Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G307500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QM26
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G192800 - -
2 Sobic.001G106800 DUF221 domain containing protein, expressed -
3 Sobic.005G076800 OsFBX412 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.009G229400 60S acidic ribosomal protein P0, putative, expressed K02941: RP-LP0, large subunit ribosomal protein LP0
5 Sobic.001G194800 TATA-binding protein, putative, expressed K03120: TBP, transcription initiation factor TFIID TATA-box-binding protein
6 Sobic.001G156800 metal cation transporter, putative, expressed K14709: SLC39A1_2_3, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1/2/3
7 Sobic.001G253750 - -
8 Sobic.008G030501 - -
9 Sobic.007G081800 MBTB22 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
10 Sobic.004G046700 OsFBLD3 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
11 Sobic.006G224400 ubiquitin family protein, putative, expressed K08770: ubiquitin C
K12158: ubiquitin-like protein Nedd8
K04551: ubiquitin B
12 Sobic.004G100300 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.001G211700 MBTB33 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
14 Sobic.010G123800 expressed protein -
15 Sobic.006G017900 DEFL55 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
16 Sobic.002G182701 - -
17 Sobic.005G058300 expressed protein -
18 Sobic.002G384900 expressed protein -
19 Sobic.005G156300 - -
20 Sobic.006G017700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G307500 Sobic001G307500 Sobic002G192800 Sobic002G192800 Sobic001G307500--Sobic002G192800 Sobic001G106800 Sobic001G106800 Sobic001G307500--Sobic001G106800 Sobic005G076800 Sobic005G076800 Sobic001G307500--Sobic005G076800 Sobic009G229400 Sobic009G229400 Sobic001G307500--Sobic009G229400 Sobic001G194800 Sobic001G194800 Sobic001G307500--Sobic001G194800 Sobic001G156800 Sobic001G156800 Sobic001G307500--Sobic001G156800 Sobic001G253750 Sobic001G253750 Sobic001G307500--Sobic001G253750 Sobic008G030501 Sobic008G030501 Sobic001G307500--Sobic008G030501 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic001G307500--Sobic007G081800 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic002G192800--Sobic002G384900 Sobic006G017900 Sobic006G017900 Sobic002G192800--Sobic006G017900 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic002G192800--Sobic006G017700 Sobic002G182701 Sobic002G182701 Sobic002G192800--Sobic002G182701 Sobic001G211700 Sobic001G211700 Sobic002G192800--Sobic001G211700 Sobic004G100300 Sobic004G100300 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Sobic007G081800--Sobic004G046700 Sobic007G081800--Sobic006G224400 Sobic007G081800--Sobic007G167950 Sobic007G081800--Sobic005G087732 Sobic007G081800--Sobic007G110800 Sobic007G081800--Sobic009G060100 Sobic007G081800--Sobic006G017900
Octagon: transcription factors


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