Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G336900.1
Synonym Sb01g032485
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QMJ4
Pfam PF02466
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology K17795; mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G20350 : translocase inner membrane subunit 17-1
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g41330.1 : mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G315600 expressed protein -
2 Sobic.001G474001 - -
3 Sobic.004G200600 - -
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11 Sobic.002G031301 - -
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13 Sobic.004G133800 expressed protein -
14 Sobic.002G108000 myosin, putative, expressed -
15 Sobic.010G201100 expressed protein -
16 Sobic.009G118100 vacuolar calcium binding protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G349800 ubiquitin-like protein SMT3, putative, expressed K12160: SUMO, small ubiquitin-related modifier
18 Sobic.002G069232 - -
19 Sobic.004G338900 P21-Rho-binding domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G027250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G336900 Sobic001G336900 Sobic003G315600 Sobic003G315600 Sobic001G336900--Sobic003G315600 Sobic001G474001 Sobic001G474001 Sobic001G336900--Sobic001G474001 Sobic004G200600 Sobic004G200600 Sobic001G336900--Sobic004G200600 Sobic010G032200 Sobic010G032200 Sobic001G336900--Sobic010G032200 Sobic010G015100 Sobic010G015100 Sobic001G336900--Sobic010G015100 Sobic007G119101 Sobic007G119101 Sobic001G336900--Sobic007G119101 Sobic009G111700 Sobic009G111700 Sobic001G336900--Sobic009G111700 Sobic001G345300 Sobic001G345300 Sobic001G336900--Sobic001G345300 Sobic005G072850 Sobic005G072850 Sobic001G336900--Sobic005G072850 Sobic006G130900 Sobic006G130900 Sobic003G315600--Sobic006G130900 Sobic004G240700 Sobic004G240700 Sobic003G315600--Sobic004G240700 Sobic003G315600--Sobic010G015100 Sobic001G120800 Sobic001G120800 Sobic003G315600--Sobic001G120800 Sobic003G315600--Sobic005G072850 Sobic009G118100 Sobic009G118100 Sobic003G315600--Sobic009G118100 Sobic010G257900 Sobic010G257900 Sobic003G315600--Sobic010G257900 Sobic003G315600--Sobic001G474001 Sobic002G125500 Sobic002G125500 Sobic003G315600--Sobic002G125500 Sobic001G474001--Sobic009G118100 Sobic001G474001--Sobic003G315600 Sobic007G204800 Sobic007G204800 Sobic001G474001--Sobic007G204800 Sobic001G474001--Sobic001G120800 Sobic001G474001--Sobic010G257900 Sobic001G474001--Sobic006G130900 Sobic006G099200 Sobic006G099200 Sobic001G474001--Sobic006G099200 Sobic002G160200 Sobic002G160200 Sobic001G474001--Sobic002G160200 Sobic002G102600 Sobic002G102600 Sobic001G474001--Sobic002G102600 Sobic006G172400 Sobic006G172400 Sobic004G200600--Sobic006G172400 Sobic004G200600--Sobic010G032200 Sobic010G062600 Sobic010G062600 Sobic004G200600--Sobic010G062600 Sobic004G338900 Sobic004G338900 Sobic004G200600--Sobic004G338900 Sobic004G200600--Sobic009G111700 Sobic004G200600--Sobic010G015100 Sobic004G200600--Sobic006G099200 Sobic004G200600--Sobic010G257900 Sobic002G349800 Sobic002G349800 Sobic004G200600--Sobic002G349800 Sobic010G032200--Sobic006G099200 Sobic005G027250 Sobic005G027250 Sobic010G032200--Sobic005G027250 Sobic010G032200--Sobic007G204800 Sobic010G032200--Sobic010G015100 Sobic010G032200--Sobic004G338900 Sobic009G044200 Sobic009G044200 Sobic010G032200--Sobic009G044200 Sobic009G237900 Sobic009G237900 Sobic010G032200--Sobic009G237900 Sobic010G032200--Sobic005G072850 Sobic002G083100 Sobic002G083100 Sobic010G032200--Sobic002G083100 Sobic010G015100--Sobic005G072850 Sobic002G031301 Sobic002G031301 Sobic010G015100--Sobic002G031301 Sobic010G015100--Sobic004G240700 Sobic010G015100--Sobic009G111700 Sobic010G015100--Sobic007G119101 Sobic010G015100--Sobic006G130900 Sobic010G201100 Sobic010G201100 Sobic010G015100--Sobic010G201100 Sobic010G015100--Sobic002G125500 Sobic010G015100--Sobic003G315600 Sobic007G119101--Sobic002G031301 Sobic007G119101--Sobic010G201100 Sobic007G119101--Sobic009G111700 Sobic007G119101--Sobic005G072850 Sobic007G119101--Sobic010G015100 Sobic007G119101--Sobic002G125500 Sobic003G226950 Sobic003G226950 Sobic007G119101--Sobic003G226950 Sobic007G025350 Sobic007G025350 Sobic007G119101--Sobic007G025350 Sobic002G005500 Sobic002G005500 Sobic007G119101--Sobic002G005500 Sobic009G111700--Sobic002G031301 Sobic009G111700--Sobic007G119101 Sobic009G111700--Sobic010G201100 Sobic009G111700--Sobic005G072850 Sobic009G111700--Sobic002G125500 Sobic009G111700--Sobic010G015100 Sobic009G111700--Sobic003G226950 Sobic009G111700--Sobic004G240700 Sobic009G111700--Sobic002G005500 Sobic002G398400 Sobic002G398400 Sobic001G345300--Sobic002G398400 Sobic008G141300 Sobic008G141300 Sobic001G345300--Sobic008G141300 Sobic004G180200 Sobic004G180200 Sobic001G345300--Sobic004G180200 Sobic001G345300--Sobic005G027250 Sobic001G345300--Sobic007G204800 Sobic002G068701 Sobic002G068701 Sobic001G345300--Sobic002G068701 Sobic001G345300--Sobic006G099200 Sobic001G345300--Sobic009G044200 Sobic001G345300--Sobic002G160200 Sobic005G072850--Sobic010G015100 Sobic005G072850--Sobic002G031301 Sobic005G072850--Sobic007G119101 Sobic005G072850--Sobic009G111700 Sobic005G072850--Sobic010G201100 Sobic005G072850--Sobic004G240700 Sobic005G072850--Sobic002G125500 Sobic005G072850--Sobic003G226950 Sobic005G072850--Sobic006G130900
Octagon: transcription factors


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