Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G345300.1
Synonym Sb01g033140
Functional annotation pectinesterase, putative, expressed
UniProt C5WXJ8
Pfam PF04043 PF01095
Panther DB PTHR31707 PTHR31707:SF26
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0004857; enzyme inhibitor activity GO:0005618cell wall


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G26450 : Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g28090.1 : pectinesterase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a057169 , Zm00025a002075 , Zm00025a009587 , Zm00025a052146 , Zm00025a002773
Brachypodium KQK21364
Barley HORVU5Hr1G108340.2
Wheat TraesCS5D02G460500 , TraesCS5B02G458900 , TraesCS5A02G450600
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G345300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.005G001200 - -
20 Sobic.005G125200 OsFBX313 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G345300 Sobic001G345300 Sobic002G398400 Sobic002G398400 Sobic001G345300--Sobic002G398400 Sobic008G141300 Sobic008G141300 Sobic001G345300--Sobic008G141300 Sobic004G180200 Sobic004G180200 Sobic001G345300--Sobic004G180200 Sobic005G027250 Sobic005G027250 Sobic001G345300--Sobic005G027250 Sobic007G204800 Sobic007G204800 Sobic001G345300--Sobic007G204800 Sobic002G068701 Sobic002G068701 Sobic001G345300--Sobic002G068701 Sobic006G099200 Sobic006G099200 Sobic001G345300--Sobic006G099200 Sobic009G044200 Sobic009G044200 Sobic001G345300--Sobic009G044200 Sobic002G160200 Sobic002G160200 Sobic001G345300--Sobic002G160200 Sobic002G398400--Sobic001G345300 Sobic009G118100 Sobic009G118100 Sobic002G398400--Sobic009G118100 Sobic001G474001 Sobic001G474001 Sobic002G398400--Sobic001G474001 Sobic003G315600 Sobic003G315600 Sobic002G398400--Sobic003G315600 Sobic002G398400--Sobic007G204800 Sobic010G070100 Sobic010G070100 Sobic002G398400--Sobic010G070100 Sobic002G398400--Sobic006G099200 Sobic002G398400--Sobic005G027250 Sobic002G398400--Sobic002G160200 Sobic008G141300--Sobic009G044200 Sobic008G141300--Sobic001G345300 Sobic008G141300--Sobic005G027250 Sobic008G141300--Sobic004G180200 Sobic010G142600 Sobic010G142600 Sobic008G141300--Sobic010G142600 Sobic004G338900 Sobic004G338900 Sobic008G141300--Sobic004G338900 Sobic001G152800 Sobic001G152800 Sobic008G141300--Sobic001G152800 Sobic008G141300--Sobic002G160200 Sobic001G160900 Sobic001G160900 Sobic008G141300--Sobic001G160900 Sobic008G138100 Sobic008G138100 Sobic004G180200--Sobic008G138100 Sobic010G016100 Sobic010G016100 Sobic004G180200--Sobic010G016100 Sobic010G140700 Sobic010G140700 Sobic004G180200--Sobic010G140700 Sobic001G445400 Sobic001G445400 Sobic004G180200--Sobic001G445400 Sobic003G322000 Sobic003G322000 Sobic004G180200--Sobic003G322000 Sobic010G063700 Sobic010G063700 Sobic004G180200--Sobic010G063700 Sobic002G237100 Sobic002G237100 Sobic004G180200--Sobic002G237100 Sobic004G180200--Sobic001G152800 Sobic004G163900 Sobic004G163900 Sobic004G180200--Sobic004G163900 Sobic005G027250--Sobic006G099200 Sobic005G027250--Sobic009G044200 Sobic005G027250--Sobic004G338900 Sobic005G027250--Sobic007G204800 Sobic005G027250--Sobic002G160200 Sobic005G027250--Sobic001G160900 Sobic002G083100 Sobic002G083100 Sobic005G027250--Sobic002G083100 Sobic010G032200 Sobic010G032200 Sobic005G027250--Sobic010G032200 Sobic005G125200 Sobic005G125200 Sobic005G027250--Sobic005G125200 Sobic007G204800--Sobic002G160200 Sobic007G204800--Sobic004G338900 Sobic007G204800--Sobic006G099200 Sobic007G204800--Sobic001G160900 Sobic001G120800 Sobic001G120800 Sobic007G204800--Sobic001G120800 Sobic002G102600 Sobic002G102600 Sobic007G204800--Sobic002G102600 Sobic010G257900 Sobic010G257900 Sobic007G204800--Sobic010G257900 Sobic007G204800--Sobic005G027250 Sobic007G204800--Sobic002G083100 Sobic002G068701--Sobic009G044200 Sobic002G068701--Sobic005G027250 Sobic002G068701--Sobic006G099200 Sobic002G068701--Sobic010G032200 Sobic003G403000 Sobic003G403000 Sobic002G068701--Sobic003G403000 Sobic002G068701--Sobic001G345300 Sobic002G068701--Sobic004G338900 Sobic005G067200 Sobic005G067200 Sobic002G068701--Sobic005G067200 Sobic002G068701--Sobic007G204800 Sobic006G099200--Sobic005G027250 Sobic006G099200--Sobic007G204800 Sobic006G099200--Sobic004G338900 Sobic006G099200--Sobic009G044200 Sobic006G099200--Sobic001G160900 Sobic006G099200--Sobic010G032200 Sobic006G099200--Sobic002G160200 Sobic006G099200--Sobic002G083100 Sobic006G099200--Sobic001G120800 Sobic009G044200--Sobic005G027250 Sobic009G044200--Sobic006G099200 Sobic009G044200--Sobic004G338900 Sobic009G044200--Sobic005G125200 Sobic009G044200--Sobic002G160200 Sobic009G044200--Sobic007G204800 Sobic009G044200--Sobic001G160900 Sobic009G044200--Sobic002G083100 Sobic009G044200--Sobic010G032200 Sobic002G160200--Sobic002G102600 Sobic002G160200--Sobic007G204800 Sobic002G160200--Sobic004G338900 Sobic005G098100 Sobic005G098100 Sobic002G160200--Sobic005G098100 Sobic003G400700 Sobic003G400700 Sobic002G160200--Sobic003G400700 Sobic002G160200--Sobic001G160900 Sobic005G001200 Sobic005G001200 Sobic002G160200--Sobic005G001200 Sobic006G037100 Sobic006G037100 Sobic002G160200--Sobic006G037100 Sobic008G129800 Sobic008G129800 Sobic002G160200--Sobic008G129800
Octagon: transcription factors


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