic004G199100 Sobic001G137900--Sobic004G199100 Sobic008G123700 Sobic008G123700 Sobic001G137900--Sobic008G123700 Sobic002G109700 Sobic002G109700 Sobic001G137900--Sobic002G109700 Sobic004G291300 Sobic004G291300 Sobic001G137900--Sobic004G291300 Sobic002G121201 Sobic002G121201 Sobic001G137900--Sobic002G121201 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic001G137900--Sobic002G199300 Sobic009G106601 Sobic009G106601 Sobic001G137900--Sobic009G106601 Sobic003G143600 Sobic003G143600 Sobic001G137900--Sobic003G143600 Sobic010G214150--Sobic008G040501 Sobic010G214150--Sobic002G312550 Sobic010G214150--Sobic001G300301 Sobic010G214150--Sobic001G502801 Sobic010G214150--Sobic004G252300 Sobic010G214150--Sobic005G045250 Sobic010G214150--Sobic005G123300 Sobic010G214150--Sobic009G077000 Sobic003G096750 Sobic003G096750 Sobic010G214150--Sobic003G096750 Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic009G170050--Sobic005G168900 Sobic009G170050--Sobic006G174050 Sobic009G170050--Sobic002G178900 Sobic009G170050--Sobic009G158150 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic009G170050--Sobic003G129700 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic009G170050--Sobic006G097600 Sobic007G226900 Sobic007G226900 Sobic009G170050--Sobic007G226900 Sobic009G170050--Sobic001G516400 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic009G170050--Sobic002G062400 Sobic001G300301--Sobic001G502801 Sobic001G300301--Sobic005G045250 Sobic001G300301--Sobic010G214150 Sobic001G300301--Sobic008G040501 Sobic003G233266 Sobic003G233266 Sobic001G300301--Sobic003G233266 Sobic001G300301--Sobic009G077000 Sobic001G300301--Sobic006G016950 Sobic001G300301--Sobic003G161900 Sobic001G300301--Sobic002G401533 Sobic006G174050--Sobic009G170050 Sobic003G205000 Sobic003G205000 Sobic006G174050--Sobic003G205000 Sobic006G174050--Sobic009G158150 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic006G174050--Sobic010G266400 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic006G174050--Sobic010G166201 Sobic006G174050--Sobic005G168900 Sobic006G174050--Sobic001G516400 Sobic006G174050--Sobic002G199300 Sobic006G174050--Sobic002G178900 Sobic002G178900--Sobic009G170050 Sobic002G178900--Sobic001G516400 Sobic002G178900--Sobic005G168900 Sobic002G178900--Sobic007G226900 Sobic001G471050 Sobic001G471050 Sobic002G178900--Sobic001G471050 Sobic002G178900--Sobic003G129700 Sobic002G178900--Sobic009G158150 Sobic002G178900--Sobic006G097600 Sobic009G145200 Sobic009G145200 Sobic002G178900--Sobic009G145200
Octagon: transcription factors


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